Protein–RNA interactions for Protein: O43137

YBR085C-A, Uncharacterized protein YBR085C-A, yeastyeast

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBR085C-AO43137 NSR1YGR159C 1245 nt16.68■□□□□ 0.26
YBR085C-AO43137 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.05■□□□□ 0.16
YBR085C-AO43137 MDJ1YFL016C 1536 nt15.53■□□□□ 0.08
YBR085C-AO43137 NOP1YDL014W 984 nt15.3■□□□□ 0.04
YBR085C-AO43137 YJL027CYJL027C 417 nt14.27□□□□□ -0.13
YBR085C-AO43137 SSA3YBL075C 1950 nt14□□□□□ -0.17
YBR085C-AO43137 YBR190WYBR190W 312 nt13.48□□□□□ -0.25
YBR085C-AO43137 DBP2YNL112W 1641 nt13.42□□□□□ -0.26
YBR085C-AO43137 YKL036CYKL036C 393 nt13.35□□□□□ -0.27
YBR085C-AO43137 SRX1YKL086W 384 nt13.35□□□□□ -0.27
YBR085C-AO43137 RTC3YHR087W 336 nt13.12□□□□□ -0.31
YBR085C-AO43137 Q0297Q0297 156 nt13.12□□□□□ -0.31
YBR085C-AO43137 PUT4YOR348C 1884 nt12.85□□□□□ -0.35
YBR085C-AO43137 YCR051WYCR051W 669 nt12.59□□□□□ -0.39
YBR085C-AO43137 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YBR085C-AO43137 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YBR085C-AO43137 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YBR085C-AO43137 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YBR085C-AO43137 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YBR085C-AO43137 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YBR085C-AO43137 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YBR085C-AO43137 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YBR085C-AO43137 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.55□□□□□ -0.4
YBR085C-AO43137 RVS167YDR388W 1449 nt12.46□□□□□ -0.41
YBR085C-AO43137 CCC1YLR220W 969 nt12.4□□□□□ -0.42
YBR085C-AO43137 POA1YBR022W 534 nt12.38□□□□□ -0.43
YBR085C-AO43137 ARE1YCR048W 1833 nt12.36□□□□□ -0.43
YBR085C-AO43137 SPT5YML010W 3192 nt12.31□□□□□ -0.44
YBR085C-AO43137 SSA4YER103W 1929 nt12.27□□□□□ -0.44
YBR085C-AO43137 BSC6YOL137W 1494 nt12.27□□□□□ -0.45
YBR085C-AO43137 Q0182Q0182 405 nt12.22□□□□□ -0.45
YBR085C-AO43137 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.21□□□□□ -0.45
YBR085C-AO43137 SCJ1YMR214W 1134 nt12.2□□□□□ -0.46
YBR085C-AO43137 SAH1YER043C 1350 nt12.1□□□□□ -0.47
YBR085C-AO43137 OPI9YLR338W 858 nt11.99□□□□□ -0.49
YBR085C-AO43137 URN1YPR152C 1398 nt11.99□□□□□ -0.49
YBR085C-AO43137 BDF1YLR399C 2061 nt11.89□□□□□ -0.51
YBR085C-AO43137 BUD23YCR047C 828 nt11.85□□□□□ -0.51
YBR085C-AO43137 SHR5YOL110W 714 nt11.83□□□□□ -0.52
YBR085C-AO43137 RPP1BYDL130W 321 nt11.77□□□□□ -0.53
YBR085C-AO43137 DEP1YAL013W 1218 nt11.74□□□□□ -0.53
YBR085C-AO43137 SCS3YGL126W 1143 nt11.72□□□□□ -0.53
YBR085C-AO43137 TAT1YBR069C 1860 nt11.72□□□□□ -0.53
YBR085C-AO43137 PAC11YDR488C 1602 nt11.67□□□□□ -0.54
YBR085C-AO43137 MOT3YMR070W 1473 nt11.66□□□□□ -0.54
YBR085C-AO43137 RPN10YHR200W 807 nt11.64□□□□□ -0.55
YBR085C-AO43137 PUN1YLR414C 792 nt11.64□□□□□ -0.55
YBR085C-AO43137 PTC2YER089C 1395 nt11.63□□□□□ -0.55
