Protein–RNA interactions for Protein: Q12524

PCD1, Peroxisomal coenzyme A diphosphatase 1, peroxisomal, yeastyeast

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PCD1Q12524 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.25■■□□□ 1.15
PCD1Q12524 NSR1YGR159C 1245 nt21.82■■□□□ 1.08
PCD1Q12524 NOP1YDL014W 984 nt21.76■■□□□ 1.07
PCD1Q12524 YKL036CYKL036C 393 nt20.37■□□□□ 0.85
PCD1Q12524 Q0297Q0297 156 nt19.13■□□□□ 0.65
PCD1Q12524 YJL027CYJL027C 417 nt19.08■□□□□ 0.64
PCD1Q12524 MDJ1YFL016C 1536 nt19.07■□□□□ 0.64
PCD1Q12524 SRX1YKL086W 384 nt19■□□□□ 0.63
PCD1Q12524 SCS3YGL126W 1143 nt18.68■□□□□ 0.58
PCD1Q12524 YCR051WYCR051W 669 nt18.07■□□□□ 0.48
PCD1Q12524 YOL085CYOL085C 342 nt17.62■□□□□ 0.41
PCD1Q12524 PKP1YIL042C 1185 nt17.33■□□□□ 0.36
PCD1Q12524 RPP1BYDL130W 321 nt17.17■□□□□ 0.34
PCD1Q12524 DBP2YNL112W 1641 nt16.97■□□□□ 0.31
PCD1Q12524 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.97■□□□□ 0.31
PCD1Q12524 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.97■□□□□ 0.31
PCD1Q12524 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.97■□□□□ 0.31
PCD1Q12524 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.97■□□□□ 0.31
PCD1Q12524 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.97■□□□□ 0.31
PCD1Q12524 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.97■□□□□ 0.31
PCD1Q12524 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.97■□□□□ 0.31
PCD1Q12524 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.97■□□□□ 0.31
PCD1Q12524 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.97■□□□□ 0.31
PCD1Q12524 SCJ1YMR214W 1134 nt16.95■□□□□ 0.3
PCD1Q12524 CCC1YLR220W 969 nt16.85■□□□□ 0.29
PCD1Q12524 ATS1YAL020C 1002 nt16.81■□□□□ 0.28
PCD1Q12524 PET122YER153C 765 nt16.36■□□□□ 0.21
PCD1Q12524 SCR1SCR1 522 nt16.3■□□□□ 0.2
PCD1Q12524 YBR190WYBR190W 312 nt16.2■□□□□ 0.18
PCD1Q12524 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.18■□□□□ 0.18
PCD1Q12524 RVS167YDR388W 1449 nt16.08■□□□□ 0.16
PCD1Q12524 RRN5YLR141W 1092 nt15.94■□□□□ 0.14
PCD1Q12524 RTC3YHR087W 336 nt15.89■□□□□ 0.13
PCD1Q12524 RSB1YOR049C 1065 nt15.71■□□□□ 0.11
PCD1Q12524 YDJ1YNL064C 1230 nt15.64■□□□□ 0.09
PCD1Q12524 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.62■□□□□ 0.09
PCD1Q12524 SHR5YOL110W 714 nt15.58■□□□□ 0.08
PCD1Q12524 PST2YDR032C 597 nt15.5■□□□□ 0.07
PCD1Q12524 GAR1YHR089C 618 nt15.26■□□□□ 0.03
PCD1Q12524 YKL097CYKL097C 411 nt15.07■□□□□ 0
PCD1Q12524 DEP1YAL013W 1218 nt15.05■□□□□ -0
PCD1Q12524 URN1YPR152C 1398 nt14.95□□□□□ -0.02
PCD1Q12524 YNL208WYNL208W 600 nt14.84□□□□□ -0.03
PCD1Q12524 RPN10YHR200W 807 nt14.82□□□□□ -0.04
PCD1Q12524 SHU1YHL006C 453 nt14.8□□□□□ -0.04
PCD1Q12524 TIR1YER011W 765 nt14.73□□□□□ -0.05
PCD1Q12524 PUT4YOR348C 1884 nt14.68□□□□□ -0.06
PCD1Q12524 OPI9YLR338W 858 nt14.65□□□□□ -0.06
PCD1Q12524 SAH1YER043C 1350 nt14.53□□□□□ -0.08
