Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VIK1Q12045 NSR1YGR159C 1245 nt19.07■□□□□ 0.64
VIK1Q12045 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.75■□□□□ 0.59
VIK1Q12045 NOP1YDL014W 984 nt18.09■□□□□ 0.49
VIK1Q12045 MDJ1YFL016C 1536 nt17.31■□□□□ 0.36
VIK1Q12045 YKL036CYKL036C 393 nt16.23■□□□□ 0.19
VIK1Q12045 YJL027CYJL027C 417 nt15.98■□□□□ 0.15
VIK1Q12045 SRX1YKL086W 384 nt15.77■□□□□ 0.12
VIK1Q12045 Q0297Q0297 156 nt15.65■□□□□ 0.1
VIK1Q12045 SSA3YBL075C 1950 nt15.23■□□□□ 0.03
VIK1Q12045 DBP2YNL112W 1641 nt15.12■□□□□ 0.01
VIK1Q12045 YBR190WYBR190W 312 nt14.94□□□□□ -0.02
VIK1Q12045 YCR051WYCR051W 669 nt14.92□□□□□ -0.02
VIK1Q12045 RTC3YHR087W 336 nt14.56□□□□□ -0.08
VIK1Q12045 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.53□□□□□ -0.08
VIK1Q12045 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.53□□□□□ -0.08
VIK1Q12045 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.53□□□□□ -0.08
VIK1Q12045 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.53□□□□□ -0.08
VIK1Q12045 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.53□□□□□ -0.08
VIK1Q12045 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.53□□□□□ -0.08
VIK1Q12045 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.53□□□□□ -0.08
VIK1Q12045 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.53□□□□□ -0.08
VIK1Q12045 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.53□□□□□ -0.08
VIK1Q12045 SCS3YGL126W 1143 nt14.49□□□□□ -0.09
VIK1Q12045 CCC1YLR220W 969 nt14.35□□□□□ -0.11
VIK1Q12045 RVS167YDR388W 1449 nt14.19□□□□□ -0.14
VIK1Q12045 YOL085CYOL085C 342 nt14.05□□□□□ -0.16
VIK1Q12045 RPP1BYDL130W 321 nt14.04□□□□□ -0.16
VIK1Q12045 PUT4YOR348C 1884 nt14.01□□□□□ -0.17
VIK1Q12045 SCJ1YMR214W 1134 nt13.95□□□□□ -0.18
VIK1Q12045 PKP1YIL042C 1185 nt13.86□□□□□ -0.19
VIK1Q12045 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.59□□□□□ -0.23
VIK1Q12045 SHR5YOL110W 714 nt13.57□□□□□ -0.24
VIK1Q12045 POA1YBR022W 534 nt13.51□□□□□ -0.25
VIK1Q12045 ARE1YCR048W 1833 nt13.5□□□□□ -0.25
VIK1Q12045 URN1YPR152C 1398 nt13.46□□□□□ -0.25
VIK1Q12045 PET122YER153C 765 nt13.45□□□□□ -0.26
VIK1Q12045 BSC6YOL137W 1494 nt13.4□□□□□ -0.26
VIK1Q12045 SSA4YER103W 1929 nt13.37□□□□□ -0.27
VIK1Q12045 SAH1YER043C 1350 nt13.37□□□□□ -0.27
VIK1Q12045 OPI9YLR338W 858 nt13.37□□□□□ -0.27
VIK1Q12045 SPT5YML010W 3192 nt13.36□□□□□ -0.27
VIK1Q12045 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.36□□□□□ -0.27
VIK1Q12045 DEP1YAL013W 1218 nt13.29□□□□□ -0.28
VIK1Q12045 SCR1SCR1 522 nt13.23□□□□□ -0.29
VIK1Q12045 RPN10YHR200W 807 nt13.21□□□□□ -0.29
VIK1Q12045 YDJ1YNL064C 1230 nt13.18□□□□□ -0.3
VIK1Q12045 YNL208WYNL208W 600 nt13.09□□□□□ -0.31
VIK1Q12045 RRN5YLR141W 1092 nt13.01□□□□□ -0.33
VIK1Q12045 PUN1YLR414C 792 nt13□□□□□ -0.33
VIK1Q12045 BUD23YCR047C 828 nt12.99□□□□□ -0.33
VIK1Q12045 BDF1YLR399C 2061 nt12.93□□□□□ -0.34
VIK1Q12045 GAR1YHR089C 618 nt12.92□□□□□ -0.34
VIK1Q12045 PTC2YER089C 1395 nt12.87□□□□□ -0.35
VIK1Q12045 ATS1YAL020C 1002 nt12.84□□□□□ -0.35
VIK1Q12045 YJR018WYJR018W 363 nt12.82□□□□□ -0.36
VIK1Q12045 NAB2YGL122C 1578 nt12.8□□□□□ -0.36
VIK1Q12045 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.75□□□□□ -0.37
VIK1Q12045 TAT1YBR069C 1860 nt12.75□□□□□ -0.37
VIK1Q12045 PAC11YDR488C 1602 nt12.71□□□□□ -0.37
VIK1Q12045 MEP2YNL142W 1500 nt12.67□□□□□ -0.38
VIK1Q12045 RSB1YOR049C 1065 nt12.62□□□□□ -0.39
VIK1Q12045 FIS1YIL065C 468 nt12.55□□□□□ -0.4
VIK1Q12045 DAL1YIR027C 1383 nt12.54□□□□□ -0.4
VIK1Q12045 TIR1YER011W 765 nt12.52□□□□□ -0.41
VIK1Q12045 FPR4YLR449W 1179 nt12.49□□□□□ -0.41
VIK1Q12045 RPP2BYDR382W 333 nt12.47□□□□□ -0.41
VIK1Q12045 YJR120WYJR120W 351 nt12.47□□□□□ -0.41
VIK1Q12045 INM2YDR287W 879 nt12.45□□□□□ -0.42
VIK1Q12045 SSA1YAL005C 1929 nt12.43□□□□□ -0.42
VIK1Q12045 DCW1YKL046C 1350 nt12.42□□□□□ -0.42
VIK1Q12045 PHO4YFR034C 939 nt12.41□□□□□ -0.42
VIK1Q12045 YPS1YLR120C 1710 nt12.33□□□□□ -0.44
VIK1Q12045 NVJ2YPR091C 2313 nt12.31□□□□□ -0.44
VIK1Q12045 YMR090WYMR090W 684 nt12.31□□□□□ -0.44
VIK1Q12045 YBR220CYBR220C 1683 nt12.31□□□□□ -0.44
VIK1Q12045 EMI2YDR516C 1503 nt12.26□□□□□ -0.45
VIK1Q12045 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.25□□□□□ -0.45
VIK1Q12045 YBL100CYBL100C 315 nt12.23□□□□□ -0.45
VIK1Q12045 YDR095CYDR095C 411 nt12.2□□□□□ -0.46
VIK1Q12045 BDH2YAL061W 1254 nt12.12□□□□□ -0.47
VIK1Q12045 SDH1YKL148C 1923 nt12.11□□□□□ -0.47
VIK1Q12045 PCH2YBR186W 1695 nt12.1□□□□□ -0.47
VIK1Q12045 YDL221WYDL221W 552 nt12.09□□□□□ -0.47
VIK1Q12045 SRB2YHR041C 633 nt12.09□□□□□ -0.47
VIK1Q12045 FUN26YAL022C 1554 nt12.05□□□□□ -0.48
VIK1Q12045 SEC11YIR022W 504 nt12.05□□□□□ -0.48
VIK1Q12045 GUT2YIL155C 1950 nt12.05□□□□□ -0.48
VIK1Q12045 ALF1YNL148C 765 nt12.02□□□□□ -0.49
VIK1Q12045 TRM9YML014W 840 nt11.97□□□□□ -0.49
VIK1Q12045 RPP2AYOL039W 321 nt11.97□□□□□ -0.49
VIK1Q12045 PST2YDR032C 597 nt11.96□□□□□ -0.49
VIK1Q12045 PTP1YDL230W 1008 nt11.93□□□□□ -0.5
VIK1Q12045 CAC2YML102W 1407 nt11.92□□□□□ -0.5
VIK1Q12045 SCC4YER147C 1875 nt11.91□□□□□ -0.5
VIK1Q12045 LSM3YLR438C-A 270 nt11.89□□□□□ -0.51
VIK1Q12045 CCT6YDR188W 1641 nt11.86□□□□□ -0.51
VIK1Q12045 WWM1YFL010C 636 nt11.86□□□□□ -0.51
VIK1Q12045 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.84□□□□□ -0.51
VIK1Q12045 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.84□□□□□ -0.51
VIK1Q12045 SIS1YNL007C 1059 nt11.82□□□□□ -0.52
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