RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322315.5

GIPC3-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC3, Length 4,335 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3-201ENST00000322315 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.94■■□□□ 1.74
GIPC3-201ENST00000322315 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.36■■□□□ 1.65
GIPC3-201ENST00000322315 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.73■■□□□ 1.55
GIPC3-201ENST00000322315 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
GIPC3-201ENST00000322315 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.81■■□□□ 1.4
GIPC3-201ENST00000322315 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GIPC3-201ENST00000322315 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.99■■□□□ 1.27
GIPC3-201ENST00000322315 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
GIPC3-201ENST00000322315 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.66■■□□□ 1.22
GIPC3-201ENST00000322315 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
GIPC3-201ENST00000322315 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.51■■□□□ 1.19
GIPC3-201ENST00000322315 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
GIPC3-201ENST00000322315 TRIM41Q8WV44 630 aa22.45■■□□□ 1.19
GIPC3-201ENST00000322315 ABCC9O60706 1549 aa21.98■■□□□ 1.11
GIPC3-201ENST00000322315 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
GIPC3-201ENST00000322315 HRCP23327 699 aa21.89■■□□□ 1.1
GIPC3-201ENST00000322315 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
GIPC3-201ENST00000322315 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
GIPC3-201ENST00000322315 APLP2Q06481 763 aa21.72■■□□□ 1.07
GIPC3-201ENST00000322315 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
GIPC3-201ENST00000322315 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
GIPC3-201ENST00000322315 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
GIPC3-201ENST00000322315 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GIPC3-201ENST00000322315 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.57■■□□□ 1.04
GIPC3-201ENST00000322315 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GIPC3-201ENST00000322315 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
GIPC3-201ENST00000322315 ITGAEP38570 1179 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC3-201ENST00000322315 SCRIBQ14160 1630 aa21.35■■□□□ 1.01
GIPC3-201ENST00000322315 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
GIPC3-201ENST00000322315 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
GIPC3-201ENST00000322315 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.94■□□□□ 0.94
GIPC3-201ENST00000322315 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
GIPC3-201ENST00000322315 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
GIPC3-201ENST00000322315 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
GIPC3-201ENST00000322315 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.86■□□□□ 0.93
GIPC3-201ENST00000322315 P3H3Q8IVL6 736 aa20.85■□□□□ 0.93
GIPC3-201ENST00000322315 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.85■□□□□ 0.93
GIPC3-201ENST00000322315 ARID3CA6NKF2 412 aa20.73■□□□□ 0.91
GIPC3-201ENST00000322315 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
GIPC3-201ENST00000322315 NEUROD1Q13562 356 aa20.66■□□□□ 0.9
GIPC3-201ENST00000322315 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.64■□□□□ 0.9
GIPC3-201ENST00000322315 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.57■□□□□ 0.88
GIPC3-201ENST00000322315 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.56■□□□□ 0.88
GIPC3-201ENST00000322315 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.53■□□□□ 0.88
GIPC3-201ENST00000322315 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GIPC3-201ENST00000322315 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.45■□□□□ 0.86
GIPC3-201ENST00000322315 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
GIPC3-201ENST00000322315 SOGA1O94964 1423 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC3-201ENST00000322315 BCANQ96GW7 911 aa20.38■□□□□ 0.85
GIPC3-201ENST00000322315 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
GIPC3-201ENST00000322315 FBLN2P98095 1184 aa20.35■□□□□ 0.85
GIPC3-201ENST00000322315 ABCC8Q09428 1581 aa20.31■□□□□ 0.84
GIPC3-201ENST00000322315 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GIPC3-201ENST00000322315 TRIM52Q96A61 297 aa20.29■□□□□ 0.84
GIPC3-201ENST00000322315 CEP162Q5TB80 1403 aa20.28■□□□□ 0.84
GIPC3-201ENST00000322315 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
GIPC3-201ENST00000322315 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC3-201ENST00000322315 MIER1Q8N108 512 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC3-201ENST00000322315 WIZO95785 1651 aa20.2■□□□□ 0.82
GIPC3-201ENST00000322315 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
GIPC3-201ENST00000322315 CLIP1P30622 1438 aa20.16■□□□□ 0.82
GIPC3-201ENST00000322315 NEFLP07196 543 aa20.16■□□□□ 0.82
GIPC3-201ENST00000322315 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
GIPC3-201ENST00000322315 NACADO15069 1562 aa20.15■□□□□ 0.82
GIPC3-201ENST00000322315 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.14■□□□□ 0.81
GIPC3-201ENST00000322315 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.12■□□□□ 0.81
GIPC3-201ENST00000322315 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.1■□□□□ 0.81
GIPC3-201ENST00000322315 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
GIPC3-201ENST00000322315 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
GIPC3-201ENST00000322315 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.04■□□□□ 0.8
GIPC3-201ENST00000322315 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
GIPC3-201ENST00000322315 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
GIPC3-201ENST00000322315 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
GIPC3-201ENST00000322315 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.96■□□□□ 0.79
GIPC3-201ENST00000322315 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.94■□□□□ 0.78
GIPC3-201ENST00000322315 GOLGA3Q08378 1498 aa19.93■□□□□ 0.78
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GIPC3-201ENST00000322315 ERICH6Q7L0X2 663 aa19.88■□□□□ 0.77
GIPC3-201ENST00000322315 ANP32CO43423 234 aa19.83■□□□□ 0.76
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GIPC3-201ENST00000322315 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.74■□□□□ 0.75
GIPC3-201ENST00000322315 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
GIPC3-201ENST00000322315 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
GIPC3-201ENST00000322315 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
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GIPC3-201ENST00000322315 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.69■□□□□ 0.74
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GIPC3-201ENST00000322315 TONSLQ96HA7 1378 aa19.68■□□□□ 0.74
GIPC3-201ENST00000322315 KIF27Q86VH2 1401 aa19.66■□□□□ 0.74
GIPC3-201ENST00000322315 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.65■□□□□ 0.74
GIPC3-201ENST00000322315 CUX2O14529 1486 aa19.64■□□□□ 0.73
GIPC3-201ENST00000322315 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.64■□□□□ 0.73
GIPC3-201ENST00000322315 FOXD1Q16676 465 aa19.61■□□□□ 0.73
GIPC3-201ENST00000322315 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
GIPC3-201ENST00000322315 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.61■□□□□ 0.73
GIPC3-201ENST00000322315 KCNH8Q96L42 1107 aa19.6■□□□□ 0.73
GIPC3-201ENST00000322315 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
GIPC3-201ENST00000322315 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.57■□□□□ 0.72
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