RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322315.5

GIPC3-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC3, Length 4,335 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3-201ENST00000322315 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GIPC3-201ENST00000322315 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.19□□□□□ -1.26
GIPC3-201ENST00000322315 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.18□□□□□ -1.26
GIPC3-201ENST00000322315 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC3-201ENST00000322315 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.15□□□□□ -1.27
GIPC3-201ENST00000322315 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.14□□□□□ -1.27
GIPC3-201ENST00000322315 LUZP6Q538Z0 58 aa7.14□□□□□ -1.27
GIPC3-201ENST00000322315 RYR1P21817 5038 aa7.13□□□□□ -1.27
GIPC3-201ENST00000322315 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.1□□□□□ -1.27
GIPC3-201ENST00000322315 PKHD1P08F94 4074 aa7.09□□□□□ -1.27
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
GIPC3-201ENST00000322315 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.04□□□□□ -1.28
GIPC3-201ENST00000322315 NDUFAF8A1L188 74 aa7.03□□□□□ -1.28
GIPC3-201ENST00000322315 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.03□□□□□ -1.28
GIPC3-201ENST00000322315 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.99□□□□□ -1.29
GIPC3-201ENST00000322315 RYR3Q15413 4870 aa6.96□□□□□ -1.29
GIPC3-201ENST00000322315 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
GIPC3-201ENST00000322315 MT1HL1P0DM35 61 aa6.94□□□□□ -1.3
GIPC3-201ENST00000322315 TPRXLQ17RH7 258 aa6.94□□□□□ -1.3
GIPC3-201ENST00000322315 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP12-2P59991 146 aa6.92□□□□□ -1.3
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.82□□□□□ -1.32
GIPC3-201ENST00000322315 PLAC4Q8WY50 150 aa6.79□□□□□ -1.32
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.79□□□□□ -1.32
GIPC3-201ENST00000322315 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.79□□□□□ -1.32
GIPC3-201ENST00000322315 LRP2P98164 4655 aa6.78□□□□□ -1.32
GIPC3-201ENST00000322315 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.76□□□□□ -1.33
GIPC3-201ENST00000322315 A0A0A0MQY5 61 aa6.74□□□□□ -1.33
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP12-1P59990 96 aa6.74□□□□□ -1.33
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.72□□□□□ -1.33
GIPC3-201ENST00000322315 RYR2Q92736 4967 aa6.66□□□□□ -1.34
GIPC3-201ENST00000322315 TNP1P09430 55 aa6.66□□□□□ -1.34
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP10-10P60014 251 aa6.65□□□□□ -1.34
GIPC3-201ENST00000322315 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GIPC3-201ENST00000322315 PKD1P98161 4303 aa6.58□□□□□ -1.36
GIPC3-201ENST00000322315 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
GIPC3-201ENST00000322315 LPAP08519 4548 aa6.56□□□□□ -1.36
GIPC3-201ENST00000322315 HERC2O95714 4834 aa6.53□□□□□ -1.36
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.52□□□□□ -1.37
GIPC3-201ENST00000322315 HSPG2P98160 4391 aa6.5□□□□□ -1.37
GIPC3-201ENST00000322315 PP632Q6XCG6 107 aa6.45□□□□□ -1.38
GIPC3-201ENST00000322315 MUC2Q02817 5179 aa6.4□□□□□ -1.39
GIPC3-201ENST00000322315 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.33□□□□□ -1.4
GIPC3-201ENST00000322315 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.32□□□□□ -1.4
GIPC3-201ENST00000322315 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.26□□□□□ -1.41
GIPC3-201ENST00000322315 RNF213Q63HN8 5207 aa6.26□□□□□ -1.41
GIPC3-201ENST00000322315 HERC1Q15751 4861 aa6.2□□□□□ -1.42
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.19□□□□□ -1.42
GIPC3-201ENST00000322315 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.16□□□□□ -1.42
GIPC3-201ENST00000322315 TNXBP22105 4242 aa6.12□□□□□ -1.43
GIPC3-201ENST00000322315 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.08□□□□□ -1.44
GIPC3-201ENST00000322315 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.03□□□□□ -1.44
GIPC3-201ENST00000322315 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.98□□□□□ -1.45
GIPC3-201ENST00000322315 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.96□□□□□ -1.46
GIPC3-201ENST00000322315 LCE3AQ5TA76 89 aa5.92□□□□□ -1.46
GIPC3-201ENST00000322315 MT1HP80294 61 aa5.9□□□□□ -1.47
GIPC3-201ENST00000322315 MT1FP04733 61 aa5.85□□□□□ -1.47
GIPC3-201ENST00000322315 MT2AP02795 61 aa5.83□□□□□ -1.48
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP10-12P60413 245 aa5.8□□□□□ -1.48
GIPC3-201ENST00000322315 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.76□□□□□ -1.49
GIPC3-201ENST00000322315 MUC17Q685J3 4493 aa5.71□□□□□ -1.5
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP12-3P60328 96 aa5.71□□□□□ -1.5
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.7□□□□□ -1.5
GIPC3-201ENST00000322315 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.7□□□□□ -1.5
GIPC3-201ENST00000322315 LCE2CQ5TA81 110 aa5.66□□□□□ -1.5
GIPC3-201ENST00000322315 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.64□□□□□ -1.51
GIPC3-201ENST00000322315 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.64□□□□□ -1.51
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.63□□□□□ -1.51
GIPC3-201ENST00000322315 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
GIPC3-201ENST00000322315 USH2AO75445 5202 aa5.59□□□□□ -1.52
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.51□□□□□ -1.53
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.51□□□□□ -1.53
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.42□□□□□ -1.54
GIPC3-201ENST00000322315 MT1BP07438 61 aa5.42□□□□□ -1.54
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.42□□□□□ -1.54
GIPC3-201ENST00000322315 KMT2DO14686 5537 aa5.4□□□□□ -1.54
GIPC3-201ENST00000322315 MT1XP80297 61 aa5.4□□□□□ -1.55
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.39□□□□□ -1.55
GIPC3-201ENST00000322315 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP10-5P60370 271 aa5.36□□□□□ -1.55
GIPC3-201ENST00000322315 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
GIPC3-201ENST00000322315 INE1O15225 51 aa5.32□□□□□ -1.56
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.28□□□□□ -1.56
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.27□□□□□ -1.57
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.27□□□□□ -1.57
GIPC3-201ENST00000322315 LCE2BO14633 110 aa5.25□□□□□ -1.57
GIPC3-201ENST00000322315 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.2□□□□□ -1.58
GIPC3-201ENST00000322315 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.1□□□□□ -1.59
GIPC3-201ENST00000322315 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.06□□□□□ -1.6
GIPC3-201ENST00000322315 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5□□□□□ -1.61
GIPC3-201ENST00000322315 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
GIPC3-201ENST00000322315 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.93□□□□□ -1.62
GIPC3-201ENST00000322315 MT1GP13640 62 aa4.93□□□□□ -1.62
GIPC3-201ENST00000322315 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.88□□□□□ -1.63
GIPC3-201ENST00000322315 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.1 ms