RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516524.1

RNU6-964P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 964, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-964P, Length 69 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-964P-201ENST00000516524 MGAM2Q2M2H8 2515 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-964P-201ENST00000516524 LRP2P98164 4655 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-964P-201ENST00000516524 DNAH2Q9P225 4427 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-964P-201ENST00000516524 MXRA5Q9NR99 2828 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-964P-201ENST00000516524 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-964P-201ENST00000516524 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-964P-201ENST00000516524 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-964P-201ENST00000516524 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-964P-201ENST00000516524 CHD7Q9P2D1 2997 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-964P-201ENST00000516524 LAMA5O15230 3695 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-964P-201ENST00000516524 DNAH6Q9C0G6 4158 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-964P-201ENST00000516524 ITPR1Q14643 2758 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-964P-201ENST00000516524 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-964P-201ENST00000516524 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-964P-201ENST00000516524 APOBP04114 4563 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-964P-201ENST00000516524 ITPR3Q14573 2671 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-964P-201ENST00000516524 LINC01590Q5TEZ4 76 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-964P-201ENST00000516524 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-964P-201ENST00000516524 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-964P-201ENST00000516524 TRIOO75962 3097 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-964P-201ENST00000516524 LAMA1P25391 3075 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-964P-201ENST00000516524 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-964P-201ENST00000516524 VPS13DQ5THJ4 4388 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-964P-201ENST00000516524 LEAP2Q969E1 77 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-964P-201ENST00000516524 DNAH7Q8WXX0 4024 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-964P-201ENST00000516524 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
RNU6-964P-201ENST00000516524 DEFB1P60022 68 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-964P-201ENST00000516524 DNAH1Q9P2D7 4330 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-964P-201ENST00000516524 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-964P-201ENST00000516524 HMCN1Q96RW7 5635 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-964P-201ENST00000516524 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-964P-201ENST00000516524 MUC5ACP98088 5654 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZFHX4Q86UP3 3567 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 KMT2DO14686 5537 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 DNAH8Q96JB1 4490 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 MDN1Q9NU22 5596 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-964P-201ENST00000516524 FAT1Q14517 4588 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-964P-201ENST00000516524 RELNP78509 3460 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-964P-201ENST00000516524 MT1HP80294 61 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-964P-201ENST00000516524 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-964P-201ENST00000516524 MGAQ8IWI9 3026 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-964P-201ENST00000516524 LAMA3Q16787 3333 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-964P-201ENST00000516524 PCLOQ9Y6V0 5065 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-964P-201ENST00000516524 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-964P-201ENST00000516524 C5orf42Q9H799 3197 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-964P-201ENST00000516524 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-964P-201ENST00000516524 CSMD1Q96PZ7 3565 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-964P-201ENST00000516524 HERC1Q15751 4861 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-964P-201ENST00000516524 DNAH10Q8IVF4 4471 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-964P-201ENST00000516524 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-964P-201ENST00000516524 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-964P-201ENST00000516524 PRCDQ00LT1 54 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-964P-201ENST00000516524 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-964P-201ENST00000516524 MUC2Q02817 5179 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-964P-201ENST00000516524 DEFB136Q30KP8 78 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-964P-201ENST00000516524 TEX15Q9BXT5 2789 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-964P-201ENST00000516524 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-964P-201ENST00000516524 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-964P-201ENST00000516524 LRBAP50851 2863 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-964P-201ENST00000516524 SSPOA2VEC9 5147 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-964P-201ENST00000516524 CEP250Q9BV73 2442 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-964P-201ENST00000516524 K7EIM0 57 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-964P-201ENST00000516524 MT1EP04732 61 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-964P-201ENST00000516524 MYO9AB2RTY4 2548 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-964P-201ENST00000516524 MUC17Q685J3 4493 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-964P-201ENST00000516524 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-964P-201ENST00000516524 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-964P-201ENST00000516524 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-964P-201ENST00000516524 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-964P-201ENST00000516524 CFAP54Q96N23 3096 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-964P-201ENST00000516524 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-964P-201ENST00000516524 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-964P-201ENST00000516524 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-964P-201ENST00000516524 MT1LQ93083 61 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-964P-201ENST00000516524 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-964P-201ENST00000516524 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-964P-201ENST00000516524 H3BUX3 64 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-964P-201ENST00000516524 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-964P-201ENST00000516524 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-964P-201ENST00000516524 TTTY10Q9BZA0 68 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-964P-201ENST00000516524 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-964P-201ENST00000516524 MT1XP80297 61 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-964P-201ENST00000516524 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-964P-201ENST00000516524 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-964P-201ENST00000516524 ATMQ13315 3056 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 DEFB124Q8NES8 71 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 USH2AO75445 5202 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 A0A096LNI7 61 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 RYR1P21817 5038 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 ITPR2Q14571 2701 aa-0.35□□□□□ -2.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 CSMD2Q7Z408 3487 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-964P-201ENST00000516524 H3BSH0 61 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-964P-201ENST00000516524 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-0.36□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.8 ms