Protein–RNA interactions for Protein: Q05931

SSQ1, Heat shock protein SSQ1, mitochondrial, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1Q05931 NSR1YGR159C 1245 nt19.43■□□□□ 0.7
SSQ1Q05931 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.31■□□□□ 0.68
SSQ1Q05931 NOP1YDL014W 984 nt18.74■□□□□ 0.59
SSQ1Q05931 MDJ1YFL016C 1536 nt17.44■□□□□ 0.38
SSQ1Q05931 YKL036CYKL036C 393 nt16.97■□□□□ 0.31
SSQ1Q05931 SRX1YKL086W 384 nt16.29■□□□□ 0.2
SSQ1Q05931 Q0297Q0297 156 nt16.21■□□□□ 0.19
SSQ1Q05931 YJL027CYJL027C 417 nt16.17■□□□□ 0.18
SSQ1Q05931 YCR051WYCR051W 669 nt15.49■□□□□ 0.07
SSQ1Q05931 DBP2YNL112W 1641 nt15.25■□□□□ 0.03
SSQ1Q05931 SCS3YGL126W 1143 nt15.23■□□□□ 0.03
SSQ1Q05931 YBR190WYBR190W 312 nt15□□□□□ -0.01
SSQ1Q05931 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SSQ1Q05931 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SSQ1Q05931 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SSQ1Q05931 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SSQ1Q05931 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SSQ1Q05931 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SSQ1Q05931 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SSQ1Q05931 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SSQ1Q05931 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.84□□□□□ -0.03
SSQ1Q05931 CCC1YLR220W 969 nt14.78□□□□□ -0.04
SSQ1Q05931 SSA3YBL075C 1950 nt14.76□□□□□ -0.05
SSQ1Q05931 RTC3YHR087W 336 nt14.73□□□□□ -0.05
SSQ1Q05931 YOL085CYOL085C 342 nt14.67□□□□□ -0.06
SSQ1Q05931 RPP1BYDL130W 321 nt14.57□□□□□ -0.08
SSQ1Q05931 RVS167YDR388W 1449 nt14.49□□□□□ -0.09
SSQ1Q05931 PKP1YIL042C 1185 nt14.48□□□□□ -0.09
SSQ1Q05931 SCJ1YMR214W 1134 nt14.16□□□□□ -0.14
SSQ1Q05931 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.99□□□□□ -0.17
SSQ1Q05931 PET122YER153C 765 nt13.91□□□□□ -0.18
SSQ1Q05931 PUT4YOR348C 1884 nt13.85□□□□□ -0.19
SSQ1Q05931 SHR5YOL110W 714 nt13.83□□□□□ -0.2
SSQ1Q05931 SCR1SCR1 522 nt13.81□□□□□ -0.2
SSQ1Q05931 URN1YPR152C 1398 nt13.61□□□□□ -0.23
SSQ1Q05931 ATS1YAL020C 1002 nt13.58□□□□□ -0.24
SSQ1Q05931 YDJ1YNL064C 1230 nt13.54□□□□□ -0.24
SSQ1Q05931 DEP1YAL013W 1218 nt13.53□□□□□ -0.24
SSQ1Q05931 RRN5YLR141W 1092 nt13.51□□□□□ -0.25
SSQ1Q05931 OPI9YLR338W 858 nt13.46□□□□□ -0.25
SSQ1Q05931 POA1YBR022W 534 nt13.44□□□□□ -0.26
SSQ1Q05931 RPN10YHR200W 807 nt13.43□□□□□ -0.26
SSQ1Q05931 SAH1YER043C 1350 nt13.43□□□□□ -0.26
SSQ1Q05931 ARE1YCR048W 1833 nt13.41□□□□□ -0.26
SSQ1Q05931 YNL208WYNL208W 600 nt13.32□□□□□ -0.28
SSQ1Q05931 GAR1YHR089C 618 nt13.31□□□□□ -0.28
SSQ1Q05931 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.29□□□□□ -0.28
SSQ1Q05931 BSC6YOL137W 1494 nt13.23□□□□□ -0.29
