RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W CDC5P32562 705 aa5.05□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YBL029WP38201 376 aa5.05□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W NPR2P39923 615 aa5.05□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W SSL2Q00578 843 aa5.05□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W TRS23Q03784 219 aa5.05□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W TAF11Q04226 346 aa5.05□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W SWT1Q12104 458 aa5.05□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YBR255C-AQ3E776 120 aa5.05□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YPK1P12688 680 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W CNE1P27825 502 aa5.04□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W DEF1P35732 738 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W CBR1P38626 284 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YJL206CP39529 758 aa5.04□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W BUD16P39988 312 aa5.04□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data5.04□□□□□ -1.6not detected
YKR047WYKR047W RPS15Q01855 142 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W ARP9Q05123 467 aa5.04□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W PSK2Q08217 1101 aa5.04□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W LAM4P38800 1345 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W ARG3P05150 338 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YCK1P23291 538 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W TFC3P34111 1160 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W LOT5P34234 306 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W TPA1P40032 644 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W ARG2P40360 574 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W UBP7P40453 1071 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W CIR1P42940 261 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W AAD10P47182 288 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W IMO32P53219 342 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YGR079WP53249 370 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W GTB1Q04924 702 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W ATG23Q06671 453 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W TGS1Q12052 315 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W LYS21Q12122 440 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W NTO1Q12311 748 aa5.03□□□□□ -1.6
YKR047WYKR047W YML003WP0CF16 290 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W RED1P14291 827 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W CKA1P15790 372 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W STE4P18851 423 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W LRE1P25579 583 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W PEP3P27801 918 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W CTS1P29029 562 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W GEX2P36173 615 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W RKM3P38222 552 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W PCL5P38794 229 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W RTS1P38903 757 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W SLZ1P40167 298 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W NDC80P40460 691 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W RMD8P43620 662 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W MRX6P48564 524 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W DSD1P53095 428 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W VPS75P53853 264 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W MUB1Q03162 620 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W RIX7Q07844 837 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YOL073CQ08232 322 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W CIR2Q08822 631 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YOR019WQ99248 730 aa5.02□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W SIP1P32578 815 aa5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W BLI1P35727 113 aa5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W FLC2P39719 783 aa5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W PMT6P42934 759 aa5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W CTR1P49573 406 aa5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W PIL1P53252 339 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W SPC98P53540 846 aa5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YPL071CQ02864 156 aa5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W NGL3Q03210 505 aa5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W CTI6Q08923 506 aa5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W RCN2Q12044 265 aa5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W PRS5Q12265 496 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W MET17P06106 444 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W RFA2P26754 273 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W SRB5P32585 307 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W ELM1P32801 640 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W GMH1P36125 273 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W PIH1P38768 344 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W MTG2P38860 518 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W JHD1P40034 492 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W IME4P41833 600 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W AVT1P47082 602 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W RSC1P53236 928 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YNR061CP53747 219 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W INN1P53901 409 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W YDL073WQ07454 984 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W CRT10Q08226 957 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W NMD4Q12129 218 aa5□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W AAC1P04710 309 aa4.99□□□□□ -1.61
YKR047WYKR047W HOM3P10869 527 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.8 ms