Protein–RNA interactions for Protein: Q5G865

Defa24, Alpha-defensin 24, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa24Q5G865 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Defa24Q5G865 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Defa24Q5G865 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Defa24Q5G865 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Defa24Q5G865 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa24Q5G865 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa24Q5G865 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Defa24Q5G865 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Defa24Q5G865 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Defa24Q5G865 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defa24Q5G865 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Defa24Q5G865 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa24Q5G865 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa24Q5G865 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Defa24Q5G865 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Defa24Q5G865 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Defa24Q5G865 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Defa24Q5G865 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Defa24Q5G865 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Defa24Q5G865 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Defa24Q5G865 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Defa24Q5G865 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Defa24Q5G865 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Defa24Q5G865 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Defa24Q5G865 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Defa24Q5G865 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Defa24Q5G865 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Defa24Q5G865 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Defa24Q5G865 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Defa24Q5G865 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Defa24Q5G865 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Defa24Q5G865 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa24Q5G865 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa24Q5G865 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Defa24Q5G865 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Defa24Q5G865 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Defa24Q5G865 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Defa24Q5G865 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Defa24Q5G865 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa24Q5G865 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Defa24Q5G865 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Defa24Q5G865 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa24Q5G865 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Defa24Q5G865 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa24Q5G865 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa24Q5G865 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa24Q5G865 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defa24Q5G865 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa24Q5G865 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa24Q5G865 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa24Q5G865 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa24Q5G865 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa24Q5G865 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Defa24Q5G865 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defa24Q5G865 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa24Q5G865 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa24Q5G865 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa24Q5G865 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defa24Q5G865 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa24Q5G865 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa24Q5G865 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa24Q5G865 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defa24Q5G865 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa24Q5G865 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa24Q5G865 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa24Q5G865 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Defa24Q5G865 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Defa24Q5G865 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa24Q5G865 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Defa24Q5G865 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Defa24Q5G865 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Defa24Q5G865 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Defa24Q5G865 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Defa24Q5G865 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Defa24Q5G865 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Defa24Q5G865 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Defa24Q5G865 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Defa24Q5G865 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Defa24Q5G865 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Defa24Q5G865 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Defa24Q5G865 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Defa24Q5G865 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Defa24Q5G865 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Defa24Q5G865 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Defa24Q5G865 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Defa24Q5G865 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Defa24Q5G865 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Defa24Q5G865 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Defa24Q5G865 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Defa24Q5G865 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Defa24Q5G865 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Defa24Q5G865 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Defa24Q5G865 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Defa24Q5G865 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Defa24Q5G865 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Defa24Q5G865 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Defa24Q5G865 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Defa24Q5G865 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa24Q5G865 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa24Q5G865 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms