Protein–RNA interactions for Protein: Q08119

ESC8, Protein ESC8, yeastyeast

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ESC8Q08119 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.92■■□□□ 1.1
ESC8Q08119 NSR1YGR159C 1245 nt21.58■■□□□ 1.05
ESC8Q08119 NOP1YDL014W 984 nt21.5■■□□□ 1.03
ESC8Q08119 YKL036CYKL036C 393 nt20.1■□□□□ 0.81
ESC8Q08119 Q0297Q0297 156 nt18.91■□□□□ 0.62
ESC8Q08119 YJL027CYJL027C 417 nt18.81■□□□□ 0.6
ESC8Q08119 MDJ1YFL016C 1536 nt18.79■□□□□ 0.6
ESC8Q08119 SRX1YKL086W 384 nt18.77■□□□□ 0.6
ESC8Q08119 SCS3YGL126W 1143 nt18.42■□□□□ 0.54
ESC8Q08119 YCR051WYCR051W 669 nt17.81■□□□□ 0.44
ESC8Q08119 YOL085CYOL085C 342 nt17.4■□□□□ 0.38
ESC8Q08119 PKP1YIL042C 1185 nt17.05■□□□□ 0.32
ESC8Q08119 RPP1BYDL130W 321 nt16.96■□□□□ 0.31
ESC8Q08119 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.77■□□□□ 0.28
ESC8Q08119 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.77■□□□□ 0.28
ESC8Q08119 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.77■□□□□ 0.28
ESC8Q08119 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.77■□□□□ 0.28
ESC8Q08119 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.77■□□□□ 0.28
ESC8Q08119 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.77■□□□□ 0.28
ESC8Q08119 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.77■□□□□ 0.28
ESC8Q08119 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.77■□□□□ 0.28
ESC8Q08119 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.77■□□□□ 0.28
ESC8Q08119 SCJ1YMR214W 1134 nt16.77■□□□□ 0.28
ESC8Q08119 DBP2YNL112W 1641 nt16.77■□□□□ 0.27
ESC8Q08119 ATS1YAL020C 1002 nt16.59■□□□□ 0.25
ESC8Q08119 CCC1YLR220W 969 nt16.58■□□□□ 0.24
ESC8Q08119 PET122YER153C 765 nt16.14■□□□□ 0.17
ESC8Q08119 SCR1SCR1 522 nt16.09■□□□□ 0.17
ESC8Q08119 YBR190WYBR190W 312 nt16■□□□□ 0.15
ESC8Q08119 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.98■□□□□ 0.15
ESC8Q08119 RVS167YDR388W 1449 nt15.88■□□□□ 0.13
ESC8Q08119 RRN5YLR141W 1092 nt15.72■□□□□ 0.11
ESC8Q08119 RTC3YHR087W 336 nt15.64■□□□□ 0.09
ESC8Q08119 RSB1YOR049C 1065 nt15.48■□□□□ 0.07
ESC8Q08119 YDJ1YNL064C 1230 nt15.47■□□□□ 0.07
ESC8Q08119 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.42■□□□□ 0.06
ESC8Q08119 SHR5YOL110W 714 nt15.39■□□□□ 0.05
ESC8Q08119 PST2YDR032C 597 nt15.31■□□□□ 0.04
ESC8Q08119 GAR1YHR089C 618 nt15.05■□□□□ -0
ESC8Q08119 YKL097CYKL097C 411 nt14.86□□□□□ -0.03
ESC8Q08119 DEP1YAL013W 1218 nt14.81□□□□□ -0.04
ESC8Q08119 URN1YPR152C 1398 nt14.75□□□□□ -0.05
ESC8Q08119 YNL208WYNL208W 600 nt14.66□□□□□ -0.06
ESC8Q08119 RPN10YHR200W 807 nt14.65□□□□□ -0.06
ESC8Q08119 SHU1YHL006C 453 nt14.59□□□□□ -0.07
ESC8Q08119 TIR1YER011W 765 nt14.54□□□□□ -0.08
ESC8Q08119 OPI9YLR338W 858 nt14.5□□□□□ -0.09
ESC8Q08119 SAH1YER043C 1350 nt14.29□□□□□ -0.12
ESC8Q08119 SSA1YAL005C 1929 nt14.27□□□□□ -0.12
