RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.09□□□□□ -1.91
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PTPRC-210ENST00000462363 PCOTHQ58A44 107 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-210ENST00000462363 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-210ENST00000462363 HRES1P13985 223 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-210ENST00000462363 C4orf26Q17RF5 130 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-210ENST00000462363 Q1T7F1 81 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-210ENST00000462363 DMAC1Q96GE9 116 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-210ENST00000462363 Q5VV11 94 aa2.97□□□□□ -1.93
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PTPRC-210ENST00000462363 SVIPQ8NHG7 77 aa2.94□□□□□ -1.94
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PTPRC-210ENST00000462363 MUC17Q685J3 4493 aa2.86□□□□□ -1.95
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PTPRC-210ENST00000462363 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-210ENST00000462363 A6NED7 52 aa2.81□□□□□ -1.96
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PTPRC-210ENST00000462363 S4R3F8 94 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-210ENST00000462363 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
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PTPRC-210ENST00000462363 SEC61GP60059 68 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-210ENST00000462363 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-210ENST00000462363 P0C880 135 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-210ENST00000462363 PMAIP1Q13794 54 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-210ENST00000462363 CSAG1Q6PB30 78 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-210ENST00000462363 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-210ENST00000462363 MUC2Q02817 5179 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-210ENST00000462363 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-210ENST00000462363 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-210ENST00000462363 RNF213Q63HN8 5207 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRC-210ENST00000462363 M0QZ58 72 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-210ENST00000462363 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.61□□□□□ -1.99
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PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.59□□□□□ -1.99
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PTPRC-210ENST00000462363 PRAC1Q96KF2 57 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-210ENST00000462363 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-210ENST00000462363 M0R2T5 61 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-210ENST00000462363 CRIPTQ9P021 101 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-210ENST00000462363 K7ERS5 55 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-210ENST00000462363 ROMO1P60602 79 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-210ENST00000462363 R4GN34 69 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-210ENST00000462363 MT2AP02795 61 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRC-210ENST00000462363 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRC-210ENST00000462363 MT1FP04733 61 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-210ENST00000462363 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRC-210ENST00000462363 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-210ENST00000462363 LINC01554Q52M75 96 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP5-8O75690 187 aa2.45□□□□□ -2.02
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