Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Y3

Ighv1-80, Immunoglobulin heavy variable 1-80 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ighv1-80A0A075B5Y3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ighv1-80A0A075B5Y3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ighv1-80A0A075B5Y3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ighv1-80A0A075B5Y3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ighv1-80A0A075B5Y3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ighv1-80A0A075B5Y3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ighv1-80A0A075B5Y3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ighv1-80A0A075B5Y3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ighv1-80A0A075B5Y3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighv1-80A0A075B5Y3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ighv1-80A0A075B5Y3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ighv1-80A0A075B5Y3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighv1-80A0A075B5Y3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ighv1-80A0A075B5Y3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ighv1-80A0A075B5Y3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighv1-80A0A075B5Y3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ighv1-80A0A075B5Y3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighv1-80A0A075B5Y3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighv1-80A0A075B5Y3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighv1-80A0A075B5Y3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ighv1-80A0A075B5Y3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighv1-80A0A075B5Y3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ighv1-80A0A075B5Y3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ighv1-80A0A075B5Y3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ighv1-80A0A075B5Y3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ighv1-80A0A075B5Y3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ighv1-80A0A075B5Y3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighv1-80A0A075B5Y3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ighv1-80A0A075B5Y3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighv1-80A0A075B5Y3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighv1-80A0A075B5Y3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ighv1-80A0A075B5Y3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ighv1-80A0A075B5Y3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ighv1-80A0A075B5Y3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ighv1-80A0A075B5Y3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ighv1-80A0A075B5Y3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ighv1-80A0A075B5Y3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ighv1-80A0A075B5Y3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ighv1-80A0A075B5Y3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ighv1-80A0A075B5Y3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ighv1-80A0A075B5Y3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ighv1-80A0A075B5Y3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ighv1-80A0A075B5Y3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ighv1-80A0A075B5Y3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ighv1-80A0A075B5Y3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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