RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 PLAC8Q9NZF1 115 aa15.02□□□□□ -0.01
SENP3-201ENST00000321337 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa15.02□□□□□ -0.01
SENP3-201ENST00000321337 CDK2AP2O75956 126 aa15□□□□□ -0.01
SENP3-201ENST00000321337 Q5W150 140 aa14.99□□□□□ -0.01
SENP3-201ENST00000321337 SPINK6Q6UWN8 80 aa14.98□□□□□ -0.01
SENP3-201ENST00000321337 STARD9Q9P2P6 4700 aa14.97□□□□□ -0.01
SENP3-201ENST00000321337 SPINK7P58062 85 aa14.96□□□□□ -0.01
SENP3-201ENST00000321337 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa14.96□□□□□ -0.01
SENP3-201ENST00000321337 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-201ENST00000321337 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP3-201ENST00000321337 PRR26Q8N8Z3 221 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP3-201ENST00000321337 A0A087WTM6 91 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP3-201ENST00000321337 A6NN06 94 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP3-201ENST00000321337 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa14.9□□□□□ -0.02
SENP3-201ENST00000321337 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SENP3-201ENST00000321337 DNAH17Q9UFH2 4485 aa14.89□□□□□ -0.03
SENP3-201ENST00000321337 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.89□□□□□ -0.03
SENP3-201ENST00000321337 KMT2AQ03164 3969 aa14.88□□□□□ -0.03
SENP3-201ENST00000321337 ZNF861PO60384 105 aa14.88□□□□□ -0.03
SENP3-201ENST00000321337 DNAH2Q9P225 4427 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-201ENST00000321337 RTL8CO15255 209 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa14.86□□□□□ -0.03
SENP3-201ENST00000321337 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa14.8□□□□□ -0.04
SENP3-201ENST00000321337 FBN3Q75N90 2809 aa14.8□□□□□ -0.04
SENP3-201ENST00000321337 NUPR2A6NF83 97 aa14.76□□□□□ -0.05
SENP3-201ENST00000321337 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa14.75□□□□□ -0.05
SENP3-201ENST00000321337 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.75□□□□□ -0.05
SENP3-201ENST00000321337 RETNLBQ9BQ08 111 aa14.74□□□□□ -0.05
SENP3-201ENST00000321337 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SENP3-201ENST00000321337 TGP01266 2768 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-201ENST00000321337 IGLV7-43P04211 117 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-201ENST00000321337 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-201ENST00000321337 DNAH6Q9C0G6 4158 aa14.63□□□□□ -0.07
SENP3-201ENST00000321337 ACYP2P14621 99 aa14.62□□□□□ -0.07
SENP3-201ENST00000321337 C7orf65Q6ZTY9 151 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-201ENST00000321337 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.58□□□□□ -0.08
SENP3-201ENST00000321337 DMAC1Q96GE9 116 aa14.57□□□□□ -0.08
SENP3-201ENST00000321337 LINC00313P59037 77 aa14.53□□□□□ -0.08
SENP3-201ENST00000321337 C8orf87E5RJ46 101 aa14.52□□□□□ -0.09
SENP3-201ENST00000321337 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa14.48□□□□□ -0.09
SENP3-201ENST00000321337 DNAH5Q8TE73 4624 aa14.47□□□□□ -0.09
SENP3-201ENST00000321337 IGKV2-30P06310 120 aa14.45□□□□□ -0.1
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa14.45□□□□□ -0.1
SENP3-201ENST00000321337 FAM229AH3BQW9 127 aa14.45□□□□□ -0.1
SENP3-201ENST00000321337 PRAC1Q96KF2 57 aa14.43□□□□□ -0.1
SENP3-201ENST00000321337 A0A1B0GU69 56 aa14.42□□□□□ -0.1
SENP3-201ENST00000321337 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.41□□□□□ -0.1
SENP3-201ENST00000321337 ADM2Q7Z4H4 148 aa14.41□□□□□ -0.1