ESC8Q08119 PUT4YOR348C 1884 nt14.25□□□□□ -0.13
ESC8Q08119 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.24□□□□□ -0.13
ESC8Q08119 YOR139CYOR139C 393 nt14.19□□□□□ -0.14
ESC8Q08119 YJR018WYJR018W 363 nt14.11□□□□□ -0.15
ESC8Q08119 PUN1YLR414C 792 nt14.09□□□□□ -0.15
ESC8Q08119 ARE1YCR048W 1833 nt14.08□□□□□ -0.15
ESC8Q08119 SRB2YHR041C 633 nt14.06□□□□□ -0.16
ESC8Q08119 NPL3YDR432W 1245 nt14.02□□□□□ -0.17
ESC8Q08119 YGR021WYGR021W 873 nt13.99□□□□□ -0.17
ESC8Q08119 RPP2BYDR382W 333 nt13.93□□□□□ -0.18
ESC8Q08119 WWM1YFL010C 636 nt13.93□□□□□ -0.18
ESC8Q08119 HOM6YJR139C 1080 nt13.93□□□□□ -0.18
ESC8Q08119 YJR120WYJR120W 351 nt13.92□□□□□ -0.18
ESC8Q08119 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.9□□□□□ -0.18
ESC8Q08119 MNP1YGL068W 585 nt13.86□□□□□ -0.19
ESC8Q08119 POA1YBR022W 534 nt13.84□□□□□ -0.19
ESC8Q08119 PTC2YER089C 1395 nt13.83□□□□□ -0.19
ESC8Q08119 YOL037CYOL037C 354 nt13.82□□□□□ -0.2
ESC8Q08119 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.74□□□□□ -0.21
ESC8Q08119 RKM5YLR137W 1104 nt13.73□□□□□ -0.21
ESC8Q08119 BDH2YAL061W 1254 nt13.69□□□□□ -0.22
ESC8Q08119 SSA3YBL075C 1950 nt13.65□□□□□ -0.22
ESC8Q08119 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.64□□□□□ -0.23
ESC8Q08119 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.64□□□□□ -0.23
ESC8Q08119 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.64□□□□□ -0.23
ESC8Q08119 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.64□□□□□ -0.23
ESC8Q08119 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.64□□□□□ -0.23
ESC8Q08119 NAB2YGL122C 1578 nt13.62□□□□□ -0.23
ESC8Q08119 BUD23YCR047C 828 nt13.61□□□□□ -0.23
ESC8Q08119 LSM3YLR438C-A 270 nt13.61□□□□□ -0.23
ESC8Q08119 INM2YDR287W 879 nt13.59□□□□□ -0.23
ESC8Q08119 DAL1YIR027C 1383 nt13.51□□□□□ -0.25
ESC8Q08119 YBL100CYBL100C 315 nt13.48□□□□□ -0.25
ESC8Q08119 YLR281CYLR281C 468 nt13.47□□□□□ -0.25
ESC8Q08119 BSC6YOL137W 1494 nt13.47□□□□□ -0.25
ESC8Q08119 FPR4YLR449W 1179 nt13.45□□□□□ -0.26
ESC8Q08119 PUS2YGL063W 1113 nt13.43□□□□□ -0.26
ESC8Q08119 FIS1YIL065C 468 nt13.43□□□□□ -0.26
ESC8Q08119 TRM9YML014W 840 nt13.39□□□□□ -0.27
ESC8Q08119 WHI5YOR083W 888 nt13.37□□□□□ -0.27
ESC8Q08119 PHO4YFR034C 939 nt13.36□□□□□ -0.27
ESC8Q08119 FUN26YAL022C 1554 nt13.33□□□□□ -0.28
ESC8Q08119 CCT6YDR188W 1641 nt13.23□□□□□ -0.29
ESC8Q08119 MOT3YMR070W 1473 nt13.22□□□□□ -0.29
ESC8Q08119 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.13□□□□□ -0.31
ESC8Q08119 DSK2YMR276W 1122 nt13.13□□□□□ -0.31
ESC8Q08119 IMP2'YIL154C 1041 nt13.12□□□□□ -0.31
ESC8Q08119 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.11□□□□□ -0.31
ESC8Q08119 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.11□□□□□ -0.31
ESC8Q08119 ALF1YNL148C 765 nt13.09□□□□□ -0.31
ESC8Q08119 YPR011CYPR011C 981 nt13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.2 ms