RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	LDB18	Q07887	179 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PPM2	Q08282	695 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	COQ4	O13525	335 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YBR085C-A	O43137	85 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SRD1	P09007	221 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	VAC17	P25591	423 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PEP12	P32854	288 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SKN1	P33336	771 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	STV1	P37296	890 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ATM1	P40416	690 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	HFM1	P51979	1187 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	INM2	Q05533	292 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	EAF1	Q06337	982 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MHF1	Q3E835	90 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TRK1	P12685	1235 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SFL1	P20134	766 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MAL33	P38157	468 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	VHC1	P38329	1120 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	APL6	P46682	809 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SLD3	P53135	668 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PEX8	P53248	589 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	VTC3	Q02725	835 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SND1	Q04007	877 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YER152C	P10356	443 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PRI2	P20457	528 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	CDC5	P32562	705 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	CPR5	P35176	225 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	FTH1	P38310	465 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	CCT6	P39079	546 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	FIR1	P40020	876 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SSN8	P47821	323 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ECL1	P48235	211 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	OKP1	P53298	406 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TSA2	Q04120	196 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YLR283W	Q05867	314 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RDI1	Q12434	202 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YLR462W	O13556	202 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MIP1	P15801	1254 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YHL049C	P38722	271 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ERP5	P38819	212 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YEL075C	P39972	122 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PEA2	P40091	420 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YER189W	P40104	122 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YFL064C	P43540	174 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SPO74	P45819	413 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RRN9	P53437	365 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ZDS2	P54786	942 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ATP14	Q12349	124 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	CDC7	P06243	507 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MTG2	P38860	518 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PHM8	P40025	321 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YJR061W	P40355	935 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SDP1	P40479	209 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	BST1	P43571	1029 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ATG21	Q02887	496 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	CRD1	Q07560	283 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ESC8	Q08119	714 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	KIN82	P25341	720 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ACP1	P32463	125 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	BDF1	P35817	686 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	DYS1	P38791	387 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ECM27	P47144	725 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SNZ1	Q03148	297 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TRM82	Q03774	444 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	BCH1	Q05029	724 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RDR1	Q08904	546 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TSC11	P40061	1430 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ADP1	P25371	1049 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	HSL7	P38274	827 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PNT1	P38969	423 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PHO90	P39535	881 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	IRC22	P40006	225 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	KTR7	P40504	517 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	HOL1	P53389	586 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MNT4	P53745	580 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	UBP2	Q01476	1272 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96

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