Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P18527 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P18527 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P18527 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
P18527 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P18527 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
P18527 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P18527 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P18527 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P18527 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P18527 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P18527 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P18527 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P18527 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P18527 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P18527 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P18527 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P18527 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P18527 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P18527 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18527 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P18527 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P18527 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P18527 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P18527 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P18527 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P18527 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P18527 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
P18527 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
P18527 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P18527 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
P18527 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
P18527 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
P18527 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
P18527 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
P18527 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
P18527 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
P18527 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P18527 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P18527 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
P18527 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P18527 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
P18527 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P18527 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P18527 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P18527 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P18527 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P18527 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
P18527 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P18527 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P18527 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18527 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18527 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P18527 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P18527 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P18527 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P18527 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P18527 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
P18527 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P18527 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P18527 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P18527 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18527 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18527 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P18527 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P18527 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P18527 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P18527 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P18527 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
P18527 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
P18527 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P18527 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P18527 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P18527 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
P18527 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P18527 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
P18527 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
P18527 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
P18527 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
P18527 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
P18527 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
P18527 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
P18527 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
P18527 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
P18527 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
P18527 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
P18527 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
P18527 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P18527 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P18527 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P18527 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P18527 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P18527 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P18527 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P18527 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P18527 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P18527 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
P18527 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
P18527 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
P18527 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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