PCD1Q12524 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.49□□□□□ -0.09
PCD1Q12524 SSA1YAL005C 1929 nt14.47□□□□□ -0.09
PCD1Q12524 ARE1YCR048W 1833 nt14.42□□□□□ -0.1
PCD1Q12524 YOR139CYOR139C 393 nt14.39□□□□□ -0.11
PCD1Q12524 YJR018WYJR018W 363 nt14.29□□□□□ -0.12
PCD1Q12524 POA1YBR022W 534 nt14.28□□□□□ -0.12
PCD1Q12524 SRB2YHR041C 633 nt14.27□□□□□ -0.13
PCD1Q12524 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.27□□□□□ -0.13
PCD1Q12524 PUN1YLR414C 792 nt14.25□□□□□ -0.13
PCD1Q12524 NPL3YDR432W 1245 nt14.23□□□□□ -0.13
PCD1Q12524 YGR021WYGR021W 873 nt14.15□□□□□ -0.14
PCD1Q12524 WWM1YFL010C 636 nt14.13□□□□□ -0.15
PCD1Q12524 HOM6YJR139C 1080 nt14.11□□□□□ -0.15
PCD1Q12524 RPP2BYDR382W 333 nt14.1□□□□□ -0.15
PCD1Q12524 MNP1YGL068W 585 nt14.09□□□□□ -0.15
PCD1Q12524 YJR120WYJR120W 351 nt14.09□□□□□ -0.15
PCD1Q12524 PTC2YER089C 1395 nt14.03□□□□□ -0.16
PCD1Q12524 BUD23YCR047C 828 nt13.98□□□□□ -0.17
PCD1Q12524 YOL037CYOL037C 354 nt13.98□□□□□ -0.17
PCD1Q12524 BSC6YOL137W 1494 nt13.95□□□□□ -0.18
PCD1Q12524 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.9□□□□□ -0.18
PCD1Q12524 RKM5YLR137W 1104 nt13.9□□□□□ -0.18
PCD1Q12524 BDH2YAL061W 1254 nt13.85□□□□□ -0.19
PCD1Q12524 NAB2YGL122C 1578 nt13.83□□□□□ -0.19
PCD1Q12524 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.81□□□□□ -0.2
PCD1Q12524 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.81□□□□□ -0.2
PCD1Q12524 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.81□□□□□ -0.2
PCD1Q12524 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.81□□□□□ -0.2
PCD1Q12524 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.81□□□□□ -0.2
PCD1Q12524 SSA3YBL075C 1950 nt13.78□□□□□ -0.2
PCD1Q12524 INM2YDR287W 879 nt13.74□□□□□ -0.21
PCD1Q12524 LSM3YLR438C-A 270 nt13.74□□□□□ -0.21
PCD1Q12524 FPR4YLR449W 1179 nt13.68□□□□□ -0.22
PCD1Q12524 DAL1YIR027C 1383 nt13.67□□□□□ -0.22
PCD1Q12524 YBL100CYBL100C 315 nt13.66□□□□□ -0.22
PCD1Q12524 PUS2YGL063W 1113 nt13.63□□□□□ -0.23
PCD1Q12524 YLR281CYLR281C 468 nt13.63□□□□□ -0.23
PCD1Q12524 FIS1YIL065C 468 nt13.61□□□□□ -0.23
PCD1Q12524 TRM9YML014W 840 nt13.56□□□□□ -0.24
PCD1Q12524 WHI5YOR083W 888 nt13.55□□□□□ -0.24
PCD1Q12524 PHO4YFR034C 939 nt13.53□□□□□ -0.24
PCD1Q12524 FUN26YAL022C 1554 nt13.5□□□□□ -0.25
PCD1Q12524 MOT3YMR070W 1473 nt13.41□□□□□ -0.26
PCD1Q12524 CCT6YDR188W 1641 nt13.37□□□□□ -0.27
PCD1Q12524 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.31□□□□□ -0.28
PCD1Q12524 DSK2YMR276W 1122 nt13.3□□□□□ -0.28
PCD1Q12524 FMP45YDL222C 930 nt13.28□□□□□ -0.28
PCD1Q12524 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.26□□□□□ -0.29
PCD1Q12524 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.26□□□□□ -0.29
PCD1Q12524 ALF1YNL148C 765 nt13.26□□□□□ -0.29
PCD1Q12524 YPR011CYPR011C 981 nt13.26□□□□□ -0.29
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