Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
P01741 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
P01741 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
P01741 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P01741 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
P01741 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01741 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
P01741 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
P01741 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01741 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01741 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01741 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01741 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01741 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
P01741 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01741 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01741 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
P01741 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01741 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01741 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01741 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01741 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01741 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
P01741 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01741 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01741 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01741 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01741 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01741 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
P01741 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
P01741 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01741 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01741 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01741 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01741 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01741 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01741 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01741 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01741 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01741 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01741 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01741 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22■■□□□ 1.11
P01741 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01741 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01741 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01741 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01741 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01741 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01741 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01741 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01741 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01741 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
P01741 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01741 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01741 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01741 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01741 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01741 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01741 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01741 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01741 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01741 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01741 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
P01741 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01741 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01741 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01741 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
P01741 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01741 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01741 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01741 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01741 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01741 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01741 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01741 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01741 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01741 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01741 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01741 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
P01741 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01741 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01741 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
P01741 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
P01741 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01741 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01741 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01741 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01741 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
P01741 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P01741 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
P01741 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P01741 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
P01741 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
P01741 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
P01741 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
P01741 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
P01741 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
P01741 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
P01741 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
P01741 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms