RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 CACNA1HO95180 2353 aa1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 SAMD9Q5K651 1589 aa1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 NDUFB1O75438 58 aa1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 COX8AP10176 69 aa1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 NHSQ6T4R5 1651 aa1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 PREX1Q8TCU6 1659 aa1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A0G2JMZ2 1700 aa1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa1.05□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 SPINK7P58062 85 aa1.05□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 HAMPP81172 84 aa1.05□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 ASXL3Q9C0F0 2248 aa1.05□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 CD163L1Q9NR16 1453 aa1.05□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BVH4 76 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 S100A3P33764 101 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 SMIM5Q71RC9 77 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 GNG13Q9P2W3 67 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 PLXNC1O60486 1568 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 QSER1Q2KHR3 1735 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A1B0GU69 56 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 SFTA3P0C7M3 94 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 HILPDAQ9Y5L2 63 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 RALGAPBQ86X10 1494 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 LMTK2Q8IWU2 1503 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRC7Q96NW7 1537 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 LRP6O75581 1613 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 USP32Q8NFA0 1604 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF831Q5JPB2 1677 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRC37AA6NMS7 1700 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-205ENST00000462042 TSC2P49815 1807 aa1.03□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 ATXN8Q156A1 80 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB112Q30KQ8 113 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCA6Q8N139 1617 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 ERCC6L2Q5T890 1561 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAV21A0A0B4J279 112 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 C3orf79P0CE67 100 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 WFDC9Q8NEX5 89 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 TENM3Q9P273 2699 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 RICTORQ6R327 1708 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 URB1O60287 2271 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 IFI6P09912 130 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 NREPQ16612 68 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 GAFA1Q96PS6 74 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 NRAPQ86VF7 1730 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 DOT1LQ8TEK3 1739 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 FMN2Q9NZ56 1722 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 ALS2Q96Q42 1657 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa0.99□□□□□ -2.25
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RABGGTB-205ENST00000462042 MAST1Q9Y2H9 1570 aa0.99□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 RPL38P63173 70 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 PRXQ9BXM0 1461 aa0.98□□□□□ -2.25
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RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 COX7BP24311 80 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 TULP4Q9NRJ4 1543 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 MROH2AA6NES4 1674 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 KIF1AQ12756 1690 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 ITSN2Q9NZM3 1697 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP0.97□□□□□ -2.25
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RABGGTB-205ENST00000462042 SYCP2Q9BX26 1530 aa0.96□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa0.96□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 NESP48681 1621 aa0.96□□□□□ -2.26
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RABGGTB-205ENST00000462042 LINC01549A6NIU2 74 aa0.94□□□□□ -2.26
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RABGGTB-205ENST00000462042 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa0.94□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCC6O95255 1503 aa0.94□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 CLASP1Q7Z460 1538 aa0.94□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 NDUFA4O00483 81 aa0.93□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 PIGYQ3MUY2 71 aa0.93□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 ENHOQ6UWT2 76 aa0.93□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 USMG5Q96IX5 58 aa0.93□□□□□ -2.26
RABGGTB-205ENST00000462042 CNFNQ9BYD5 112 aa0.93□□□□□ -2.26
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