RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPT53	YNL093W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	PCH2	P38126	564 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SIF2	P38262	535 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SIP3	P38717	1229 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YRB2	P40517	327 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SMK1	P41808	388 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	ALR2	P43553	858 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	GYP8	P43570	497 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	PFD1	P46988	109 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	GCV2	P49095	1034 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TOM22	P49334	152 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	MEC3	Q02574	474 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	AIM32	Q04689	311 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	DAL4	Q04895	635 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	RSF1	Q05043	376 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	VIK1	Q12045	647 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	MDM12	Q92328	271 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SWI1	P09547	1314 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SEM1	O94742	89 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	ROX1	P25042	368 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	CWH43	P25618	953 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	ERG3	P32353	365 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	MSN4	P33749	630 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	MMS4	P38257	691 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YBR225W	P38321	900 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	BIT2	P38346	545 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SMF2	P38778	549 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	PPE1	P38796	400 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SHC1	P39000	512 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	LTP1	P40347	161 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YJR096W	P47137	282 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	HFM1	P51979	1187 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	MET13	P53128	600 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YGR045C	P53229	120 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SHE9	Q04172	456 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	MGR3	Q04472	501 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	CIA1	Q05583	330 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	FUS2	Q05670	677 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	HDA2	Q06629	674 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	DIN7	Q12086	430 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	RBD2	Q12270	262 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SGS1	P35187	1447 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	JIP3	O13555	125 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	BI4	P03879	638 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	STE3	P06783	470 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SRD1	P09007	221 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	PRB1	P09232	635 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	NFS1	P25374	497 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	AGP1	P25376	633 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	BOS1	P25385	244 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	CDC15	P27636	974 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	DAL3	P32459	195 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	VBA5	P36172	582 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	HSL7	P38274	827 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YHL017W	P38745	532 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	PTC7	P38797	343 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	EMP65	P40085	556 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SPO22	P40511	975 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	NAS2	P40555	220 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YIR042C	P40586	236 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	XKS1	P42826	600 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YDL183C	P48569	320 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	ASE1	P50275	885 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	NUT1	P53114	1132 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SLD3	P53135	668 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SNF12	P53628	566 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	CBK1	P53894	756 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	ULP1	Q02724	621 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	MUB1	Q03162	620 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	DON1	Q05610	365 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	PSY3	Q12318	242 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SKS1	Q12505	502 aa		4.18	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms