RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.223e-45■■■■■ 92.7
RABGGTB-205ENST00000462042 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP0.86□□□□□ -2.276e-10■■■■■ 59
RABGGTB-205ENST00000462042 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.353e-9■■■■■ 50.3
RABGGTB-205ENST00000462042 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.684e-43■■■■■ 44.1
RABGGTB-205ENST00000462042 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.671e-56■■■■■ 29.5
RABGGTB-205ENST00000462042 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.939e-54■■■■■ 28.8
RABGGTB-205ENST00000462042 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.948e-15■■■■□ 24
RABGGTB-205ENST00000462042 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.363e-6■■■■□ 21.9
RABGGTB-205ENST00000462042 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.891e-12■■■■□ 21.1
RABGGTB-205ENST00000462042 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.72e-8■■■□□ 18.5
RABGGTB-205ENST00000462042 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.524e-37■■■□□ 18.2
RABGGTB-205ENST00000462042 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.832e-14■■■□□ 17.5
RABGGTB-205ENST00000462042 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP5.31□□□□□ -1.562e-9■■■□□ 17
RABGGTB-205ENST00000462042 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP0.42□□□□□ -2.343e-10■■■□□ 16.7
RABGGTB-205ENST00000462042 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP5.4□□□□□ -1.541e-6■■■□□ 15.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.233e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-205ENST00000462042 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.395e-8■■□□□ 13.8
RABGGTB-205ENST00000462042 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.397e-18■■□□□ 13.7
RABGGTB-205ENST00000462042 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.233e-7■■□□□ 13.1
RABGGTB-205ENST00000462042 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.02□□□□□ -1.458e-20■■□□□ 12.5
RABGGTB-205ENST00000462042 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.511e-9■■□□□ 11.9
RABGGTB-205ENST00000462042 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP3.83□□□□□ -1.86e-10■□□□□ 11.2
RABGGTB-205ENST00000462042 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.816e-6■□□□□ 11
RABGGTB-205ENST00000462042 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.753e-28■□□□□ 10.7
RABGGTB-205ENST00000462042 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.43□□□□□ -1.541e-323■□□□□ 10.5
RABGGTB-205ENST00000462042 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.632e-6■□□□□ 10.5
RABGGTB-205ENST00000462042 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.039e-34■□□□□ 10.3
RABGGTB-205ENST00000462042 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.282e-7■□□□□ 9.7
RABGGTB-205ENST00000462042 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.322e-26■□□□□ 9.2
RABGGTB-205ENST00000462042 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.68□□□□□ -1.185e-13■□□□□ 9
RABGGTB-205ENST00000462042 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.688e-8■□□□□ 8.5
RABGGTB-205ENST00000462042 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.391e-323■□□□□ 8.2
RABGGTB-205ENST00000462042 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.77□□□□□ -1.812e-7■□□□□ 8
Retrieved 33 of 33 RNA–protein pairs in 4 ms