RNA–Protein interactions for RNA: YKL169C

YKL169C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL169C, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL169CYKL169C SAM3Q08986 587 aa8.64□□□□□ -1.03
YKL169CYKL169C GUT1P32190 709 aa8.61□□□□□ -1.03
YKL169CYKL169C RLF2Q12495 606 aa8.61□□□□□ -1.03
YKL169CYKL169C MST1P07236 462 aa8.59□□□□□ -1.03
YKL169CYKL169C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
YKL169CYKL169C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
YKL169CYKL169C VHR2P40041 505 aa8.58□□□□□ -1.04
YKL169CYKL169C ATH1P48016 1211 aa8.58□□□□□ -1.04
YKL169CYKL169C SOL3P38858 249 aa8.56□□□□□ -1.04
YKL169CYKL169C YGR273CP53329 174 aa8.56□□□□□ -1.04
YKL169CYKL169C GUA1P38625 525 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
YKL169CYKL169C NST1P53935 1240 aa8.53□□□□□ -1.04
YKL169CYKL169C ATF2P53296 535 aa8.51□□□□□ -1.05
YKL169CYKL169C KEX1P09620 729 aa8.5□□□□□ -1.05
YKL169CYKL169C HPC2Q01448 625 aa8.5□□□□□ -1.05
YKL169CYKL169C GYP5Q12344 894 aa8.5□□□□□ -1.05
YKL169CYKL169C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data8.49□□□□□ -1.05not detected
YKL169CYKL169C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YKL169CYKL169C RAD54P32863 898 aa8.46□□□□□ -1.06
YKL169CYKL169C HGH1P48362 394 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
YKL169CYKL169C ORC6P38826 435 aa8.44□□□□□ -1.06
YKL169CYKL169C KIC1P38692 1080 aa8.43□□□□□ -1.06
YKL169CYKL169C ILV3P39522 585 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
YKL169CYKL169C YOL036WQ08206 761 aa8.42□□□□□ -1.06
YKL169CYKL169C MPH3P0CE00 602 aa8.39□□□□□ -1.07
YKL169CYKL169C TFB3Q03290 321 aa8.39□□□□□ -1.07
YKL169CYKL169C AI4P03878 556 aa8.38□□□□□ -1.07
YKL169CYKL169C DCW1P36091 449 aa8.38□□□□□ -1.07
YKL169CYKL169C GTT3P39996 337 aa8.38□□□□□ -1.07
YKL169CYKL169C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
YKL169CYKL169C HTA1P04911 132 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YKL169CYKL169C HTA2P04912 132 aa8.34□□□□□ -1.07
YKL169CYKL169C RGR1P19263 1082 aa8.34□□□□□ -1.07
YKL169CYKL169C SET4P42948 560 aa8.34□□□□□ -1.07
YKL169CYKL169C CSN12P47130 423 aa8.34□□□□□ -1.07
YKL169CYKL169C MSB4Q12317 492 aa8.34□□□□□ -1.07
YKL169CYKL169C SSA2P10592 639 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YKL169CYKL169C KTR1P27810 393 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YKL169CYKL169C PKC1P24583 1151 aa8.31□□□□□ -1.08
YKL169CYKL169C BRL1P38770 471 aa8.3□□□□□ -1.08
YKL169CYKL169C MVP1P40959 511 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YKL169CYKL169C TEA1P47988 759 aa8.3□□□□□ -1.08
YKL169CYKL169C CLB5P30283 435 aa8.28□□□□□ -1.08
YKL169CYKL169C SLI15P38283 698 aa8.28□□□□□ -1.08
YKL169CYKL169C DAN4P47179 1161 aa8.27□□□□□ -1.09
YKL169CYKL169C GLN1P32288 370 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
YKL169CYKL169C YEL023CP39992 682 aa8.25□□□□□ -1.09
YKL169CYKL169C CSC1Q06538 782 aa8.25□□□□□ -1.09
YKL169CYKL169C HST2P53686 357 aa8.23□□□□□ -1.09
YKL169CYKL169C BIM1P40013 344 aa8.22□□□□□ -1.09
YKL169CYKL169C NIS1P53939 407 aa8.22□□□□□ -1.09
YKL169CYKL169C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
YKL169CYKL169C PTC4P38089 393 aa8.21□□□□□ -1.1
YKL169CYKL169C EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
YKL169CYKL169C FPK1P53739 893 aa8.2□□□□□ -1.1
YKL169CYKL169C YPR109WQ06104 294 aa8.2□□□□□ -1.1
YKL169CYKL169C CDC73Q06697 393 aa8.2□□□□□ -1.1
YKL169CYKL169C TFB4Q12004 338 aa8.2□□□□□ -1.1
YKL169CYKL169C TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
YKL169CYKL169C SIT4P20604 311 aa8.19□□□□□ -1.1
YKL169CYKL169C ATG32P40458 529 aa8.19□□□□□ -1.1
YKL169CYKL169C WSC3Q12215 556 aa8.19□□□□□ -1.1
YKL169CYKL169C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
YKL169CYKL169C YJL007CP47080 104 aa8.17□□□□□ -1.1
YKL169CYKL169C JIP4Q03361 876 aa8.17□□□□□ -1.1
YKL169CYKL169C VNX1P42839 908 aa8.14□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C SUB2Q07478 446 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C MMP1Q12372 583 aa8.14□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C BIO2P32451 375 aa8.13□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C RAD59Q12223 238 aa8.13□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C SCJ1P25303 377 aa8.12□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C YMR196WQ04336 1088 aa8.12□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C TIF1P10081 395 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C ESS1P22696 170 aa8.11□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C CSE4P36012 229 aa8.11□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C YBL036CP38197 257 aa8.11□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C IOC2Q12072 812 aa8.11□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C YBL029C-AQ3E756 94 aa8.11□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C ERG12P07277 443 aa8.09□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C YJU3P28321 313 aa8.09□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C ULI1P43604 169 aa8.09□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
YKL169CYKL169C SSA1P10591 642 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C RSC30P38781 883 aa8.08□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C DPL1Q05567 589 aa8.08□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C MPC54Q08550 464 aa8.08□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C MID1P41821 548 aa8.07□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C SUP45P12385 437 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C PEX21P50091 288 aa8.06□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C TTI1P36097 1038 aa8.05□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C GEF1P37020 779 aa8.05□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C RPL34BP40525 121 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C RTF1P53064 558 aa8.05□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C PML39Q03760 334 aa8.04□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C SSA4P22202 642 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C ISU2Q12056 156 aa8.03□□□□□ -1.12
YKL169CYKL169C YRR1Q12172 810 aa8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.4 ms