RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	JHD1	P40034	492 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SPO22	P40511	975 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YJL163C	P46996	555 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	NMA2	P53204	395 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	NGL3	Q03210	505 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	PSK2	Q08217	1101 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	TCO89	Q08921	799 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	CTI6	Q08923	506 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YPL216W	Q08964	1102 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MLH3	Q12083	715 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YOR019W	Q99248	730 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SOD2	P00447	233 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	CBS1	P14066	229 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.85	□□□□□ -1.95	not detected
YMR31	YFR049W	ERG4	P25340	473 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	OCA4	P25366	362 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RPC53	P25441	422 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	APL3	P38065	1025 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RKM3	P38222	552 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	REG2	P38232	338 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	FLC2	P39719	783 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	AFG3	P39925	761 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SLZ1	P40167	298 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	AXL1	P40851	1208 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	THI6	P41835	540 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	LCL3	P53153	274 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YGR151C	P53287	111 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MUB1	Q03162	620 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RCF1	Q03713	159 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	CIR2	Q08822	631 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	NMD4	Q12129	218 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SFI1	Q12369	946 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	TRM13	Q12383	476 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ISA2	Q12425	185 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RTN2	Q12443	393 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	VCX1	Q99385	411 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	PDX1	P16451	410 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	PDE1	P22434	369 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ROX1	P25042	368 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	CDC15	P27636	974 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ERG3	P32353	365 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SIP1	P32578	815 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	NPL6	P32832	435 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SRO77	P38163	1010 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SDH8	P38345	138 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MTG2	P38860	518 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	FMP52	P40008	231 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	DOT5	P40553	215 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	IME4	P41833	600 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	AAD10	P47182	288 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	GLO1	P50107	326 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YIP4	P53093	235 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RIM8	P53179	542 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	IMO32	P53219	342 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YGR079W	P53249	370 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	FHN1	P53279	174 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	TRS23	Q03784	219 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	UFO1	Q04511	668 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	SKG3	Q06315	1026 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	AIM39	Q08223	395 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YLR358C	O13565	187 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YBR085C-A	O43137	85 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ALG7	P07286	448 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	ORC2	P32833	620 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	CCL1	P37366	393 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	MUM2	P38236	366 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	SUL1	P38359	859 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YJL206C	P39529	758 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	UBX6	P47049	396 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YML6	P51998	286 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	BUD17	P53727	317 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	INN1	P53901	409 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	RNT1	Q02555	471 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	UBP16	Q02863	499 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	YML037C	Q03703	340 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YMR31	YFR049W	TGS1	Q12052	315 aa		2.83	□□□□□ -1.96

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