Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC0

Ccl24, C-C motif chemokine 24, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl24Q9JKC0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccl24Q9JKC0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccl24Q9JKC0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccl24Q9JKC0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccl24Q9JKC0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccl24Q9JKC0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccl24Q9JKC0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccl24Q9JKC0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccl24Q9JKC0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccl24Q9JKC0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccl24Q9JKC0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccl24Q9JKC0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccl24Q9JKC0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccl24Q9JKC0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccl24Q9JKC0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccl24Q9JKC0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccl24Q9JKC0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccl24Q9JKC0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccl24Q9JKC0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccl24Q9JKC0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccl24Q9JKC0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccl24Q9JKC0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccl24Q9JKC0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccl24Q9JKC0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccl24Q9JKC0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccl24Q9JKC0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccl24Q9JKC0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccl24Q9JKC0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl24Q9JKC0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccl24Q9JKC0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccl24Q9JKC0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccl24Q9JKC0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccl24Q9JKC0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccl24Q9JKC0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccl24Q9JKC0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccl24Q9JKC0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccl24Q9JKC0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccl24Q9JKC0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccl24Q9JKC0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccl24Q9JKC0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccl24Q9JKC0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccl24Q9JKC0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccl24Q9JKC0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccl24Q9JKC0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccl24Q9JKC0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccl24Q9JKC0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccl24Q9JKC0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccl24Q9JKC0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccl24Q9JKC0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccl24Q9JKC0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccl24Q9JKC0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccl24Q9JKC0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccl24Q9JKC0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccl24Q9JKC0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl24Q9JKC0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccl24Q9JKC0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl24Q9JKC0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccl24Q9JKC0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccl24Q9JKC0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccl24Q9JKC0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccl24Q9JKC0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccl24Q9JKC0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccl24Q9JKC0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccl24Q9JKC0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccl24Q9JKC0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccl24Q9JKC0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccl24Q9JKC0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccl24Q9JKC0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccl24Q9JKC0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccl24Q9JKC0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccl24Q9JKC0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccl24Q9JKC0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl24Q9JKC0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccl24Q9JKC0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccl24Q9JKC0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccl24Q9JKC0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl24Q9JKC0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl24Q9JKC0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl24Q9JKC0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl24Q9JKC0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl24Q9JKC0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl24Q9JKC0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl24Q9JKC0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl24Q9JKC0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl24Q9JKC0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccl24Q9JKC0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl24Q9JKC0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl24Q9JKC0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccl24Q9JKC0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl24Q9JKC0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl24Q9JKC0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl24Q9JKC0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl24Q9JKC0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccl24Q9JKC0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl24Q9JKC0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl24Q9JKC0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccl24Q9JKC0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccl24Q9JKC0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccl24Q9JKC0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccl24Q9JKC0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 931.8 ms