RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 TNXBP22105 4242 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 PCOTHQ58A44 107 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV2-30P06310 120 aa5.46□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-201ENST00000319942 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-201ENST00000319942 TPRXLQ17RH7 258 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-201ENST00000319942 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-201ENST00000319942 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-201ENST00000319942 MYCBP2O75592 4640 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-201ENST00000319942 HRES1P13985 223 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-201ENST00000319942 SPINK7P58062 85 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-201ENST00000319942 ACYP2P14621 99 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-201ENST00000319942 HERC2O95714 4834 aa5.34□□□□□ -1.56
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-201ENST00000319942 DMAC1Q96GE9 116 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MUN3 132 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-201ENST00000319942 COA5Q86WW8 74 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-201ENST00000319942 C4orf26Q17RF5 130 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-201ENST00000319942 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGGTB-201ENST00000319942 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGGTB-201ENST00000319942 V9GYY9 64 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP5-9P26371 169 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-201ENST00000319942 Q1T7F1 81 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-201ENST00000319942 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-201ENST00000319942 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-201ENST00000319942 SVIPQ8NHG7 77 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-201ENST00000319942 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-201ENST00000319942 LRP2P98164 4655 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-201ENST00000319942 LPAP08519 4548 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGGTB-201ENST00000319942 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR15LQ9BU68 103 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-201ENST00000319942 PSPHP1O15172 72 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-201ENST00000319942 S4R3F8 94 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC61GP60059 68 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GU69 56 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGGTB-201ENST00000319942 LCA10Q71F78 164 aa5.03□□□□□ -1.6
RABGGTB-201ENST00000319942 CSAG1Q6PB30 78 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-201ENST00000319942 Q5VV11 94 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-201ENST00000319942 HERC1Q15751 4861 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-201ENST00000319942 MUC17Q685J3 4493 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-201ENST00000319942 A6NED7 52 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-201ENST00000319942 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-201ENST00000319942 UQCR11O14957 56 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-201ENST00000319942 BRK1Q8WUW1 75 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GU33 70 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-201ENST00000319942 MT3P25713 68 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-201ENST00000319942 H0YAA0 97 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-201ENST00000319942 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP10-5P60370 271 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-201ENST00000319942 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-201ENST00000319942 PRO0628Q9UI54 55 aa4.82□□□□□ -1.64
RABGGTB-201ENST00000319942 MUC2Q02817 5179 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGGTB-201ENST00000319942 P0C880 135 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R2T5 61 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-201ENST00000319942 M0QZ58 72 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-201ENST00000319942 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MU10 97 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-201ENST00000319942 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RABGGTB-201ENST00000319942 MT1HP80294 61 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-201ENST00000319942 R4GN34 69 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF213Q63HN8 5207 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-201ENST00000319942 K7ERS5 55 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-201ENST00000319942 PMAIP1Q13794 54 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-201ENST00000319942 CRIPTQ9P021 101 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0D9SG42 100 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-201ENST00000319942 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01554Q52M75 96 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGGTB-201ENST00000319942 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP10-10P60014 251 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-201ENST00000319942 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-201ENST00000319942 A6NN06 94 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-201ENST00000319942 MT2AP02795 61 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP12-1P59990 96 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP12-2P59991 146 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-201ENST00000319942 MT1FP04733 61 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-201ENST00000319942 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-201ENST00000319942 ROMO1P60602 79 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-201ENST00000319942 PLAC4Q8WY50 150 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP10-12P60413 245 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-201ENST00000319942 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.2 ms