RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	SWH1	P35845	1188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	SPO22	P40511	975 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	YPT11	P48559	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	COX18	P53239	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	SEC39	Q12745	709 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	ERG11	P10614	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	THI4	P32318	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	HOG1	P32485	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	YER130C	P39959	443 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	RFX1	P48743	811 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	WAR1	Q03631	944 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	NHX1	Q04121	633 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	HFD1	Q04458	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	SWI1	P09547	1314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	SRD1	P09007	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	PET123	P17558	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	KCC4	P25389	1037 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	DPB3	P27344	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	GSY2	P27472	705 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	YMC1	P32331	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	HSL7	P38274	827 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	MNN1	P39106	762 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	MAL13	P53338	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	CTI6	Q08923	506 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	MRP7	P12687	371 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	RPO26	P20435	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	PRP28	P23394	588 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	PCH2	P38126	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	MAL33	P38157	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	GAT1	P43574	510 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	MPS3	P47069	682 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	YGL242C	P53066	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	NMA2	P53204	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	SNF12	P53628	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	VPS75	P53853	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	VPS36	Q06696	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	APL4	Q12028	832 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	ATG9	Q12142	997 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	LAM4	P38800	1345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	YPT7	P32939	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	PXL1	P36166	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	PSY4	P38193	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	DSS1	P39112	969 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	PIG2	P40187	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	SPC98	P53540	846 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	ARP5	P53946	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	FMP30	Q02883	468 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	PDR18	P53756	1333 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POP4	YBR257W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	RAD3	P06839	778 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	HMG1	P12683	1054 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	SWC3	P31376	625 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	YEL043W	P32618	956 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	APN2	P38207	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	KHA1	P40309	873 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	ALF1	P53904	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	SEC5	P89102	971 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	RBA50	Q04418	439 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	DCS2	Q12123	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	PHO13	P19881	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	CDC15	P27636	974 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	CTP1	P38152	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	VPS8	P39702	1274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	YIL077C	P40508	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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