Protein–RNA interactions for Protein: P40517

YRB2, Ran-specific GTPase-activating protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRB2P40517 NSR1YGR159C 1245 nt18.91■□□□□ 0.62
YRB2P40517 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.55■□□□□ 0.56
YRB2P40517 NOP1YDL014W 984 nt17.78■□□□□ 0.44
YRB2P40517 MDJ1YFL016C 1536 nt17.32■□□□□ 0.36
YRB2P40517 YKL036CYKL036C 393 nt15.93■□□□□ 0.14
YRB2P40517 YJL027CYJL027C 417 nt15.9■□□□□ 0.14
YRB2P40517 SRX1YKL086W 384 nt15.57■□□□□ 0.08
YRB2P40517 Q0297Q0297 156 nt15.43■□□□□ 0.06
YRB2P40517 DBP2YNL112W 1641 nt15.16■□□□□ 0.02
YRB2P40517 YBR190WYBR190W 312 nt14.89□□□□□ -0.03
YRB2P40517 YCR051WYCR051W 669 nt14.71□□□□□ -0.05
YRB2P40517 RTC3YHR087W 336 nt14.5□□□□□ -0.09
YRB2P40517 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.42□□□□□ -0.1
YRB2P40517 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.42□□□□□ -0.1
YRB2P40517 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.42□□□□□ -0.1
YRB2P40517 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.42□□□□□ -0.1
YRB2P40517 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.42□□□□□ -0.1
YRB2P40517 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.42□□□□□ -0.1
YRB2P40517 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.42□□□□□ -0.1
YRB2P40517 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.42□□□□□ -0.1
YRB2P40517 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.42□□□□□ -0.1
YRB2P40517 SSA3YBL075C 1950 nt14.4□□□□□ -0.1
YRB2P40517 SCS3YGL126W 1143 nt14.25□□□□□ -0.13
YRB2P40517 CCC1YLR220W 969 nt14.24□□□□□ -0.13
YRB2P40517 RVS167YDR388W 1449 nt14.02□□□□□ -0.16
YRB2P40517 PUT4YOR348C 1884 nt13.99□□□□□ -0.17
YRB2P40517 SCJ1YMR214W 1134 nt13.93□□□□□ -0.18
YRB2P40517 RPP1BYDL130W 321 nt13.84□□□□□ -0.19
YRB2P40517 YOL085CYOL085C 342 nt13.84□□□□□ -0.19
YRB2P40517 PKP1YIL042C 1185 nt13.69□□□□□ -0.22
YRB2P40517 ARE1YCR048W 1833 nt13.57□□□□□ -0.24
YRB2P40517 POA1YBR022W 534 nt13.47□□□□□ -0.25
YRB2P40517 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.45□□□□□ -0.26
YRB2P40517 SHR5YOL110W 714 nt13.44□□□□□ -0.26
YRB2P40517 URN1YPR152C 1398 nt13.41□□□□□ -0.26
YRB2P40517 SAH1YER043C 1350 nt13.4□□□□□ -0.26
YRB2P40517 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.36□□□□□ -0.27
YRB2P40517 OPI9YLR338W 858 nt13.33□□□□□ -0.28
YRB2P40517 PET122YER153C 765 nt13.31□□□□□ -0.28
YRB2P40517 BSC6YOL137W 1494 nt13.29□□□□□ -0.28
YRB2P40517 DEP1YAL013W 1218 nt13.25□□□□□ -0.29
YRB2P40517 SPT5YML010W 3192 nt13.19□□□□□ -0.3
YRB2P40517 RPN10YHR200W 807 nt13.03□□□□□ -0.32
YRB2P40517 YDJ1YNL064C 1230 nt13.01□□□□□ -0.33
YRB2P40517 BUD23YCR047C 828 nt12.98□□□□□ -0.33