SSQ1Q05931 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.22□□□□□ -0.29
SSQ1Q05931 RSB1YOR049C 1065 nt13.2□□□□□ -0.3
SSQ1Q05931 PUN1YLR414C 792 nt13.11□□□□□ -0.31
SSQ1Q05931 BUD23YCR047C 828 nt13.03□□□□□ -0.32
SSQ1Q05931 YJR018WYJR018W 363 nt12.99□□□□□ -0.33
SSQ1Q05931 PTC2YER089C 1395 nt12.97□□□□□ -0.33
SSQ1Q05931 SPT5YML010W 3192 nt12.94□□□□□ -0.34
SSQ1Q05931 SSA4YER103W 1929 nt12.87□□□□□ -0.35
SSQ1Q05931 NAB2YGL122C 1578 nt12.86□□□□□ -0.35
SSQ1Q05931 TIR1YER011W 765 nt12.85□□□□□ -0.35
SSQ1Q05931 RPP2BYDR382W 333 nt12.73□□□□□ -0.37
SSQ1Q05931 SSA1YAL005C 1929 nt12.7□□□□□ -0.38
SSQ1Q05931 NVJ2YPR091C 2313 nt12.68□□□□□ -0.38
SSQ1Q05931 PAC11YDR488C 1602 nt12.66□□□□□ -0.38
SSQ1Q05931 FPR4YLR449W 1179 nt12.65□□□□□ -0.38
SSQ1Q05931 DAL1YIR027C 1383 nt12.62□□□□□ -0.39
SSQ1Q05931 FPS1YLL043W 2010 nt12.62□□□□□ -0.39
SSQ1Q05931 INM2YDR287W 879 nt12.6□□□□□ -0.39
SSQ1Q05931 PST2YDR032C 597 nt12.59□□□□□ -0.39
SSQ1Q05931 YJR120WYJR120W 351 nt12.56□□□□□ -0.4
SSQ1Q05931 FIS1YIL065C 468 nt12.54□□□□□ -0.4
SSQ1Q05931 MEP2YNL142W 1500 nt12.48□□□□□ -0.41
SSQ1Q05931 PHO4YFR034C 939 nt12.47□□□□□ -0.41
SSQ1Q05931 YBL100CYBL100C 315 nt12.39□□□□□ -0.43
SSQ1Q05931 BDF1YLR399C 2061 nt12.38□□□□□ -0.43
SSQ1Q05931 BDH2YAL061W 1254 nt12.34□□□□□ -0.43
SSQ1Q05931 SRB2YHR041C 633 nt12.33□□□□□ -0.44
SSQ1Q05931 YPS1YLR120C 1710 nt12.31□□□□□ -0.44
SSQ1Q05931 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.27□□□□□ -0.45
SSQ1Q05931 DCW1YKL046C 1350 nt12.24□□□□□ -0.45
SSQ1Q05931 FUN26YAL022C 1554 nt12.22□□□□□ -0.45
SSQ1Q05931 TRM9YML014W 840 nt12.22□□□□□ -0.45
SSQ1Q05931 WWM1YFL010C 636 nt12.21□□□□□ -0.45
SSQ1Q05931 TAT1YBR069C 1860 nt12.21□□□□□ -0.46
SSQ1Q05931 ALF1YNL148C 765 nt12.19□□□□□ -0.46
SSQ1Q05931 YDR095CYDR095C 411 nt12.18□□□□□ -0.46
SSQ1Q05931 YMR090WYMR090W 684 nt12.17□□□□□ -0.46
SSQ1Q05931 LSM3YLR438C-A 270 nt12.16□□□□□ -0.46
SSQ1Q05931 YGR021WYGR021W 873 nt12.13□□□□□ -0.47
SSQ1Q05931 SHU1YHL006C 453 nt12.13□□□□□ -0.47
SSQ1Q05931 EMI2YDR516C 1503 nt12.11□□□□□ -0.47
SSQ1Q05931 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.06□□□□□ -0.48
SSQ1Q05931 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.06□□□□□ -0.48
SSQ1Q05931 YBR220CYBR220C 1683 nt12.06□□□□□ -0.48
SSQ1Q05931 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.04□□□□□ -0.48
SSQ1Q05931 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.04□□□□□ -0.48
SSQ1Q05931 CCT6YDR188W 1641 nt12.03□□□□□ -0.48
SSQ1Q05931 YKL097CYKL097C 411 nt12.01□□□□□ -0.49
SSQ1Q05931 RPP2AYOL039W 321 nt12.01□□□□□ -0.49
SSQ1Q05931 HOM6YJR139C 1080 nt11.99□□□□□ -0.49
SSQ1Q05931 YDL221WYDL221W 552 nt11.96□□□□□ -0.49
SSQ1Q05931 SDH1YKL148C 1923 nt11.92□□□□□ -0.5
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