Protein–RNA interactions for Protein: Q02642

EGD1, Nascent polypeptide-associated complex subunit beta-1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EGD1Q02642 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.88■□□□□ 0.77
EGD1Q02642 NSR1YGR159C 1245 nt19.56■□□□□ 0.72
EGD1Q02642 NOP1YDL014W 984 nt19.5■□□□□ 0.71
EGD1Q02642 YKL036CYKL036C 393 nt18.18■□□□□ 0.5
EGD1Q02642 Q0297Q0297 156 nt17.1■□□□□ 0.33
EGD1Q02642 MDJ1YFL016C 1536 nt17.06■□□□□ 0.32
EGD1Q02642 YJL027CYJL027C 417 nt17.02■□□□□ 0.32
EGD1Q02642 SRX1YKL086W 384 nt16.99■□□□□ 0.31
EGD1Q02642 SCS3YGL126W 1143 nt16.63■□□□□ 0.25
EGD1Q02642 YCR051WYCR051W 669 nt16.14■□□□□ 0.17
EGD1Q02642 YOL085CYOL085C 342 nt15.7■□□□□ 0.1
EGD1Q02642 PKP1YIL042C 1185 nt15.4■□□□□ 0.06
EGD1Q02642 RPP1BYDL130W 321 nt15.35■□□□□ 0.05
EGD1Q02642 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.19■□□□□ 0.02
EGD1Q02642 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.19■□□□□ 0.02
EGD1Q02642 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.19■□□□□ 0.02
EGD1Q02642 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.19■□□□□ 0.02
EGD1Q02642 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.19■□□□□ 0.02
EGD1Q02642 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.19■□□□□ 0.02
EGD1Q02642 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.19■□□□□ 0.02
EGD1Q02642 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.19■□□□□ 0.02
EGD1Q02642 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.19■□□□□ 0.02
EGD1Q02642 DBP2YNL112W 1641 nt15.17■□□□□ 0.02
EGD1Q02642 SCJ1YMR214W 1134 nt15.12■□□□□ 0.01
EGD1Q02642 CCC1YLR220W 969 nt15.04■□□□□ -0
EGD1Q02642 ATS1YAL020C 1002 nt14.95□□□□□ -0.02
EGD1Q02642 SCR1SCR1 522 nt14.6□□□□□ -0.07
EGD1Q02642 PET122YER153C 765 nt14.59□□□□□ -0.07
EGD1Q02642 YBR190WYBR190W 312 nt14.55□□□□□ -0.08
EGD1Q02642 RVS167YDR388W 1449 nt14.46□□□□□ -0.09
EGD1Q02642 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.45□□□□□ -0.1
EGD1Q02642 RTC3YHR087W 336 nt14.24□□□□□ -0.13
EGD1Q02642 RRN5YLR141W 1092 nt14.2□□□□□ -0.14
EGD1Q02642 RSB1YOR049C 1065 nt14.02□□□□□ -0.17
EGD1Q02642 YDJ1YNL064C 1230 nt14.01□□□□□ -0.17
EGD1Q02642 SHR5YOL110W 714 nt13.97□□□□□ -0.17
EGD1Q02642 SSA3YBL075C 1950 nt13.93□□□□□ -0.18
EGD1Q02642 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.92□□□□□ -0.18
EGD1Q02642 PST2YDR032C 597 nt13.79□□□□□ -0.2
EGD1Q02642 GAR1YHR089C 618 nt13.62□□□□□ -0.23
EGD1Q02642 DEP1YAL013W 1218 nt13.43□□□□□ -0.26
EGD1Q02642 YKL097CYKL097C 411 nt13.42□□□□□ -0.26
EGD1Q02642 URN1YPR152C 1398 nt13.4□□□□□ -0.26
EGD1Q02642 RPN10YHR200W 807 nt13.35□□□□□ -0.27
EGD1Q02642 YNL208WYNL208W 600 nt13.32□□□□□ -0.28
EGD1Q02642 TIR1YER011W 765 nt13.17□□□□□ -0.3
EGD1Q02642 OPI9YLR338W 858 nt13.16□□□□□ -0.3
EGD1Q02642 SHU1YHL006C 453 nt13.15□□□□□ -0.3
EGD1Q02642 SAH1YER043C 1350 nt12.97□□□□□ -0.33
