RNA–Protein interactions for RNA: YML057W

CMP2, Transcript of Calcineurin A, yeast

Gene CMP2, Length 1,815 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMP2	YML057W	MMS1	Q06211	1407 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CMP2	YML057W	PAF1	P38351	445 aa		12.15	□□□□□ -0.46
CMP2	YML057W	YGR130C	P53278	816 aa		12.14	□□□□□ -0.47
CMP2	YML057W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
CMP2	YML057W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CMP2	YML057W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CMP2	YML057W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CMP2	YML057W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CMP2	YML057W	CDC45	Q08032	650 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CMP2	YML057W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CMP2	YML057W	VPS15	P22219	1454 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CMP2	YML057W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
CMP2	YML057W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
CMP2	YML057W	EDE1	P34216	1381 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CMP2	YML057W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CMP2	YML057W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CMP2	YML057W	RPO31	P04051	1460 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CMP2	YML057W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CMP2	YML057W	CTR9	P89105	1077 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CMP2	YML057W	DNF1	P32660	1571 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CMP2	YML057W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CMP2	YML057W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CMP2	YML057W	GCN2	P15442	1659 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	PCT1	P13259	424 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	ULS1	Q08562	1619 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	PDS5	Q04264	1277 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	DJP1	P40564	432 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	ATG2	P53855	1592 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	MSP1	P28737	362 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CMP2	YML057W	SPT21	P35209	758 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CMP2	YML057W	YPP1	P46951	817 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CMP2	YML057W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CMP2	YML057W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
CMP2	YML057W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
CMP2	YML057W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
CMP2	YML057W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
CMP2	YML057W	SMC3	P47037	1230 aa		11.83	□□□□□ -0.51
CMP2	YML057W	GDB1	Q06625	1536 aa		11.82	□□□□□ -0.52
CMP2	YML057W	ENV11	P53246	860 aa		11.82	□□□□□ -0.52
CMP2	YML057W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
CMP2	YML057W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
CMP2	YML057W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
CMP2	YML057W	TRM3	Q07527	1436 aa		11.8	□□□□□ -0.52
CMP2	YML057W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
CMP2	YML057W	NST1	P53935	1240 aa		11.79	□□□□□ -0.52
CMP2	YML057W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
CMP2	YML057W	IOC4	Q04213	475 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CMP2	YML057W	RAD26	P40352	1085 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CMP2	YML057W	CAT8	P39113	1433 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CMP2	YML057W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CMP2	YML057W	YBT1	P32386	1661 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CMP2	YML057W	SPC110	P32380	944 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CMP2	YML057W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CMP2	YML057W	TEA1	P47988	759 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CMP2	YML057W	TPM2	P40414	161 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.7	□□□□□ -0.54	not detected
CMP2	YML057W	YDL144C	Q07589	356 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	SNT2	P53127	1403 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	SCT1	P32784	759 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	TCD1	P38756	429 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	ESC2	Q06340	456 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	TY2B-C	P25384	1770 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	LCD1	Q04377	747 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CMP2	YML057W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CMP2	YML057W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CMP2	YML057W	COG8	Q04632	607 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CMP2	YML057W	RAD2	P07276	1031 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CMP2	YML057W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CMP2	YML057W	CIN4	P39110	191 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CMP2	YML057W	HAP5	Q02516	242 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CMP2	YML057W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CMP2	YML057W	ITC1	P53125	1264 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CMP2	YML057W	VTH1	P40438	1549 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CMP2	YML057W	VTH2	P40890	1549 aa		11.59	□□□□□ -0.55
CMP2	YML057W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
CMP2	YML057W	VPS60	Q03390	229 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CMP2	YML057W	DNF2	Q12675	1612 aa		11.58	□□□□□ -0.56
CMP2	YML057W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
CMP2	YML057W	RSC1	P53236	928 aa		11.58	□□□□□ -0.56

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