Protein–RNA interactions for Protein: P38281

APD1, Actin patches distal protein 1, yeastyeast

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APD1P38281 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.35■□□□□ 0.53
APD1P38281 NSR1YGR159C 1245 nt18.28■□□□□ 0.52
APD1P38281 NOP1YDL014W 984 nt18■□□□□ 0.47
APD1P38281 YKL036CYKL036C 393 nt16.67■□□□□ 0.26
APD1P38281 MDJ1YFL016C 1536 nt15.99■□□□□ 0.15
APD1P38281 Q0297Q0297 156 nt15.8■□□□□ 0.12
APD1P38281 SRX1YKL086W 384 nt15.72■□□□□ 0.11
APD1P38281 YJL027CYJL027C 417 nt15.53■□□□□ 0.08
APD1P38281 SCS3YGL126W 1143 nt15.18■□□□□ 0.02
APD1P38281 YCR051WYCR051W 669 nt14.82□□□□□ -0.04
APD1P38281 SSA3YBL075C 1950 nt14.66□□□□□ -0.06
APD1P38281 YOL085CYOL085C 342 nt14.41□□□□□ -0.1
APD1P38281 DBP2YNL112W 1641 nt14.26□□□□□ -0.13
APD1P38281 RPP1BYDL130W 321 nt14.15□□□□□ -0.14
APD1P38281 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.13□□□□□ -0.15
APD1P38281 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.13□□□□□ -0.15
APD1P38281 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.13□□□□□ -0.15
APD1P38281 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.13□□□□□ -0.15
APD1P38281 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.13□□□□□ -0.15
APD1P38281 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.13□□□□□ -0.15
APD1P38281 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.13□□□□□ -0.15
APD1P38281 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.13□□□□□ -0.15
APD1P38281 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.13□□□□□ -0.15
APD1P38281 PKP1YIL042C 1185 nt14.07□□□□□ -0.16
APD1P38281 CCC1YLR220W 969 nt13.87□□□□□ -0.19
APD1P38281 SCJ1YMR214W 1134 nt13.73□□□□□ -0.21
APD1P38281 YBR190WYBR190W 312 nt13.73□□□□□ -0.21
APD1P38281 ATS1YAL020C 1002 nt13.63□□□□□ -0.23
APD1P38281 RVS167YDR388W 1449 nt13.46□□□□□ -0.26
APD1P38281 PET122YER153C 765 nt13.44□□□□□ -0.26
APD1P38281 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.39□□□□□ -0.27
APD1P38281 SCR1SCR1 522 nt13.39□□□□□ -0.27
APD1P38281 RTC3YHR087W 336 nt13.34□□□□□ -0.27
APD1P38281 RRN5YLR141W 1092 nt13.07□□□□□ -0.32
APD1P38281 YDJ1YNL064C 1230 nt13.02□□□□□ -0.33
APD1P38281 SHR5YOL110W 714 nt13.02□□□□□ -0.33
APD1P38281 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.82□□□□□ -0.36
APD1P38281 RSB1YOR049C 1065 nt12.8□□□□□ -0.36
APD1P38281 PST2YDR032C 597 nt12.63□□□□□ -0.39
APD1P38281 GAR1YHR089C 618 nt12.58□□□□□ -0.4
APD1P38281 NVJ2YPR091C 2313 nt12.54□□□□□ -0.4
APD1P38281 URN1YPR152C 1398 nt12.54□□□□□ -0.4
APD1P38281 PUT4YOR348C 1884 nt12.52□□□□□ -0.41
APD1P38281 PAC11YDR488C 1602 nt12.51□□□□□ -0.41
APD1P38281 DEP1YAL013W 1218 nt12.47□□□□□ -0.41
APD1P38281 FPS1YLL043W 2010 nt12.45□□□□□ -0.42
APD1P38281 RPN10YHR200W 807 nt12.45□□□□□ -0.42
APD1P38281 YNL208WYNL208W 600 nt12.42□□□□□ -0.42