YBR085C-AO43137 MEP2YNL142W 1500 nt11.6□□□□□ -0.55
YBR085C-AO43137 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.6□□□□□ -0.55
YBR085C-AO43137 YOL085CYOL085C 342 nt11.6□□□□□ -0.55
YBR085C-AO43137 NAB2YGL122C 1578 nt11.59□□□□□ -0.55
YBR085C-AO43137 YNL208WYNL208W 600 nt11.5□□□□□ -0.57
YBR085C-AO43137 PKP1YIL042C 1185 nt11.49□□□□□ -0.57
YBR085C-AO43137 YJR018WYJR018W 363 nt11.39□□□□□ -0.59
YBR085C-AO43137 DCW1YKL046C 1350 nt11.39□□□□□ -0.59
YBR085C-AO43137 NVJ2YPR091C 2313 nt11.35□□□□□ -0.59
YBR085C-AO43137 FIS1YIL065C 468 nt11.34□□□□□ -0.59
YBR085C-AO43137 PET122YER153C 765 nt11.33□□□□□ -0.6
YBR085C-AO43137 YBR220CYBR220C 1683 nt11.3□□□□□ -0.6
YBR085C-AO43137 DAL1YIR027C 1383 nt11.28□□□□□ -0.6
YBR085C-AO43137 YDJ1YNL064C 1230 nt11.25□□□□□ -0.61
YBR085C-AO43137 YPS1YLR120C 1710 nt11.24□□□□□ -0.61
YBR085C-AO43137 YMR090WYMR090W 684 nt11.24□□□□□ -0.61
YBR085C-AO43137 EMI2YDR516C 1503 nt11.23□□□□□ -0.61
YBR085C-AO43137 FPR4YLR449W 1179 nt11.22□□□□□ -0.61
YBR085C-AO43137 PHO4YFR034C 939 nt11.17□□□□□ -0.62
YBR085C-AO43137 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.17□□□□□ -0.62
YBR085C-AO43137 INM2YDR287W 879 nt11.1□□□□□ -0.63
YBR085C-AO43137 GAR1YHR089C 618 nt11.1□□□□□ -0.63
YBR085C-AO43137 SDH1YKL148C 1923 nt11.09□□□□□ -0.63
YBR085C-AO43137 PCH2YBR186W 1695 nt11.09□□□□□ -0.63
YBR085C-AO43137 YDL221WYDL221W 552 nt11.07□□□□□ -0.64
YBR085C-AO43137 GUT2YIL155C 1950 nt11.06□□□□□ -0.64
YBR085C-AO43137 YDR095CYDR095C 411 nt11.05□□□□□ -0.64
YBR085C-AO43137 SEC11YIR022W 504 nt11.03□□□□□ -0.64
YBR085C-AO43137 YJR120WYJR120W 351 nt11.03□□□□□ -0.64
YBR085C-AO43137 SCR1SCR1 522 nt11.01□□□□□ -0.65
YBR085C-AO43137 RPP2BYDR382W 333 nt10.95□□□□□ -0.66
YBR085C-AO43137 CAC2YML102W 1407 nt10.93□□□□□ -0.66
YBR085C-AO43137 RRN5YLR141W 1092 nt10.92□□□□□ -0.66
YBR085C-AO43137 SCC4YER147C 1875 nt10.91□□□□□ -0.66
YBR085C-AO43137 PTP1YDL230W 1008 nt10.88□□□□□ -0.67
YBR085C-AO43137 PIB2YGL023C 1908 nt10.86□□□□□ -0.67
YBR085C-AO43137 YBL100CYBL100C 315 nt10.85□□□□□ -0.67
YBR085C-AO43137 RPP2AYOL039W 321 nt10.84□□□□□ -0.67
YBR085C-AO43137 SSA1YAL005C 1929 nt10.8□□□□□ -0.68
YBR085C-AO43137 IRC15YPL017C 1500 nt10.78□□□□□ -0.68
YBR085C-AO43137 TIR1YER011W 765 nt10.77□□□□□ -0.69
YBR085C-AO43137 RTF1YGL244W 1677 nt10.74□□□□□ -0.69
YBR085C-AO43137 YSC84YHR016C 1407 nt10.74□□□□□ -0.69
YBR085C-AO43137 GIS3YLR094C 1509 nt10.73□□□□□ -0.69
YBR085C-AO43137 ALF1YNL148C 765 nt10.72□□□□□ -0.69
YBR085C-AO43137 FPS1YLL043W 2010 nt10.7□□□□□ -0.7
YBR085C-AO43137 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.7□□□□□ -0.7
YBR085C-AO43137 FUN26YAL022C 1554 nt10.69□□□□□ -0.7
YBR085C-AO43137 YHL050CYHL050C 2094 nt10.66□□□□□ -0.7
YBR085C-AO43137 YJL225CYJL225C 5277 nt10.65□□□□□ -0.7
YBR085C-AO43137 BOP3YNL042W 1191 nt10.62□□□□□ -0.71
YBR085C-AO43137 BDH2YAL061W 1254 nt10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms