Protein–RNA interactions for Protein: P22936

APN1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APN1P22936 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.1■□□□□ 0.65
APN1P22936 NSR1YGR159C 1245 nt18.98■□□□□ 0.63
APN1P22936 NOP1YDL014W 984 nt18.62■□□□□ 0.57
APN1P22936 YKL036CYKL036C 393 nt17.21■□□□□ 0.35
APN1P22936 MDJ1YFL016C 1536 nt16.76■□□□□ 0.27
APN1P22936 Q0297Q0297 156 nt16.3■□□□□ 0.2
APN1P22936 SRX1YKL086W 384 nt16.26■□□□□ 0.19
APN1P22936 YJL027CYJL027C 417 nt16.06■□□□□ 0.16
APN1P22936 SCS3YGL126W 1143 nt15.65■□□□□ 0.1
APN1P22936 YCR051WYCR051W 669 nt15.42■□□□□ 0.06
APN1P22936 YOL085CYOL085C 342 nt14.9□□□□□ -0.02
APN1P22936 DBP2YNL112W 1641 nt14.86□□□□□ -0.03
APN1P22936 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.66□□□□□ -0.06
APN1P22936 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.66□□□□□ -0.06
APN1P22936 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.66□□□□□ -0.06
APN1P22936 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.66□□□□□ -0.06
APN1P22936 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.66□□□□□ -0.06
APN1P22936 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.66□□□□□ -0.06
APN1P22936 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.66□□□□□ -0.06
APN1P22936 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.66□□□□□ -0.06
APN1P22936 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.66□□□□□ -0.06
APN1P22936 PKP1YIL042C 1185 nt14.65□□□□□ -0.06
APN1P22936 RPP1BYDL130W 321 nt14.62□□□□□ -0.07
APN1P22936 CCC1YLR220W 969 nt14.52□□□□□ -0.09
APN1P22936 YBR190WYBR190W 312 nt14.37□□□□□ -0.11
APN1P22936 RTC3YHR087W 336 nt14.04□□□□□ -0.16
APN1P22936 ATS1YAL020C 1002 nt14.03□□□□□ -0.16
APN1P22936 RVS167YDR388W 1449 nt14□□□□□ -0.17
APN1P22936 PET122YER153C 765 nt13.95□□□□□ -0.18
APN1P22936 SCJ1YMR214W 1134 nt13.95□□□□□ -0.18
APN1P22936 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.9□□□□□ -0.18
APN1P22936 SCR1SCR1 522 nt13.84□□□□□ -0.19
APN1P22936 SSA3YBL075C 1950 nt13.74□□□□□ -0.21
APN1P22936 RRN5YLR141W 1092 nt13.58□□□□□ -0.24
APN1P22936 SHR5YOL110W 714 nt13.52□□□□□ -0.25
APN1P22936 YDJ1YNL064C 1230 nt13.45□□□□□ -0.26
APN1P22936 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.3□□□□□ -0.28
APN1P22936 RSB1YOR049C 1065 nt13.3□□□□□ -0.28
APN1P22936 PUT4YOR348C 1884 nt13.2□□□□□ -0.3
APN1P22936 GAR1YHR089C 618 nt13.13□□□□□ -0.31
APN1P22936 URN1YPR152C 1398 nt13.12□□□□□ -0.31
APN1P22936 DEP1YAL013W 1218 nt13.12□□□□□ -0.31
APN1P22936 PST2YDR032C 597 nt13□□□□□ -0.33
APN1P22936 RPN10YHR200W 807 nt12.94□□□□□ -0.34
APN1P22936 YNL208WYNL208W 600 nt12.93□□□□□ -0.34
APN1P22936 OPI9YLR338W 858 nt12.92□□□□□ -0.34
APN1P22936 ARE1YCR048W 1833 nt12.88□□□□□ -0.35