EGD1Q02642 PUT4YOR348C 1884 nt12.94□□□□□ -0.34
EGD1Q02642 SSA1YAL005C 1929 nt12.91□□□□□ -0.34
EGD1Q02642 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.86□□□□□ -0.35
EGD1Q02642 YJR018WYJR018W 363 nt12.82□□□□□ -0.36
EGD1Q02642 PUN1YLR414C 792 nt12.82□□□□□ -0.36
EGD1Q02642 ARE1YCR048W 1833 nt12.78□□□□□ -0.36
EGD1Q02642 YOR139CYOR139C 393 nt12.76□□□□□ -0.37
EGD1Q02642 RPP2BYDR382W 333 nt12.69□□□□□ -0.38
EGD1Q02642 NPL3YDR432W 1245 nt12.69□□□□□ -0.38
EGD1Q02642 YGR021WYGR021W 873 nt12.69□□□□□ -0.38
EGD1Q02642 SRB2YHR041C 633 nt12.65□□□□□ -0.38
EGD1Q02642 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.65□□□□□ -0.38
EGD1Q02642 WWM1YFL010C 636 nt12.6□□□□□ -0.39
EGD1Q02642 HOM6YJR139C 1080 nt12.59□□□□□ -0.39
EGD1Q02642 YJR120WYJR120W 351 nt12.57□□□□□ -0.4
EGD1Q02642 POA1YBR022W 534 nt12.57□□□□□ -0.4
EGD1Q02642 PTC2YER089C 1395 nt12.56□□□□□ -0.4
EGD1Q02642 MNP1YGL068W 585 nt12.53□□□□□ -0.4
EGD1Q02642 YOL037CYOL037C 354 nt12.52□□□□□ -0.41
EGD1Q02642 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.45□□□□□ -0.42
EGD1Q02642 BDH2YAL061W 1254 nt12.43□□□□□ -0.42
EGD1Q02642 RKM5YLR137W 1104 nt12.41□□□□□ -0.42
EGD1Q02642 NAB2YGL122C 1578 nt12.4□□□□□ -0.42
EGD1Q02642 BUD23YCR047C 828 nt12.4□□□□□ -0.42
EGD1Q02642 INM2YDR287W 879 nt12.36□□□□□ -0.43
EGD1Q02642 LSM3YLR438C-A 270 nt12.34□□□□□ -0.43
EGD1Q02642 DAL1YIR027C 1383 nt12.29□□□□□ -0.44
EGD1Q02642 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.27□□□□□ -0.45
EGD1Q02642 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.27□□□□□ -0.45
EGD1Q02642 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.27□□□□□ -0.45
EGD1Q02642 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.27□□□□□ -0.45
EGD1Q02642 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.27□□□□□ -0.45
EGD1Q02642 YBL100CYBL100C 315 nt12.26□□□□□ -0.45
EGD1Q02642 FPR4YLR449W 1179 nt12.25□□□□□ -0.45
EGD1Q02642 BSC6YOL137W 1494 nt12.25□□□□□ -0.45
EGD1Q02642 FIS1YIL065C 468 nt12.19□□□□□ -0.46
EGD1Q02642 TRM9YML014W 840 nt12.17□□□□□ -0.46
EGD1Q02642 YLR281CYLR281C 468 nt12.15□□□□□ -0.46
EGD1Q02642 PHO4YFR034C 939 nt12.14□□□□□ -0.47
EGD1Q02642 PUS2YGL063W 1113 nt12.12□□□□□ -0.47
EGD1Q02642 Q0182Q0182 405 nt12.11□□□□□ -0.47
EGD1Q02642 FUN26YAL022C 1554 nt12.1□□□□□ -0.47
EGD1Q02642 WHI5YOR083W 888 nt12.08□□□□□ -0.48
EGD1Q02642 CCT6YDR188W 1641 nt12□□□□□ -0.49
EGD1Q02642 PAC11YDR488C 1602 nt11.99□□□□□ -0.49
EGD1Q02642 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.95□□□□□ -0.5
EGD1Q02642 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.95□□□□□ -0.5
EGD1Q02642 NVJ2YPR091C 2313 nt11.93□□□□□ -0.5
EGD1Q02642 ALF1YNL148C 765 nt11.93□□□□□ -0.5
EGD1Q02642 IMP2'YIL154C 1041 nt11.91□□□□□ -0.5
EGD1Q02642 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.9□□□□□ -0.5
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