YRB2P40517 YNL208WYNL208W 600 nt12.96□□□□□ -0.33
YRB2P40517 SCR1SCR1 522 nt12.96□□□□□ -0.33
YRB2P40517 PUN1YLR414C 792 nt12.91□□□□□ -0.34
YRB2P40517 SSA4YER103W 1929 nt12.9□□□□□ -0.34
YRB2P40517 PTC2YER089C 1395 nt12.87□□□□□ -0.35
YRB2P40517 RRN5YLR141W 1092 nt12.85□□□□□ -0.35
YRB2P40517 GAR1YHR089C 618 nt12.8□□□□□ -0.36
YRB2P40517 NAB2YGL122C 1578 nt12.77□□□□□ -0.37
YRB2P40517 YJR018WYJR018W 363 nt12.74□□□□□ -0.37
YRB2P40517 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.61□□□□□ -0.39
YRB2P40517 ATS1YAL020C 1002 nt12.59□□□□□ -0.39
YRB2P40517 FIS1YIL065C 468 nt12.58□□□□□ -0.4
YRB2P40517 MEP2YNL142W 1500 nt12.54□□□□□ -0.4
YRB2P40517 BDF1YLR399C 2061 nt12.51□□□□□ -0.41
YRB2P40517 YJR120WYJR120W 351 nt12.51□□□□□ -0.41
YRB2P40517 DAL1YIR027C 1383 nt12.5□□□□□ -0.41
YRB2P40517 FPR4YLR449W 1179 nt12.43□□□□□ -0.42
YRB2P40517 TIR1YER011W 765 nt12.4□□□□□ -0.42
YRB2P40517 RSB1YOR049C 1065 nt12.4□□□□□ -0.42
YRB2P40517 SSA1YAL005C 1929 nt12.4□□□□□ -0.42
YRB2P40517 PHO4YFR034C 939 nt12.39□□□□□ -0.43
YRB2P40517 YPS1YLR120C 1710 nt12.37□□□□□ -0.43
YRB2P40517 DCW1YKL046C 1350 nt12.35□□□□□ -0.43
YRB2P40517 INM2YDR287W 879 nt12.34□□□□□ -0.43
YRB2P40517 TAT1YBR069C 1860 nt12.31□□□□□ -0.44
YRB2P40517 RPP2BYDR382W 333 nt12.3□□□□□ -0.44
YRB2P40517 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.21□□□□□ -0.45
YRB2P40517 YDR095CYDR095C 411 nt12.19□□□□□ -0.46
YRB2P40517 YBL100CYBL100C 315 nt12.15□□□□□ -0.46
YRB2P40517 EMI2YDR516C 1503 nt12.15□□□□□ -0.46
YRB2P40517 SRB2YHR041C 633 nt12.14□□□□□ -0.47
YRB2P40517 YBR220CYBR220C 1683 nt12.13□□□□□ -0.47
YRB2P40517 YMR090WYMR090W 684 nt12.05□□□□□ -0.48
YRB2P40517 YDL221WYDL221W 552 nt12.02□□□□□ -0.49
YRB2P40517 PTP1YDL230W 1008 nt12.01□□□□□ -0.49
YRB2P40517 BDH2YAL061W 1254 nt12.01□□□□□ -0.49
YRB2P40517 CAC2YML102W 1407 nt12.01□□□□□ -0.49
YRB2P40517 FUN26YAL022C 1554 nt12.01□□□□□ -0.49
YRB2P40517 SDH1YKL148C 1923 nt11.98□□□□□ -0.49
YRB2P40517 RPP2AYOL039W 321 nt11.95□□□□□ -0.5
YRB2P40517 ALF1YNL148C 765 nt11.9□□□□□ -0.5
YRB2P40517 TRM9YML014W 840 nt11.86□□□□□ -0.51
YRB2P40517 PAC11YDR488C 1602 nt11.85□□□□□ -0.51
YRB2P40517 IRC15YPL017C 1500 nt11.84□□□□□ -0.51
YRB2P40517 SCC4YER147C 1875 nt11.82□□□□□ -0.52
YRB2P40517 CCT6YDR188W 1641 nt11.8□□□□□ -0.52
YRB2P40517 SIS1YNL007C 1059 nt11.79□□□□□ -0.52
YRB2P40517 PCH2YBR186W 1695 nt11.78□□□□□ -0.52
YRB2P40517 WWM1YFL010C 636 nt11.78□□□□□ -0.52
YRB2P40517 PST2YDR032C 597 nt11.77□□□□□ -0.53
YRB2P40517 GUT2YIL155C 1950 nt11.75□□□□□ -0.53
YRB2P40517 GIS3YLR094C 1509 nt11.75□□□□□ -0.53
YRB2P40517 LSM3YLR438C-A 270 nt11.74□□□□□ -0.53
YRB2P40517 SEC11YIR022W 504 nt11.72□□□□□ -0.53
YRB2P40517 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.5 ms