APN1P22936 SAH1YER043C 1350 nt12.87□□□□□ -0.35
APN1P22936 SSA1YAL005C 1929 nt12.81□□□□□ -0.36
APN1P22936 POA1YBR022W 534 nt12.77□□□□□ -0.37
APN1P22936 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.74□□□□□ -0.37
APN1P22936 TIR1YER011W 765 nt12.69□□□□□ -0.38
APN1P22936 PUN1YLR414C 792 nt12.56□□□□□ -0.4
APN1P22936 BSC6YOL137W 1494 nt12.54□□□□□ -0.4
APN1P22936 YJR018WYJR018W 363 nt12.53□□□□□ -0.4
APN1P22936 FPS1YLL043W 2010 nt12.51□□□□□ -0.41
APN1P22936 YKL097CYKL097C 411 nt12.49□□□□□ -0.41
APN1P22936 BUD23YCR047C 828 nt12.44□□□□□ -0.42
APN1P22936 SHU1YHL006C 453 nt12.44□□□□□ -0.42
APN1P22936 PTC2YER089C 1395 nt12.42□□□□□ -0.42
APN1P22936 Q0182Q0182 405 nt12.38□□□□□ -0.43
APN1P22936 NAB2YGL122C 1578 nt12.3□□□□□ -0.44
APN1P22936 YJR120WYJR120W 351 nt12.3□□□□□ -0.44
APN1P22936 RPP2BYDR382W 333 nt12.29□□□□□ -0.44
APN1P22936 SRB2YHR041C 633 nt12.29□□□□□ -0.44
APN1P22936 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.25□□□□□ -0.45
APN1P22936 NVJ2YPR091C 2313 nt12.21□□□□□ -0.46
APN1P22936 WWM1YFL010C 636 nt12.14□□□□□ -0.47
APN1P22936 INM2YDR287W 879 nt12.1□□□□□ -0.47
APN1P22936 DAL1YIR027C 1383 nt12.09□□□□□ -0.47
APN1P22936 YGR021WYGR021W 873 nt12.09□□□□□ -0.47
APN1P22936 SPT5YML010W 3192 nt12.08□□□□□ -0.48
APN1P22936 FIS1YIL065C 468 nt12.07□□□□□ -0.48
APN1P22936 FPR4YLR449W 1179 nt12.06□□□□□ -0.48
APN1P22936 BDH2YAL061W 1254 nt12.05□□□□□ -0.48
APN1P22936 HOM6YJR139C 1080 nt12.03□□□□□ -0.48
APN1P22936 PAC11YDR488C 1602 nt12.01□□□□□ -0.49
APN1P22936 PHO4YFR034C 939 nt11.97□□□□□ -0.49
APN1P22936 YOR139CYOR139C 393 nt11.97□□□□□ -0.49
APN1P22936 MNP1YGL068W 585 nt11.96□□□□□ -0.49
APN1P22936 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.95□□□□□ -0.5
APN1P22936 YBL100CYBL100C 315 nt11.95□□□□□ -0.5
APN1P22936 LSM3YLR438C-A 270 nt11.92□□□□□ -0.5
APN1P22936 NPL3YDR432W 1245 nt11.88□□□□□ -0.51
APN1P22936 RKM5YLR137W 1104 nt11.85□□□□□ -0.51
APN1P22936 TRM9YML014W 840 nt11.83□□□□□ -0.52
APN1P22936 FUN26YAL022C 1554 nt11.82□□□□□ -0.52
APN1P22936 YPS1YLR120C 1710 nt11.81□□□□□ -0.52
APN1P22936 MEP2YNL142W 1500 nt11.81□□□□□ -0.52
APN1P22936 YOL037CYOL037C 354 nt11.8□□□□□ -0.52
APN1P22936 SSA4YER103W 1929 nt11.79□□□□□ -0.52
APN1P22936 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.72□□□□□ -0.53
APN1P22936 YDR095CYDR095C 411 nt11.71□□□□□ -0.53
APN1P22936 CCT6YDR188W 1641 nt11.68□□□□□ -0.54
APN1P22936 ALF1YNL148C 765 nt11.65□□□□□ -0.54
APN1P22936 DCW1YKL046C 1350 nt11.59□□□□□ -0.55
APN1P22936 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.59□□□□□ -0.55
APN1P22936 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.59□□□□□ -0.55
APN1P22936 YLR281CYLR281C 468 nt11.54□□□□□ -0.56
APN1P22936 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms