RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W HGH1P48362 394 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
VHS1YDR247W PIB1Q06651 286 aa8.78□□□□□ -1
VHS1YDR247W ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
VHS1YDR247W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
VHS1YDR247W ATH1P48016 1211 aa8.73□□□□□ -1.01
VHS1YDR247W ATF2P53296 535 aa8.73□□□□□ -1.01
VHS1YDR247W VHR2P40041 505 aa8.72□□□□□ -1.01
VHS1YDR247W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
VHS1YDR247W GUT1P32190 709 aa8.7□□□□□ -1.02
VHS1YDR247W UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
VHS1YDR247W GUA1P38625 525 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
VHS1YDR247W YDR090CQ03193 310 aa8.68□□□□□ -1.02
VHS1YDR247W YBL029C-AQ3E756 94 aa8.67□□□□□ -1.02
VHS1YDR247W KIC1P38692 1080 aa8.66□□□□□ -1.02
VHS1YDR247W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
VHS1YDR247W SGS1P35187 1447 aa8.65□□□□□ -1.02
VHS1YDR247W SAM3Q08986 587 aa8.65□□□□□ -1.02
VHS1YDR247W GTT3P39996 337 aa8.62□□□□□ -1.03
VHS1YDR247W VNX1P42839 908 aa8.62□□□□□ -1.03
VHS1YDR247W YGR273CP53329 174 aa8.62□□□□□ -1.03
VHS1YDR247W HPC2Q01448 625 aa8.61□□□□□ -1.03
VHS1YDR247W RAD54P32863 898 aa8.61□□□□□ -1.03
VHS1YDR247W GYP5Q12344 894 aa8.61□□□□□ -1.03
VHS1YDR247W WSC3Q12215 556 aa8.59□□□□□ -1.03
VHS1YDR247W KEX1P09620 729 aa8.58□□□□□ -1.04
VHS1YDR247W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
VHS1YDR247W SPP1Q03012 353 aa8.56□□□□□ -1.04
VHS1YDR247W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data8.55□□□□□ -1.04not detected
VHS1YDR247W SOL3P38858 249 aa8.55□□□□□ -1.04
VHS1YDR247W TFB3Q03290 321 aa8.54□□□□□ -1.04
VHS1YDR247W SSA2P10592 639 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
VHS1YDR247W BRL1P38770 471 aa8.53□□□□□ -1.04
VHS1YDR247W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
VHS1YDR247W DCW1P36091 449 aa8.52□□□□□ -1.05
VHS1YDR247W TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
VHS1YDR247W CSN12P47130 423 aa8.49□□□□□ -1.05
VHS1YDR247W YOL036WQ08206 761 aa8.49□□□□□ -1.05
VHS1YDR247W ORC6P38826 435 aa8.48□□□□□ -1.05
VHS1YDR247W HTA1P04911 132 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
VHS1YDR247W HTA2P04912 132 aa8.47□□□□□ -1.05
VHS1YDR247W TEA1P47988 759 aa8.47□□□□□ -1.05
VHS1YDR247W NST1P53935 1240 aa8.47□□□□□ -1.05
VHS1YDR247W SET4P42948 560 aa8.46□□□□□ -1.06
VHS1YDR247W MSB4Q12317 492 aa8.44□□□□□ -1.06
VHS1YDR247W SSN2P38931 1420 aa8.44□□□□□ -1.06
VHS1YDR247W AI4P03878 556 aa8.43□□□□□ -1.06
VHS1YDR247W MPH3P0CE00 602 aa8.43□□□□□ -1.06
VHS1YDR247W PKC1P24583 1151 aa8.43□□□□□ -1.06
VHS1YDR247W CLB5P30283 435 aa8.42□□□□□ -1.06
VHS1YDR247W RGR1P19263 1082 aa8.41□□□□□ -1.06
VHS1YDR247W ULI1P43604 169 aa8.41□□□□□ -1.06
VHS1YDR247W ILV3P39522 585 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
VHS1YDR247W EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W MVP1P40959 511 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W YJL007CP47080 104 aa8.37□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W INO80P53115 1489 aa8.37□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W KTR1P27810 393 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W BIM1P40013 344 aa8.36□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W CSC1Q06538 782 aa8.36□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W IOC2Q12072 812 aa8.36□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W SLI15P38283 698 aa8.35□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W YEL023CP39992 682 aa8.35□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W DAN4P47179 1161 aa8.35□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W LDB19Q12502 818 aa8.35□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W YMR196WQ04336 1088 aa8.34□□□□□ -1.07
VHS1YDR247W GLN1P32288 370 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W ATG32P40458 529 aa8.32□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W FKH1P40466 484 aa8.32□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W YJL171CP46992 396 aa8.32□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W NIS1P53939 407 aa8.32□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W YPR109WQ06104 294 aa8.32□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W YBL036CP38197 257 aa8.31□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W HST2P53686 357 aa8.31□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W FPK1P53739 893 aa8.31□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W TFB4Q12004 338 aa8.3□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W PTC4P38089 393 aa8.29□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W PEX21P50091 288 aa8.28□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W CDC73Q06697 393 aa8.28□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W MMP1Q12372 583 aa8.28□□□□□ -1.08
VHS1YDR247W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W SSA1P10591 642 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W TIF1P10081 395 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W JIP4Q03361 876 aa8.25□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W ESS1P22696 170 aa8.24□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W RAD59Q12223 238 aa8.24□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W SSA4P22202 642 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W RTG1P32607 177 aa8.23□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W SCJ1P25303 377 aa8.22□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W BIO2P32451 375 aa8.22□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W CSE4P36012 229 aa8.22□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W GEF1P37020 779 aa8.22□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
VHS1YDR247W SIT4P20604 311 aa8.22□□□□□ -1.09
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