RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612143.1

AL139384.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AL139384.1, Length 3,047 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL139384.1-201ENST00000612143 MSH5O43196 834 aa24.57■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 P3H3Q8IVL6 736 aa24.57■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 BCANQ96GW7 911 aa24.56■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.55■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.54■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.54■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.53■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.53■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.44■■□□□ 1.5
AL139384.1-201ENST00000612143 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.44■■□□□ 1.5
AL139384.1-201ENST00000612143 ARAP1Q96P48 1450 aa24.43■■□□□ 1.5
AL139384.1-201ENST00000612143 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
AL139384.1-201ENST00000612143 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
AL139384.1-201ENST00000612143 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
AL139384.1-201ENST00000612143 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
AL139384.1-201ENST00000612143 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.37■■□□□ 1.49
AL139384.1-201ENST00000612143 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
AL139384.1-201ENST00000612143 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.33■■□□□ 1.49
AL139384.1-201ENST00000612143 FKBP8Q14318 412 aa24.32■■□□□ 1.48
AL139384.1-201ENST00000612143 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
AL139384.1-201ENST00000612143 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.29■■□□□ 1.48
AL139384.1-201ENST00000612143 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.26■■□□□ 1.47
AL139384.1-201ENST00000612143 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.25■■□□□ 1.47
AL139384.1-201ENST00000612143 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.25■■□□□ 1.47
AL139384.1-201ENST00000612143 ERCC6Q03468 1493 aa24.24■■□□□ 1.47
AL139384.1-201ENST00000612143 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
AL139384.1-201ENST00000612143 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.19■■□□□ 1.46
AL139384.1-201ENST00000612143 ITGAEP38570 1179 aa24.19■■□□□ 1.46
AL139384.1-201ENST00000612143 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.18■■□□□ 1.46
AL139384.1-201ENST00000612143 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.18■■□□□ 1.46
AL139384.1-201ENST00000612143 WDR97A6NE52 1622 aa24.14■■□□□ 1.45
AL139384.1-201ENST00000612143 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
AL139384.1-201ENST00000612143 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.11■■□□□ 1.45
AL139384.1-201ENST00000612143 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.11■■□□□ 1.45
AL139384.1-201ENST00000612143 ARID3CA6NKF2 412 aa24.1■■□□□ 1.45
AL139384.1-201ENST00000612143 FBLN2P98095 1184 aa24.08■■□□□ 1.45
AL139384.1-201ENST00000612143 KCNH8Q96L42 1107 aa24.06■■□□□ 1.44
AL139384.1-201ENST00000612143 NEFLP07196 543 aa24■■□□□ 1.43
AL139384.1-201ENST00000612143 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
AL139384.1-201ENST00000612143 CUL7Q14999 1698 aa24■■□□□ 1.43
AL139384.1-201ENST00000612143 WDR62O43379 1518 aa23.95■■□□□ 1.42
AL139384.1-201ENST00000612143 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
AL139384.1-201ENST00000612143 PBRM1Q86U86 1689 aa23.91■■□□□ 1.42
AL139384.1-201ENST00000612143 IFT140Q96RY7 1462 aa23.9■■□□□ 1.42
AL139384.1-201ENST00000612143 IL27Q8NEV9 243 aa23.89■■□□□ 1.42
AL139384.1-201ENST00000612143 GRIN2BQ13224 1484 aa23.89■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.89■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.88■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.87■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 NBR1Q14596 966 aa23.85■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.83■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
AL139384.1-201ENST00000612143 TIAM1Q13009 1591 aa23.82■■□□□ 1.4
AL139384.1-201ENST00000612143 ADAMTS12P58397 1594 aa23.81■■□□□ 1.4
AL139384.1-201ENST00000612143 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
AL139384.1-201ENST00000612143 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.79■■□□□ 1.4
AL139384.1-201ENST00000612143 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.77■■□□□ 1.4
AL139384.1-201ENST00000612143 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
AL139384.1-201ENST00000612143 SLC24A1O60721 1099 aa23.75■■□□□ 1.39
AL139384.1-201ENST00000612143 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.73■■□□□ 1.39
AL139384.1-201ENST00000612143 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.72■■□□□ 1.39
AL139384.1-201ENST00000612143 FMN1Q68DA7 1419 aa23.7■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 IQGAP2Q13576 1575 aa23.69■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.68■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 SAMD9Q5K651 1589 aa23.68■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 GRIN2AQ12879 1464 aa23.67■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.67■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.67■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
AL139384.1-201ENST00000612143 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.63■■□□□ 1.37
AL139384.1-201ENST00000612143 TRIM52Q96A61 297 aa23.62■■□□□ 1.37
AL139384.1-201ENST00000612143 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
AL139384.1-201ENST00000612143 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.58■■□□□ 1.37
AL139384.1-201ENST00000612143 JPH4Q96JJ6 628 aa23.57■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 CEP170Q5SW79 1584 aa23.56■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.55■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 MAP3K1Q13233 1512 aa23.55■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.55■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 SYNJ2O15056 1496 aa23.55■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 DISP1Q96F81 1524 aa23.55■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.51■■□□□ 1.35
AL139384.1-201ENST00000612143 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.51■■□□□ 1.35
AL139384.1-201ENST00000612143 NCOA2Q15596 1464 aa23.48■■□□□ 1.35
AL139384.1-201ENST00000612143 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.47■■□□□ 1.35
AL139384.1-201ENST00000612143 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.46■■□□□ 1.35
AL139384.1-201ENST00000612143 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
AL139384.1-201ENST00000612143 KIAA0556O60303 1618 aa23.44■■□□□ 1.34
AL139384.1-201ENST00000612143 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.43■■□□□ 1.34
AL139384.1-201ENST00000612143 PTPRKQ15262 1439 aa23.42■■□□□ 1.34
AL139384.1-201ENST00000612143 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms