RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.633e-45■■■■■ 92.7
RABGGTB-201ENST00000319942 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP10.55□□□□□ -0.722e-11■■■■■ 61.7
RABGGTB-201ENST00000319942 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.112e-11■■■■■ 53.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 51.1
RABGGTB-201ENST00000319942 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.773e-9■■■■■ 50.3
RABGGTB-201ENST00000319942 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP12.34□□□□□ -0.434e-43■■■■■ 44.1
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP10.42□□□□□ -0.744e-8■■■■■ 42.2
RABGGTB-201ENST00000319942 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.741e-10■■■■■ 37.4
RABGGTB-201ENST00000319942 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 33.5
RABGGTB-201ENST00000319942 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP10.53□□□□□ -0.721e-9■■■■■ 33.2
RABGGTB-201ENST00000319942 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.85e-13■■■■■ 31.1
RABGGTB-201ENST00000319942 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.511e-56■■■■■ 29.5
RABGGTB-201ENST00000319942 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.899e-54■■■■■ 28.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 26.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.96e-18■■■■■ 26.9
RABGGTB-201ENST00000319942 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP10.85□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 25.7
RABGGTB-201ENST00000319942 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.863e-6■■■■□ 25.3
RABGGTB-201ENST00000319942 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.981e-9■■■■□ 25
RABGGTB-201ENST00000319942 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.086e-7■■■■□ 24
RABGGTB-201ENST00000319942 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.928e-15■■■■□ 24
RABGGTB-201ENST00000319942 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.872e-8■■■■□ 22.7
RABGGTB-201ENST00000319942 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.851e-6■■■■□ 22.3
RABGGTB-201ENST00000319942 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.117e-7■■■■□ 22.3
RABGGTB-201ENST00000319942 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP10.55□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 22.1
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.761e-12■■■■□ 21.1
RABGGTB-201ENST00000319942 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.775e-7■■■■□ 20.5
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP10.84□□□□□ -0.675e-6■■■□□ 18.2
RABGGTB-201ENST00000319942 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.614e-37■■■□□ 18.2
RABGGTB-201ENST00000319942 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.963e-7■■■□□ 16.8
RABGGTB-201ENST00000319942 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.31□□□□□ -1.243e-10■■■□□ 16.7
RABGGTB-201ENST00000319942 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.842e-7■■■□□ 16.6
RABGGTB-201ENST00000319942 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.861e-6■■■□□ 15.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP12.14□□□□□ -0.473e-6■■■□□ 15.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.661e-11■■■□□ 15.7
RABGGTB-201ENST00000319942 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.544e-8■■■□□ 15.6
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.031e-8■■■□□ 14.6
RABGGTB-201ENST00000319942 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.04□□□□□ -0.163e-8■■□□□ 14.2
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP13.91□□□□□ -0.183e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-201ENST00000319942 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.715e-8■■□□□ 13.8
RABGGTB-201ENST00000319942 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.885e-12■■□□□ 13.8
RABGGTB-201ENST00000319942 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.15□□□□□ -0.146e-9■■□□□ 13.5
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP10.93□□□□□ -0.668e-20■■□□□ 12.5
RABGGTB-201ENST00000319942 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.731e-9■■□□□ 12
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.41□□□□□ -0.585e-18■□□□□ 11.2
RABGGTB-201ENST00000319942 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.912e-7■□□□□ 11.1
RABGGTB-201ENST00000319942 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.566e-7■□□□□ 11
RABGGTB-201ENST00000319942 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.993e-28■□□□□ 10.7
RABGGTB-201ENST00000319942 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP13.33□□□□□ -0.281e-7■□□□□ 10.6
RABGGTB-201ENST00000319942 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.094e-7■□□□□ 10.5
RABGGTB-201ENST00000319942 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.889e-34■□□□□ 10.3
RABGGTB-201ENST00000319942 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.031e-7■□□□□ 10.3
RABGGTB-201ENST00000319942 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.889e-8■□□□□ 10.2
RABGGTB-201ENST00000319942 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.61e-7■□□□□ 9.4
RABGGTB-201ENST00000319942 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.632e-26■□□□□ 9.2
RABGGTB-201ENST00000319942 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP10.69□□□□□ -0.73e-30■□□□□ 9
RABGGTB-201ENST00000319942 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.575e-13■□□□□ 9
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.933e-7■□□□□ 8.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.118e-8■□□□□ 8.5
RABGGTB-201ENST00000319942 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP10.71□□□□□ -0.691e-323■□□□□ 8.2
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.93□□□□□ -1.142e-7■□□□□ 8
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