RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A ABP1P15891 592 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
YPL060C-AYPL060C-A SEC61P32915 480 aa2.42□□□□□ -2.02
YPL060C-AYPL060C-A JIP4Q03361 876 aa2.42□□□□□ -2.02
YPL060C-AYPL060C-A PML39Q03760 334 aa2.42□□□□□ -2.02
YPL060C-AYPL060C-A MGA2P40578 1113 aa2.42□□□□□ -2.02
YPL060C-AYPL060C-A CHL1P22516 861 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
YPL060C-AYPL060C-A PTC2P39966 464 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
YPL060C-AYPL060C-A VMA1P17255 1071 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
YPL060C-AYPL060C-A GCR2Q01722 534 aa2.39□□□□□ -2.03
YPL060C-AYPL060C-A NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data2.39□□□□□ -2.03not detected
YPL060C-AYPL060C-A YEL023CP39992 682 aa2.39□□□□□ -2.03
YPL060C-AYPL060C-A YLR271WQ06152 274 aa2.39□□□□□ -2.03
YPL060C-AYPL060C-A YEL077CQ3E7X8 1277 aa2.39□□□□□ -2.03
YPL060C-AYPL060C-A PAT1P25644 796 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
YPL060C-AYPL060C-A MST1P07236 462 aa2.37□□□□□ -2.03
YPL060C-AYPL060C-A PRE3P38624 215 aa2.37□□□□□ -2.03
YPL060C-AYPL060C-A RGA2Q06407 1009 aa2.37□□□□□ -2.03
YPL060C-AYPL060C-A ERG12P07277 443 aa2.36□□□□□ -2.03
YPL060C-AYPL060C-A RGA1P39083 1007 aa2.35□□□□□ -2.03
YPL060C-AYPL060C-A SET1P38827 1080 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
YPL060C-AYPL060C-A SRF1Q12516 437 aa2.34□□□□□ -2.03
YPL060C-AYPL060C-A SPT23P35210 1082 aa2.34□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A CST9Q06032 482 aa2.33□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A GCD11P32481 527 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A IOC2Q12072 812 aa2.32□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A PTC4P38089 393 aa2.32□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A SPT16P32558 1035 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A RAD54P32863 898 aa2.3□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A XDJ1P39102 459 aa2.3□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A GUT1P32190 709 aa2.3□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A HAP5Q02516 242 aa2.29□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A MRF1P30775 413 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A MID1P41821 548 aa2.29□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A HST3P53687 447 aa2.28□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A YMR196WQ04336 1088 aa2.28□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A TYW1Q08960 810 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A STS1P38637 319 aa2.28□□□□□ -2.04
YPL060C-AYPL060C-A TRK1P12685 1235 aa2.27□□□□□ -2.05
YPL060C-AYPL060C-A VHR2P40041 505 aa2.27□□□□□ -2.05
YPL060C-AYPL060C-A PSD2P53037 1138 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
YPL060C-AYPL060C-A TBF1Q02457 562 aa2.26□□□□□ -2.05
YPL060C-AYPL060C-A COQ8P27697 501 aa2.26□□□□□ -2.05
YPL060C-AYPL060C-A PTC3P34221 468 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
YPL060C-AYPL060C-A SPB4P25808 606 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
YPL060C-AYPL060C-A SAM3Q08986 587 aa2.24□□□□□ -2.05
YPL060C-AYPL060C-A RCR1P38212 213 aa2.24□□□□□ -2.05
YPL060C-AYPL060C-A NMA111P53920 997 aa2.24□□□□□ -2.05
YPL060C-AYPL060C-A YRR1Q12172 810 aa2.24□□□□□ -2.05
YPL060C-AYPL060C-A VPS29P38759 282 aa2.23□□□□□ -2.05
YPL060C-AYPL060C-A DPL1Q05567 589 aa2.22□□□□□ -2.05
YPL060C-AYPL060C-A KIP2P28743 706 aa2.22□□□□□ -2.05
YPL060C-AYPL060C-A DAN4P47179 1161 aa2.21□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A ARH1P48360 493 aa2.21□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A VPS70P47161 811 aa2.21□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A ISU2Q12056 156 aa2.21□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A TUM1Q08686 304 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data2.2□□□□□ -2.06not detected
YPL060C-AYPL060C-A MAK11P20484 414 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A YLR346CQ06139 101 aa2.19□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A BRE2P43132 505 aa2.19□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A MPC54Q08550 464 aa2.18□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A BNI4P53858 892 aa2.17□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A UGA3P26370 528 aa2.17□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A RRN7P40992 514 aa2.16□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A KXD1P53158 218 aa2.16□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A CDC73Q06697 393 aa2.16□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A ATF2P53296 535 aa2.16□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A SAS4Q04003 481 aa2.16□□□□□ -2.06
YPL060C-AYPL060C-A AMS1P22855 1083 aa2.15□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A PRT1P06103 763 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A SBP1P10080 294 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A NUD1P32336 851 aa2.13□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A YGR273CP53329 174 aa2.12□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A MPH3P0CE00 602 aa2.12□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A EDS1P38073 919 aa2.12□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A AI4P03878 556 aa2.12□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A RAM2P29703 316 aa2.12□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A RAS1P01119 309 aa2.11□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A YPR109WQ06104 294 aa2.11□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A REF2P42073 533 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A PDR1P12383 1068 aa2.11□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A YPL062WQ02781 134 aa2.11□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A KEX1P09620 729 aa2.1□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A IXR1P33417 597 aa2.09□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A CSC1Q06538 782 aa2.09□□□□□ -2.07
YPL060C-AYPL060C-A SLI15P38283 698 aa2.09□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A YML082WQ04533 649 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A TFB4Q12004 338 aa2.08□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A RPP2BP02400 110 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A ASH1P34233 588 aa2.07□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A YGR035CP53222 116 aa2.07□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A PUS5Q06244 254 aa2.07□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A YDR444WQ04093 687 aa2.06□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A SLY41P22215 453 aa2.06□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A SRC1Q03707 834 aa2.05□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A KEX2P13134 814 aa2.05□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A DLD3P39976 496 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
YPL060C-AYPL060C-A CDC4P07834 779 aa2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.4 ms