Protein–RNA interactions for Protein: P38840

ARO9, Aromatic amino acid aminotransferase 2, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 513 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARO9	P38840	NSR1	YGR159C	1245 nt		17.54	■□□□□ 0.4
ARO9	P38840	YML009W-B	YML009W-B	477 nt		17.52	■□□□□ 0.4
ARO9	P38840	NOP1	YDL014W	984 nt		17.12	■□□□□ 0.33
ARO9	P38840	MDJ1	YFL016C	1536 nt		15.71	■□□□□ 0.11
ARO9	P38840	YKL036C	YKL036C	393 nt		15.7	■□□□□ 0.1
ARO9	P38840	Q0297	Q0297	156 nt		14.93	□□□□□ -0.02
ARO9	P38840	SRX1	YKL086W	384 nt		14.91	□□□□□ -0.02
ARO9	P38840	YJL027C	YJL027C	417 nt		14.62	□□□□□ -0.07
ARO9	P38840	SCS3	YGL126W	1143 nt		14.19	□□□□□ -0.14
ARO9	P38840	YCR051W	YCR051W	669 nt		14.11	□□□□□ -0.15
ARO9	P38840	DBP2	YNL112W	1641 nt		13.68	□□□□□ -0.22
ARO9	P38840	YBR190W	YBR190W	312 nt		13.58	□□□□□ -0.24
ARO9	P38840	YOL085C	YOL085C	342 nt		13.57	□□□□□ -0.24
ARO9	P38840	TRN1	tP(UGG)A	72 nt		13.47	□□□□□ -0.25
ARO9	P38840	SUF9	tP(UGG)F	72 nt		13.47	□□□□□ -0.25
ARO9	P38840	SUF8	tP(UGG)H	72 nt		13.47	□□□□□ -0.25
ARO9	P38840	tP(UGG)L	tP(UGG)L	72 nt		13.47	□□□□□ -0.25
ARO9	P38840	SUF7	tP(UGG)M	72 nt		13.47	□□□□□ -0.25
ARO9	P38840	tP(UGG)N1	tP(UGG)N1	72 nt		13.47	□□□□□ -0.25
ARO9	P38840	tP(UGG)N2	tP(UGG)N2	72 nt		13.47	□□□□□ -0.25
ARO9	P38840	tP(UGG)O1	tP(UGG)O1	72 nt		13.47	□□□□□ -0.25
ARO9	P38840	SUF11	tP(UGG)O2	72 nt		13.47	□□□□□ -0.25
ARO9	P38840	RPP1B	YDL130W	321 nt		13.39	□□□□□ -0.27
ARO9	P38840	PKP1	YIL042C	1185 nt		13.31	□□□□□ -0.28
ARO9	P38840	CCC1	YLR220W	969 nt		13.31	□□□□□ -0.28
ARO9	P38840	SSA3	YBL075C	1950 nt		13.28	□□□□□ -0.28
ARO9	P38840	RTC3	YHR087W	336 nt		13.23	□□□□□ -0.29
ARO9	P38840	RVS167	YDR388W	1449 nt		12.98	□□□□□ -0.33
ARO9	P38840	SCJ1	YMR214W	1134 nt		12.76	□□□□□ -0.37
ARO9	P38840	tP(UGG)O3	tP(UGG)O3	72 nt		12.75	□□□□□ -0.37
ARO9	P38840	PET122	YER153C	765 nt		12.74	□□□□□ -0.37
ARO9	P38840	PUT4	YOR348C	1884 nt		12.72	□□□□□ -0.37
ARO9	P38840	ATS1	YAL020C	1002 nt		12.71	□□□□□ -0.37
ARO9	P38840	SCR1	SCR1	522 nt		12.68	□□□□□ -0.38
ARO9	P38840	SHR5	YOL110W	714 nt		12.49	□□□□□ -0.41
ARO9	P38840	RRN5	YLR141W	1092 nt		12.38	□□□□□ -0.43
ARO9	P38840	YDJ1	YNL064C	1230 nt		12.37	□□□□□ -0.43
ARO9	P38840	ARE1	YCR048W	1833 nt		12.32	□□□□□ -0.44
ARO9	P38840	POA1	YBR022W	534 nt		12.28	□□□□□ -0.44
ARO9	P38840	URN1	YPR152C	1398 nt		12.18	□□□□□ -0.46
ARO9	P38840	YHR049C-A	YHR049C-A	297 nt		12.17	□□□□□ -0.46
ARO9	P38840	SAH1	YER043C	1350 nt		12.17	□□□□□ -0.46
ARO9	P38840	YER088W-B	YER088W-B	147 nt		12.14	□□□□□ -0.47
ARO9	P38840	OPI9	YLR338W	858 nt		12.13	□□□□□ -0.47
ARO9	P38840	BSC6	YOL137W	1494 nt		12.13	□□□□□ -0.47
ARO9	P38840	RSB1	YOR049C	1065 nt		12.12	□□□□□ -0.47
ARO9	P38840	DEP1	YAL013W	1218 nt		12.06	□□□□□ -0.48
ARO9	P38840	GAR1	YHR089C	618 nt		12.03	□□□□□ -0.48