APD1P38281 OPI9YLR338W 858 nt12.4□□□□□ -0.42
APD1P38281 ARE1YCR048W 1833 nt12.27□□□□□ -0.45
APD1P38281 SSA4YER103W 1929 nt12.25□□□□□ -0.45
APD1P38281 SAH1YER043C 1350 nt12.23□□□□□ -0.45
APD1P38281 TIR1YER011W 765 nt12.21□□□□□ -0.45
APD1P38281 SSA1YAL005C 1929 nt12.19□□□□□ -0.46
APD1P38281 YKL097CYKL097C 411 nt12.15□□□□□ -0.46
APD1P38281 POA1YBR022W 534 nt12.09□□□□□ -0.47
APD1P38281 SPT5YML010W 3192 nt12.05□□□□□ -0.48
APD1P38281 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.05□□□□□ -0.48
APD1P38281 PUN1YLR414C 792 nt12.05□□□□□ -0.48
APD1P38281 SHU1YHL006C 453 nt12.03□□□□□ -0.48
APD1P38281 BDF1YLR399C 2061 nt12.02□□□□□ -0.49
APD1P38281 YJR018WYJR018W 363 nt11.99□□□□□ -0.49
APD1P38281 BSC6YOL137W 1494 nt11.83□□□□□ -0.52
APD1P38281 YJR120WYJR120W 351 nt11.81□□□□□ -0.52
APD1P38281 PTC2YER089C 1395 nt11.8□□□□□ -0.52
APD1P38281 RPP2BYDR382W 333 nt11.8□□□□□ -0.52
APD1P38281 TAT1YBR069C 1860 nt11.79□□□□□ -0.52
APD1P38281 BUD23YCR047C 828 nt11.79□□□□□ -0.52
APD1P38281 SRB2YHR041C 633 nt11.77□□□□□ -0.53
APD1P38281 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.74□□□□□ -0.53
APD1P38281 YGR021WYGR021W 873 nt11.71□□□□□ -0.53
APD1P38281 NAB2YGL122C 1578 nt11.71□□□□□ -0.54
APD1P38281 WWM1YFL010C 636 nt11.64□□□□□ -0.55
APD1P38281 HOM6YJR139C 1080 nt11.63□□□□□ -0.55
APD1P38281 YOR139CYOR139C 393 nt11.63□□□□□ -0.55
APD1P38281 INM2YDR287W 879 nt11.61□□□□□ -0.55
APD1P38281 BDH2YAL061W 1254 nt11.6□□□□□ -0.55
APD1P38281 UME6YDR207C 2511 nt11.59□□□□□ -0.55
APD1P38281 DAL1YIR027C 1383 nt11.55□□□□□ -0.56
APD1P38281 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.55□□□□□ -0.56
APD1P38281 FIS1YIL065C 468 nt11.54□□□□□ -0.56
APD1P38281 LSM3YLR438C-A 270 nt11.52□□□□□ -0.57
APD1P38281 NPL3YDR432W 1245 nt11.51□□□□□ -0.57
APD1P38281 MNP1YGL068W 585 nt11.5□□□□□ -0.57
APD1P38281 YOL037CYOL037C 354 nt11.49□□□□□ -0.57
APD1P38281 RKM5YLR137W 1104 nt11.46□□□□□ -0.57
APD1P38281 FPR4YLR449W 1179 nt11.46□□□□□ -0.57
APD1P38281 YBL100CYBL100C 315 nt11.45□□□□□ -0.58
APD1P38281 PHO4YFR034C 939 nt11.41□□□□□ -0.58
APD1P38281 TRM9YML014W 840 nt11.34□□□□□ -0.59
APD1P38281 FUN26YAL022C 1554 nt11.32□□□□□ -0.6
APD1P38281 CCT6YDR188W 1641 nt11.26□□□□□ -0.61
APD1P38281 YPS1YLR120C 1710 nt11.22□□□□□ -0.61
APD1P38281 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.2□□□□□ -0.62
APD1P38281 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.2□□□□□ -0.62
APD1P38281 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.2□□□□□ -0.62
APD1P38281 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.2□□□□□ -0.62
APD1P38281 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.2□□□□□ -0.62
APD1P38281 YLR281CYLR281C 468 nt11.18□□□□□ -0.62
APD1P38281 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.16□□□□□ -0.62
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