RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OtorQ9JIE3 128 aa9.59□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam240bJ3QMB3 78 aa9.59□□□□□ -0.87
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Try10Q792Z1 246 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv4-90A0A075B5L3 117 aa9.58□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sap30O88574 220 aa9.58□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il22ra1Q80XZ4 581 aa9.58□□□□□ -0.88
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Odf3Q920N1 254 aa9.56□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A730046J19RikA0A1B0GSN8 89 aa9.56□□□□□ -0.88
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxc2Q61850 494 aa9.55□□□□□ -0.88
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5464Q3UY29 175 aa9.54□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap32Q811P8 2089 aa9.54□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcrg-V6A0A075B5Y8 134 aa9.54□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav8-1A0A075B641 109 aa9.54□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17430F6RSK3 157 aa9.54□□□□□ -0.88
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cox11Q6P8I6 275 aa9.54□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpx7Q99LJ6 186 aa9.54□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcte2E9PY37 120 aa9.54□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01727 129 aa9.54□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P18527 97 aa9.54□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shisa9Q9CZN4 424 aa9.54□□□□□ -0.88
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crip3Q6Q6R3 243 aa9.53□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mapk1ip1lQ8BH93 242 aa9.53□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rs1Q9Z1L4 224 aa9.53□□□□□ -0.88
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav7-2Q5R1I3 112 aa9.53□□□□□ -0.88
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atxn7l1Q9CZ05 146 aa9.53□□□□□ -0.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav6-4A0A075B6B4 115 aa9.52□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01741 114 aa9.52□□□□□ -0.89
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CnfnQ6PCW6 111 aa9.52□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srsf12Q8C8K3 266 aa9.52□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gkn1Q9CR36 201 aa9.52□□□□□ -0.89
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-23A0A0A6YVW3 117 aa9.52□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmg4P0C7N9 123 aa9.52□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcf24V9GWT9 166 aa9.52□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defa37K9J724 93 aa9.51□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Socs3O35718 225 aa9.51□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-62-3P01754 117 aa9.51□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defa5P28312 93 aa9.51□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hint1P70349 126 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slamf6Q9ET39 351 aa9.51□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snai3Q9QY31 287 aa9.51□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-80A0A075B5Y3 117 aa9.51□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv4-59A0A0B4J1I8 117 aa9.51□□□□□ -0.89
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AW146154Q3TPQ7 468 aa9.51□□□□□ -0.89
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spink13Q3UTS8 97 aa9.51□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspe1Q64433 102 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 3110018I06RikQ9CXS0 120 aa9.51□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm26938S4R185 226 aa9.51□□□□□ -0.89
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Iglc1A0A0G2JE99 106 aa9.5□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ly86O88188 162 aa9.5□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01843 105 aa9.5□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defa24Q5G865 93 aa9.5□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfrsf23Q9ER63 176 aa9.5□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem238lA0A1B0GS74 79 aa9.5□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HilpdaQ9JLS0 64 aa9.5□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv4-57-1A0A075B5M4 119 aa9.49□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Brd3osA0A1B0GRB6 84 aa9.49□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q4KKZ1 196 aa9.49□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prr3Q811B5 190 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A130051J06RikQ8CAU1 227 aa9.49□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm14137Q8CE97 175 aa9.49□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itpr2Q9Z329 2701 aa9.49□□□□□ -0.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PolP10400 120 aa9.49□□□□□ -0.89
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