ARO9	P38840	RPN10	YHR200W	807 nt		12.03	□□□□□ -0.48
ARO9	P38840	YNL208W	YNL208W	600 nt		11.97	□□□□□ -0.49
ARO9	P38840	SPT5	YML010W	3192 nt		11.95	□□□□□ -0.5
ARO9	P38840	Q0182	Q0182	405 nt		11.91	□□□□□ -0.5
ARO9	P38840	BUD23	YCR047C	828 nt		11.85	□□□□□ -0.51
ARO9	P38840	SSA4	YER103W	1929 nt		11.83	□□□□□ -0.52
ARO9	P38840	PST2	YDR032C	597 nt		11.78	□□□□□ -0.52
ARO9	P38840	PUN1	YLR414C	792 nt		11.78	□□□□□ -0.52
ARO9	P38840	PTC2	YER089C	1395 nt		11.71	□□□□□ -0.53
ARO9	P38840	TIR1	YER011W	765 nt		11.66	□□□□□ -0.54
ARO9	P38840	NAB2	YGL122C	1578 nt		11.65	□□□□□ -0.54
ARO9	P38840	YJR018W	YJR018W	363 nt		11.59	□□□□□ -0.55
ARO9	P38840	MOT3	YMR070W	1473 nt		11.57	□□□□□ -0.56
ARO9	P38840	SSA1	YAL005C	1929 nt		11.47	□□□□□ -0.57
ARO9	P38840	MEP2	YNL142W	1500 nt		11.45	□□□□□ -0.58
ARO9	P38840	BDF1	YLR399C	2061 nt		11.42	□□□□□ -0.58
ARO9	P38840	RPP2B	YDR382W	333 nt		11.4	□□□□□ -0.58
ARO9	P38840	FIS1	YIL065C	468 nt		11.4	□□□□□ -0.58
ARO9	P38840	DAL1	YIR027C	1383 nt		11.39	□□□□□ -0.59
ARO9	P38840	FPR4	YLR449W	1179 nt		11.33	□□□□□ -0.6
ARO9	P38840	YJR120W	YJR120W	351 nt		11.31	□□□□□ -0.6
ARO9	P38840	YKL097C	YKL097C	411 nt		11.31	□□□□□ -0.6
ARO9	P38840	TAT1	YBR069C	1860 nt		11.27	□□□□□ -0.6
ARO9	P38840	INM2	YDR287W	879 nt		11.27	□□□□□ -0.61
ARO9	P38840	PHO4	YFR034C	939 nt		11.27	□□□□□ -0.61
ARO9	P38840	SHU1	YHL006C	453 nt		11.27	□□□□□ -0.61
ARO9	P38840	YPS1	YLR120C	1710 nt		11.24	□□□□□ -0.61
ARO9	P38840	DCW1	YKL046C	1350 nt		11.23	□□□□□ -0.61
ARO9	P38840	SRB2	YHR041C	633 nt		11.2	□□□□□ -0.62
ARO9	P38840	YHR165W-A	YHR165W-A	312 nt		11.16	□□□□□ -0.62
ARO9	P38840	BDH2	YAL061W	1254 nt		11.12	□□□□□ -0.63
ARO9	P38840	YGR021W	YGR021W	873 nt		11.11	□□□□□ -0.63
ARO9	P38840	YMR090W	YMR090W	684 nt		11.1	□□□□□ -0.63
ARO9	P38840	YDR095C	YDR095C	411 nt		11.09	□□□□□ -0.63
ARO9	P38840	WWM1	YFL010C	636 nt		11.09	□□□□□ -0.63
ARO9	P38840	EMI2	YDR516C	1503 nt		11.09	□□□□□ -0.63
ARO9	P38840	YAL037C-B	YAL037C-B	975 nt		11.08	□□□□□ -0.64
ARO9	P38840	YBL100C	YBL100C	315 nt		11.07	□□□□□ -0.64
ARO9	P38840	YBR220C	YBR220C	1683 nt		11.07	□□□□□ -0.64
ARO9	P38840	LSM3	YLR438C-A	270 nt		11.02	□□□□□ -0.65
ARO9	P38840	HOM6	YJR139C	1080 nt		11.01	□□□□□ -0.65
ARO9	P38840	YFL021C-A	YFL021C-A	855 nt		10.99	□□□□□ -0.65
ARO9	P38840	YDL221W	YDL221W	552 nt		10.97	□□□□□ -0.65
ARO9	P38840	PAC11	YDR488C	1602 nt		10.97	□□□□□ -0.65
ARO9	P38840	TRM9	YML014W	840 nt		10.94	□□□□□ -0.66
ARO9	P38840	SDH1	YKL148C	1923 nt		10.94	□□□□□ -0.66
ARO9	P38840	FUN26	YAL022C	1554 nt		10.93	□□□□□ -0.66
ARO9	P38840	CAC2	YML102W	1407 nt		10.9	□□□□□ -0.66
ARO9	P38840	PTP1	YDL230W	1008 nt		10.89	□□□□□ -0.67
ARO9	P38840	RPP2A	YOL039W	321 nt		10.89	□□□□□ -0.67
ARO9	P38840	MNP1	YGL068W	585 nt		10.88	□□□□□ -0.67
ARO9	P38840	ALF1	YNL148C	765 nt		10.87	□□□□□ -0.67

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