Protein–RNA interactions for Protein: D3Z338

Tmem262, MCG19858, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem262D3Z338 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmem262D3Z338 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmem262D3Z338 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmem262D3Z338 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmem262D3Z338 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem262D3Z338 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem262D3Z338 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem262D3Z338 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem262D3Z338 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem262D3Z338 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem262D3Z338 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem262D3Z338 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem262D3Z338 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem262D3Z338 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem262D3Z338 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem262D3Z338 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem262D3Z338 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem262D3Z338 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem262D3Z338 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem262D3Z338 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem262D3Z338 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem262D3Z338 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem262D3Z338 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem262D3Z338 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem262D3Z338 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem262D3Z338 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem262D3Z338 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem262D3Z338 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem262D3Z338 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem262D3Z338 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem262D3Z338 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem262D3Z338 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem262D3Z338 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem262D3Z338 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem262D3Z338 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem262D3Z338 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem262D3Z338 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem262D3Z338 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem262D3Z338 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem262D3Z338 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem262D3Z338 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem262D3Z338 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem262D3Z338 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem262D3Z338 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem262D3Z338 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem262D3Z338 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem262D3Z338 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem262D3Z338 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem262D3Z338 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem262D3Z338 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem262D3Z338 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem262D3Z338 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem262D3Z338 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem262D3Z338 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem262D3Z338 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem262D3Z338 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem262D3Z338 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem262D3Z338 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem262D3Z338 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem262D3Z338 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem262D3Z338 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem262D3Z338 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem262D3Z338 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem262D3Z338 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem262D3Z338 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem262D3Z338 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem262D3Z338 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem262D3Z338 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem262D3Z338 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem262D3Z338 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem262D3Z338 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem262D3Z338 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem262D3Z338 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem262D3Z338 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem262D3Z338 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem262D3Z338 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem262D3Z338 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem262D3Z338 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem262D3Z338 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem262D3Z338 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem262D3Z338 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem262D3Z338 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem262D3Z338 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem262D3Z338 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem262D3Z338 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem262D3Z338 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem262D3Z338 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem262D3Z338 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem262D3Z338 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem262D3Z338 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem262D3Z338 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem262D3Z338 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem262D3Z338 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem262D3Z338 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem262D3Z338 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem262D3Z338 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem262D3Z338 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem262D3Z338 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem262D3Z338 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem262D3Z338 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms