RNA–Protein interactions for RNA: YGR030C

POP6, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP6, Length 477 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP6	YGR030C	TPK1	P06244	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
POP6	YGR030C	APD1	P38281	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	UME6	P39001	836 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	CIR1	P42940	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	UBX6	P47049	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	YGR079W	P53249	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	YNL058C	P53947	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	STP3	Q05937	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	COX1	P00401	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	ORC2	P32833	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	IFA38	P38286	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	ERC1	P38767	581 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	NPA3	P47122	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	GTB1	Q04924	702 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	GSY2	P27472	705 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	SAE2	P46946	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	YML131W	Q03102	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	ORM2	Q06144	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	NUP1	P20676	1076 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	LAC1	P28496	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	COG1	P53079	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	ATP23	P53722	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	YAT1	P80235	687 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP6	YGR030C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	SPO16	P17122	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	SLC1	P33333	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	BUD16	P39988	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	CTF18	P49956	741 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	COQ11	Q05892	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	THI7	Q05998	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	BSP1	Q06604	576 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	ATG23	Q06671	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	IRC3	Q06683	689 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	SWT1	Q12104	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	PCD1	Q12524	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	CNS1	P33313	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	PTC6	P25646	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	HES1	P35843	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	DJP1	P40564	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	ASE1	P50275	885 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	VID22	Q05934	901 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TPO3	Q06451	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TRM8	Q12009	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	APN1	P22936	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	SSH4	P32343	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	FTH1	P38310	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	BNA1	P47096	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TFC6	Q06339	672 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	RAD34	Q06665	692 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	SSP2	Q08646	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TMA16	Q08687	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	BAG7	Q12128	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	YLR302C	O13544	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	TOP1	P04786	769 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POP6	YGR030C	RIC1	P40395	1056 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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