RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000183317.7

Ptprv-210, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprv, Length 6,108 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Rhox8Q6VSS7 320 aa25.46■■□□□ 1.67
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa23.12■■□□□ 1.29
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Cngb1E1AZ71 1325 aa22.54■■□□□ 1.2
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa22.53■■□□□ 1.2
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
Ptprv-210ENSMUST00000183317 NischQ80TM9 1593 aa22.23■■□□□ 1.15
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Wdr66E9Q743 1299 aa22.23■■□□□ 1.15
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ube2uB1AUC4 352 aa22.21■■□□□ 1.15
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Trim41Q5NCC3 630 aa22.2■■□□□ 1.14
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Zeb1Q64318 1117 aa22.18■■□□□ 1.14
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Npm2Q80W85 207 aa22.12■■□□□ 1.13
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gab3Q8BSM5 595 aa22.1■■□□□ 1.13
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Myt1lP97500 1187 aa21.83■■□□□ 1.09
Ptprv-210ENSMUST00000183317 NefmP08553 848 aa21.33■■□□□ 1.01
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ccdc180J3QNE4 1664 aa21.32■■□□□ 1
Ptprv-210ENSMUST00000183317 UbtfP25976 765 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Stra8P70278 393 aa21.22■□□□□ 0.99
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Rtl1Q7M732 1744 aa21.2■□□□□ 0.98
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Il27Q8K3I6 234 aa21.09■□□□□ 0.97
Ptprv-210ENSMUST00000183317 CenpbP27790 599 aa21.08■□□□□ 0.96
Ptprv-210ENSMUST00000183317 HrcG5E8J6 738 aa21.02■□□□□ 0.96
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Slc24a1Q91WD8 1130 aa20.98■□□□□ 0.95
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Abcc9P70170 1546 aa20.82■□□□□ 0.92
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Amer1Q7TS75 1132 aa20.81■□□□□ 0.92
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa20.77■□□□□ 0.92
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
Ptprv-210ENSMUST00000183317 NrdcQ8BHG1 1161 aa20.65■□□□□ 0.9
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa20.64■□□□□ 0.89
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Neurod1Q60867 357 aa20.6■□□□□ 0.89
Ptprv-210ENSMUST00000183317 NclP09405 707 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Os9Q8K2C7 672 aa20.6■□□□□ 0.89
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Tnnt3Q9QZ47 272 aa20.51■□□□□ 0.87
Ptprv-210ENSMUST00000183317 NeflP08551 543 aa20.49■□□□□ 0.87
Ptprv-210ENSMUST00000183317 TonslQ6NZL6 1363 aa20.39■□□□□ 0.85
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Pcgf6Q99NA9 353 aa20.34■□□□□ 0.85
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Ptprv-210ENSMUST00000183317 4933416C03RikQ3V063 378 aa20.24■□□□□ 0.83
Ptprv-210ENSMUST00000183317 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa20.18■□□□□ 0.82
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa20.18■□□□□ 0.82
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa20.17■□□□□ 0.82
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Mier1Q5UAK0 511 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Lmod2Q3UHZ5 550 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Abcc8B2RUS7 1588 aa20.1■□□□□ 0.81
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa20.09■□□□□ 0.81
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Myt1Q8CFC2 1127 aa20.09■□□□□ 0.81
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm13697A2AK42 830 aa20.05■□□□□ 0.8
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa20.01■□□□□ 0.79
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa19.93■□□□□ 0.78
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Rtl5Q5DTT4 599 aa19.92■□□□□ 0.78
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa19.89■□□□□ 0.77
Ptprv-210ENSMUST00000183317 ClspnQ80YR7 1315 aa19.86■□□□□ 0.77
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Erich6D3Z6S9 713 aa19.86■□□□□ 0.77
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Nlrp6Q91WS2 869 aa19.84■□□□□ 0.77
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Atp1b4Q99ME6 356 aa19.83■□□□□ 0.77
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Chic1Q8CBW7 227 aa19.8■□□□□ 0.76
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Zbtb4Q5F293 982 aa19.74■□□□□ 0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Clip1Q922J3 1391 aa19.73■□□□□ 0.75
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Gm13695A2AK44 830 aa19.69■□□□□ 0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa19.67■□□□□ 0.74
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Cep164Q5DU05 1446 aa19.64■□□□□ 0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Anp32aO35381 247 aa19.64■□□□□ 0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ccer2J3QPU5 274 aa19.62■□□□□ 0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ubl4bQ9CQ84 188 aa19.6■□□□□ 0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Polr3glQ8R0C0 218 aa19.59■□□□□ 0.73
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa19.58■□□□□ 0.72
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Eid3Q3V124 375 aa19.53■□□□□ 0.72
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Dcaf1Q80TR8 1506 aa19.51■□□□□ 0.71
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa19.5■□□□□ 0.71
Ptprv-210ENSMUST00000183317 DaxxO35613 739 aa19.43■□□□□ 0.7
Ptprv-210ENSMUST00000183317 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Plppr3Q7TPB0 716 aa19.38■□□□□ 0.69
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Clstn2Q9ER65 966 aa19.37■□□□□ 0.69
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Chic2Q9D9G3 165 aa19.34■□□□□ 0.69
Ptprv-210ENSMUST00000183317 BlmO88700 1416 aa19.33■□□□□ 0.68
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
Ptprv-210ENSMUST00000183317 NacadQ5SWP3 1504 aa19.3■□□□□ 0.68
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Sall2Q9QX96 1004 aa19.27■□□□□ 0.68
Ptprv-210ENSMUST00000183317 ArxO35085 564 aa19.26■□□□□ 0.67
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Csrnp3P59055 597 aa19.25■□□□□ 0.67
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Setd5Q5XJV7 1441 aa19.19■□□□□ 0.66
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Anks4bQ8K3X6 423 aa19.19■□□□□ 0.66
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Calr4Q3TQS0 420 aa19.17■□□□□ 0.66
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Ercc6F8VPZ5 1481 aa19.15■□□□□ 0.66
Ptprv-210ENSMUST00000183317 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 114 ms