RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000183317.7

Ptprv-210, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprv, Length 6,108 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprv-210ENSMUST00000183317 CnfnQ6PCW6 111 aa10.53□□□□□ -0.72
Ptprv-210ENSMUST00000183317 EnhoQ8K1D8 76 aa10.53□□□□□ -0.72
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Shisa2Q8QZV2 295 aa10.53□□□□□ -0.72
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ighv10-3A0A075B5T6 119 aa10.53□□□□□ -0.72
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ighv8-5A0A0A6YY60 119 aa10.53□□□□□ -0.72
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Igkv8-30A0A140T8M3 121 aa10.53□□□□□ -0.72
Ptprv-210ENSMUST00000183317 P01823 113 aa10.53□□□□□ -0.72
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ube2d1P61080 147 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Abca1P41233 2261 aa10.52□□□□□ -0.72
Ptprv-210ENSMUST00000183317 P01755 137 aa10.52□□□□□ -0.72
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ighv1-62-1A0A075B5U3 116 aa10.52□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm9767G3X930 207 aa10.52□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 P06320 134 aa10.52□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 P06329 120 aa10.52□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ighv1-72P01751 139 aa10.52□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm9922Q8C3P1 144 aa10.52□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 LhbO09108 141 aa10.51□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Pla2g1bQ9Z0Y2 146 aa10.51□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Cd27P41272 250 aa10.51□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm12057A0A087WR21 115 aa10.5□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm10509O88255 85 aa10.5□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Polr2kQ63871 58 aa10.5□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Igkv1-110A0A0B4J1I0 119 aa10.5□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ncoa6Q9JL19 2067 aa10.5□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm16223Q8CBM3 117 aa10.5□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 4930564D02RikQ9D4S4 103 aa10.5□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Usf3B2RUQ2 2221 aa10.49□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ube2d3P61079 147 aa10.49□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ube2d2P62838 147 aa10.49□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Col6a6Q8C6K9 2265 aa10.49□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm11011D3Z3L9 86 aa10.49□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm10577Q3UDV9 132 aa10.48□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Smim1P0C8K7 78 aa10.48□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Psmb11Q8BG41 302 aa10.48□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gpha2Q925Q5 128 aa10.47□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Atox1O08997 68 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 BaalcQ8VHV1 145 aa10.47□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 B430305J03RikQ8BQQ8 176 aa10.46□□□□□ -0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Adamts20P59511 1906 aa10.46□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Rpl28P41105 137 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 CadB2RQC6 2225 aa10.46□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 CrygeQ03740 174 aa10.45□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Cdc42se2Q8BGH7 84 aa10.45□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ighv2-9-1A0A075B697 116 aa10.45□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Wfdc12Q9JHY3 85 aa10.45□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Pou2af1Q64693 256 aa10.45□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Trbv13-2A0A140T8N6 113 aa10.44□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 A930009A15RikG3UYI6 118 aa10.44□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Sox16Q62247 57 aa10.44□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 A0A286YCN5 57 aa10.44□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Igkv3-12A0A140T8P0 119 aa10.44□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 1700011M02RikB1AX35 88 aa10.43□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 H2al1bA0A087WP11 105 aa10.42□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm21748Q3UE70 102 aa10.42□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 F5O88783 2183 aa10.42□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Defb40Q70KL2 73 aa10.42□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 4930535I16RikQ9CUI2 172 aa10.42□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ncor1Q60974 2453 aa10.42□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Pcnx3Q8VI59 2028 aa10.42□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Defb10Q8R2I8 73 aa10.41□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 D730001G18RikA0A087WQU7 115 aa10.41□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 SvipQ3UZP4 77 aa10.41□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Cacna1gQ5SUF7 2381 aa10.41□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Krtap27-1E9PX37 202 aa10.41□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Wdr38Q9D994 303 aa10.41□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 DscamQ9ERC8 2013 aa10.41□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 H2al1aQ5M8Q2 105 aa10.4□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 H2al1eQ810S6 105 aa10.4□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 4930556J24RikQ9D4U7 146 aa10.4□□□□□ -0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Jmjd1cQ69ZK6 2350 aa10.4□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm1968Q3T9I3 115 aa10.4□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ndufb1P0DN34 57 aa10.39□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 ScxQ64124 207 aa10.39□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm9573F7C950 1606 aa10.39□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Prpf8Q99PV0 2335 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Sptan1P16546 2472 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm3443F7CCV5 94 aa10.38□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm28539A0A087WSL9 92 aa10.38□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Trav14-1A0A0G2JF94 121 aa10.38□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Cd164l2Q9D6W7 172 aa10.38□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Qrich2A0A140LIY9 2337 aa10.38□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ncor2Q9WU42 2472 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 A0A286YE49 62 aa10.37□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 B230217C12RikE9Q3Z1 139 aa10.37□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Col6a4A2AX52 2309 aa10.37□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ighv8-13A0A075B5Y0 101 aa10.36□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm5464Q3UY29 175 aa10.36□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Serp2Q6TAW2 65 aa10.36□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 CenpeQ6RT24 2474 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 P84750 121 aa10.35□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm26566Q8CAC1 153 aa10.35□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Vpreb1P13372 142 aa10.34□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Wfdc13Q5DQQ6 81 aa10.34□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ighv8-11A0A075B5X4 119 aa10.34□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Prr9Q8BV84 116 aa10.34□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 BtcQ05928 177 aa10.34□□□□□ -0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ndufs5Q99LY9 106 aa10.33□□□□□ -0.76
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Igkv8-28A0A0G2JE47 121 aa10.33□□□□□ -0.76
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Apoc4Q61268 124 aa10.33□□□□□ -0.76
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm17509Q9CZ61 145 aa10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 95.3 ms