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa14.39□□□□□ -0.11
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP10-2P60368 255 aa14.38□□□□□ -0.11
SENP3-201ENST00000321337 LRP1BQ9NZR2 4599 aa14.38□□□□□ -0.11
SENP3-201ENST00000321337 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa14.34□□□□□ -0.11
SENP3-201ENST00000321337 SPATA8Q6RVD6 105 aa14.28□□□□□ -0.12
SENP3-201ENST00000321337 LY6G6CO95867 125 aa14.27□□□□□ -0.13
SENP3-201ENST00000321337 MIR22HGQ0VDD5 57 aa14.21□□□□□ -0.13
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa14.18□□□□□ -0.14
SENP3-201ENST00000321337 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa14.16□□□□□ -0.14
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP10-1P60331 282 aa14.16□□□□□ -0.14
SENP3-201ENST00000321337 PKD1P98161 4303 aa14.15□□□□□ -0.14
SENP3-201ENST00000321337 UQCR11O14957 56 aa14.15□□□□□ -0.14
SENP3-201ENST00000321337 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
SENP3-201ENST00000321337 SPINK1P00995 79 aa14.12□□□□□ -0.15
SENP3-201ENST00000321337 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.1□□□□□ -0.15
SENP3-201ENST00000321337 Q8N1X5 172 aa14.09□□□□□ -0.15
SENP3-201ENST00000321337 Q6ZSA8 131 aa14.05□□□□□ -0.16
SENP3-201ENST00000321337 FAT2Q9NYQ8 4349 aa14.03□□□□□ -0.16
SENP3-201ENST00000321337 DNHD1Q96M86 4753 aa13.98□□□□□ -0.17
SENP3-201ENST00000321337 TYMSOSQ8TAI1 123 aa13.96□□□□□ -0.17
SENP3-201ENST00000321337 C4orf48Q5BLP8 95 aa13.95□□□□□ -0.18
SENP3-201ENST00000321337 LINC01554Q52M75 96 aa13.88□□□□□ -0.19
SENP3-201ENST00000321337 CSAG1Q6PB30 78 aa13.87□□□□□ -0.19
SENP3-201ENST00000321337 H0YAA0 97 aa13.76□□□□□ -0.21
SENP3-201ENST00000321337 PKHD1P08F94 4074 aa13.75□□□□□ -0.21
SENP3-201ENST00000321337 C9orf92A6NGG3 77 aa13.75□□□□□ -0.21
SENP3-201ENST00000321337 LINC00304Q8N9R0 145 aa13.73□□□□□ -0.21
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa13.72□□□□□ -0.21
SENP3-201ENST00000321337 SACSQ9NZJ4 4579 aa13.64□□□□□ -0.23
SENP3-201ENST00000321337 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
SENP3-201ENST00000321337 A8MUU9 505 aa13.59□□□□□ -0.23
SENP3-201ENST00000321337 A0A1B0GU33 70 aa13.55□□□□□ -0.24
SENP3-201ENST00000321337 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa13.54□□□□□ -0.24
SENP3-201ENST00000321337 FAT1Q14517 4588 aa13.53□□□□□ -0.24
SENP3-201ENST00000321337 RPS29P62273 56 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SENP3-201ENST00000321337 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa13.49□□□□□ -0.25
SENP3-201ENST00000321337 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SENP3-201ENST00000321337 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa13.47□□□□□ -0.25
SENP3-201ENST00000321337 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SENP3-201ENST00000321337 APOBP04114 4563 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa13.36□□□□□ -0.27
SENP3-201ENST00000321337 CRIPTQ9P021 101 aa13.35□□□□□ -0.27
SENP3-201ENST00000321337 COX6B2Q6YFQ2 88 aa13.3□□□□□ -0.28
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
SENP3-201ENST00000321337 H3BS24 57 aa13.24□□□□□ -0.29
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa13.09□□□□□ -0.31
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa13.09□□□□□ -0.31
SENP3-201ENST00000321337 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SENP3-201ENST00000321337 FAT3Q8TDW7 4589 aa13.08□□□□□ -0.32
SENP3-201ENST00000321337 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SENP3-201ENST00000321337 HSPG2P98160 4391 aa13.06□□□□□ -0.32
SENP3-201ENST00000321337 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.1 ms