Protein–RNA interactions for Protein: V9GWY9

Obox8, Oocyte-specific homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox8V9GWY9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Obox8V9GWY9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Obox8V9GWY9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Obox8V9GWY9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Obox8V9GWY9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Obox8V9GWY9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Obox8V9GWY9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Obox8V9GWY9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Obox8V9GWY9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Obox8V9GWY9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Obox8V9GWY9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Obox8V9GWY9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Obox8V9GWY9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Obox8V9GWY9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Obox8V9GWY9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Obox8V9GWY9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Obox8V9GWY9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Obox8V9GWY9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Obox8V9GWY9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Obox8V9GWY9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Obox8V9GWY9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Obox8V9GWY9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Obox8V9GWY9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Obox8V9GWY9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Obox8V9GWY9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Obox8V9GWY9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Obox8V9GWY9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Obox8V9GWY9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Obox8V9GWY9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Obox8V9GWY9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Obox8V9GWY9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Obox8V9GWY9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Obox8V9GWY9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Obox8V9GWY9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Obox8V9GWY9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Obox8V9GWY9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Obox8V9GWY9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Obox8V9GWY9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Obox8V9GWY9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Obox8V9GWY9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Obox8V9GWY9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Obox8V9GWY9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Obox8V9GWY9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Obox8V9GWY9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Obox8V9GWY9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Obox8V9GWY9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obox8V9GWY9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obox8V9GWY9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Obox8V9GWY9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Obox8V9GWY9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Obox8V9GWY9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Obox8V9GWY9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Obox8V9GWY9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Obox8V9GWY9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Obox8V9GWY9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Obox8V9GWY9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Obox8V9GWY9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Obox8V9GWY9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Obox8V9GWY9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Obox8V9GWY9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Obox8V9GWY9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Obox8V9GWY9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Obox8V9GWY9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Obox8V9GWY9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Obox8V9GWY9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Obox8V9GWY9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Obox8V9GWY9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Obox8V9GWY9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Obox8V9GWY9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Obox8V9GWY9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Obox8V9GWY9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Obox8V9GWY9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Obox8V9GWY9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Obox8V9GWY9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Obox8V9GWY9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Obox8V9GWY9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Obox8V9GWY9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Obox8V9GWY9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Obox8V9GWY9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Obox8V9GWY9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Obox8V9GWY9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Obox8V9GWY9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Obox8V9GWY9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Obox8V9GWY9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Obox8V9GWY9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Obox8V9GWY9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Obox8V9GWY9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Obox8V9GWY9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Obox8V9GWY9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Obox8V9GWY9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Obox8V9GWY9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Obox8V9GWY9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Obox8V9GWY9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Obox8V9GWY9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Obox8V9GWY9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Obox8V9GWY9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Obox8V9GWY9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Obox8V9GWY9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Obox8V9GWY9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Obox8V9GWY9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms