RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620536.4

ATXN3-252, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 1,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-252ENST00000620536 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.5■■■■■ 4.23
ATXN3-252ENST00000620536 CUL7Q14999 1698 aa41.5■■■■■ 4.23
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ATXN3-252ENST00000620536 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.37■■■■■ 4.21
ATXN3-252ENST00000620536 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.13■■■■■ 4.17
ATXN3-252ENST00000620536 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.02■■■■■ 4.16
ATXN3-252ENST00000620536 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.01■■■■■ 4.16
ATXN3-252ENST00000620536 IQGAP2Q13576 1575 aa41■■■■■ 4.15
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ATXN3-252ENST00000620536 AKNAQ7Z591 1439 aa39.22■■■■□ 3.87
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ATXN3-252ENST00000620536 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39■■■■□ 3.83
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ATXN3-252ENST00000620536 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.96■■■■□ 3.83
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ATXN3-252ENST00000620536 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
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ATXN3-252ENST00000620536 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.92■■■■□ 3.82
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