RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LETMD1-238	ENST00000623495	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNA4	P22459	653 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LETMD1-238	ENST00000623495	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LETMD1-238	ENST00000623495	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LETMD1-238	ENST00000623495	SYNJ2	O15056	1496 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LETMD1-238	ENST00000623495	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-238	ENST00000623495	GRIN2A	Q12879	1464 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-238	ENST00000623495	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-238	ENST00000623495	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-238	ENST00000623495	CHD1	O14646	1710 aa		11.27	□□□□□ -0.6
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNH8	Q96L42	1107 aa		11.27	□□□□□ -0.6
LETMD1-238	ENST00000623495	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		11.27	□□□□□ -0.61
LETMD1-238	ENST00000623495	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
LETMD1-238	ENST00000623495	PBRM1	Q86U86	1689 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC24A1	O60721	1099 aa		11.26	□□□□□ -0.61
LETMD1-238	ENST00000623495	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAMTS12	P58397	1594 aa		11.25	□□□□□ -0.61
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR97	A6NE52	1622 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-238	ENST00000623495	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-238	ENST00000623495	CEP170	Q5SW79	1584 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF11	O15085	1522 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXD1	Q16676	465 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-238	ENST00000623495	PRX	Q9BXM0	1461 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-238	ENST00000623495	EEA1	Q15075	1411 aa		11.21	□□□□□ -0.62
LETMD1-238	ENST00000623495	PTPRG	P23470	1445 aa		11.21	□□□□□ -0.62
LETMD1-238	ENST00000623495	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		11.21	□□□□□ -0.62
LETMD1-238	ENST00000623495	NUP160	Q12769	1436 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA3	Q08378	1498 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LETMD1-238	ENST00000623495	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LETMD1-238	ENST00000623495	ARAP1	Q96P48	1450 aa		11.15	□□□□□ -0.63
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LETMD1-238	ENST00000623495	CUL7	Q14999	1698 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LETMD1-238	ENST00000623495	APLP2	Q06481	763 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LETMD1-238	ENST00000623495	CLIP1	P30622	1438 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LETMD1-238	ENST00000623495	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LETMD1-238	ENST00000623495	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LETMD1-238	ENST00000623495	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LETMD1-238	ENST00000623495	IQGAP2	Q13576	1575 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LETMD1-238	ENST00000623495	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LETMD1-238	ENST00000623495	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		11.11	□□□□□ -0.63
LETMD1-238	ENST00000623495	CEP162	Q5TB80	1403 aa		11.09	□□□□□ -0.63
LETMD1-238	ENST00000623495	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		11.08	□□□□□ -0.63
LETMD1-238	ENST00000623495	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
LETMD1-238	ENST00000623495	DISP1	Q96F81	1524 aa		11.05	□□□□□ -0.64
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		11.05	□□□□□ -0.64
LETMD1-238	ENST00000623495	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
LETMD1-238	ENST00000623495	ITGAE	P38570	1179 aa		11.02	□□□□□ -0.65
LETMD1-238	ENST00000623495	UACA	Q9BZF9	1416 aa		11.02	□□□□□ -0.65
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		11.02	□□□□□ -0.65
LETMD1-238	ENST00000623495	KIF21B	O75037	1637 aa		11	□□□□□ -0.65
LETMD1-238	ENST00000623495	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		10.99	□□□□□ -0.65
LETMD1-238	ENST00000623495	BCL11A	Q9H165	835 aa		10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-238	ENST00000623495	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
LETMD1-238	ENST00000623495	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA0556	O60303	1618 aa		10.96	□□□□□ -0.65
LETMD1-238	ENST00000623495	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		10.96	□□□□□ -0.66
LETMD1-238	ENST00000623495	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.66
LETMD1-238	ENST00000623495	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		10.95	□□□□□ -0.66
LETMD1-238	ENST00000623495	ASXL2	Q76L83	1435 aa		10.95	□□□□□ -0.66
LETMD1-238	ENST00000623495	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		10.94	□□□□□ -0.66
LETMD1-238	ENST00000623495	FMN1	Q68DA7	1419 aa		10.94	□□□□□ -0.66
LETMD1-238	ENST00000623495	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		10.93	□□□□□ -0.66
LETMD1-238	ENST00000623495	RAPGEF3	O95398	923 aa		10.91	□□□□□ -0.66
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP10B	O94823	1461 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCC2	Q92887	1545 aa		10.9	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	SHROOM2	Q13796	1616 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	MLEC	Q14165	292 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	10.85	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		10.85	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	CD109	Q6YHK3	1445 aa		10.84	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		10.84	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	AFAP1	Q8N556	730 aa		10.84	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
LETMD1-238	ENST00000623495	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
LETMD1-238	ENST00000623495	SAMD9	Q5K651	1589 aa		10.82	□□□□□ -0.68
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		10.82	□□□□□ -0.68
LETMD1-238	ENST00000623495	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LETMD1-238	ENST00000623495	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPOAP1	O95153	1857 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-238	ENST00000623495	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-238	ENST00000623495	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-238	ENST00000623495	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCA8	O94911	1581 aa		10.79	□□□□□ -0.68

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