RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610893.4

LTBP4-232, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP4, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-232ENST00000610893 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.27■■■■□ 3.08
LTBP4-232ENST00000610893 CUL7Q14999 1698 aa34.27■■■■□ 3.08
LTBP4-232ENST00000610893 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.26■■■■□ 3.08
LTBP4-232ENST00000610893 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.24■■■■□ 3.07
LTBP4-232ENST00000610893 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.06■■■■□ 3.04
LTBP4-232ENST00000610893 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.94■■■■□ 3.02
LTBP4-232ENST00000610893 PTPRGP23470 1445 aa33.93■■■■□ 3.02
LTBP4-232ENST00000610893 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.93■■■■□ 3.02
LTBP4-232ENST00000610893 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.87■■■■□ 3.01
LTBP4-232ENST00000610893 IQGAP2Q13576 1575 aa33.87■■■■□ 3.01
LTBP4-232ENST00000610893 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.86■■■■□ 3.01
LTBP4-232ENST00000610893 MAPKBP1O60336 1514 aa33.84■■■■□ 3.01
LTBP4-232ENST00000610893 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.83■■■■□ 3.01
LTBP4-232ENST00000610893 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.82■■■■□ 3
LTBP4-232ENST00000610893 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
LTBP4-232ENST00000610893 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.75■■■□□ 2.99
LTBP4-232ENST00000610893 DISP1Q96F81 1524 aa33.73■■■□□ 2.99
LTBP4-232ENST00000610893 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.71■■■□□ 2.99
LTBP4-232ENST00000610893 ABCC2Q92887 1545 aa33.66■■■□□ 2.98
LTBP4-232ENST00000610893 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.65■■■□□ 2.98
LTBP4-232ENST00000610893 UACAQ9BZF9 1416 aa33.65■■■□□ 2.98
LTBP4-232ENST00000610893 DIP2BQ9P265 1576 aa33.64■■■□□ 2.98
LTBP4-232ENST00000610893 PRXQ9BXM0 1461 aa33.63■■■□□ 2.97
LTBP4-232ENST00000610893 KIAA0556O60303 1618 aa33.54■■■□□ 2.96
LTBP4-232ENST00000610893 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.54■■■□□ 2.96
LTBP4-232ENST00000610893 ASXL2Q76L83 1435 aa33.53■■■□□ 2.96
LTBP4-232ENST00000610893 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.52■■■□□ 2.96
LTBP4-232ENST00000610893 GOLGA3Q08378 1498 aa33.51■■■□□ 2.96
LTBP4-232ENST00000610893 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
LTBP4-232ENST00000610893 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.48■■■□□ 2.95
LTBP4-232ENST00000610893 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.47■■■□□ 2.95
LTBP4-232ENST00000610893 GLI2P10070 1586 aa33.38■■■□□ 2.93
LTBP4-232ENST00000610893 EEA1Q15075 1411 aa33.38■■■□□ 2.93
LTBP4-232ENST00000610893 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
LTBP4-232ENST00000610893 TSPOAP1O95153 1857 aa33.31■■■□□ 2.92
LTBP4-232ENST00000610893 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
LTBP4-232ENST00000610893 KDM6BO15054 1643 aa33.31■■■□□ 2.92
LTBP4-232ENST00000610893 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
LTBP4-232ENST00000610893 ABCA8O94911 1581 aa33.26■■■□□ 2.91
LTBP4-232ENST00000610893 P3H3Q8IVL6 736 aa33.22■■■□□ 2.91
LTBP4-232ENST00000610893 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.22■■■□□ 2.91
LTBP4-232ENST00000610893 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
LTBP4-232ENST00000610893 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.14■■■□□ 2.9
LTBP4-232ENST00000610893 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.14■■■□□ 2.9
LTBP4-232ENST00000610893 KCNH8Q96L42 1107 aa33.13■■■□□ 2.89
LTBP4-232ENST00000610893 SAMD9Q5K651 1589 aa33.09■■■□□ 2.89
LTBP4-232ENST00000610893 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.06■■■□□ 2.88
LTBP4-232ENST00000610893 ATP10BO94823 1461 aa33.05■■■□□ 2.88
LTBP4-232ENST00000610893 CD109Q6YHK3 1445 aa33.04■■■□□ 2.88
LTBP4-232ENST00000610893 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
LTBP4-232ENST00000610893 ARID3CA6NKF2 412 aa33.01■■■□□ 2.87
LTBP4-232ENST00000610893 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.01■■■□□ 2.87
LTBP4-232ENST00000610893 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.99■■■□□ 2.87
LTBP4-232ENST00000610893 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.98■■■□□ 2.87
LTBP4-232ENST00000610893 KIF21BO75037 1637 aa32.98■■■□□ 2.87
LTBP4-232ENST00000610893 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.94■■■□□ 2.86
LTBP4-232ENST00000610893 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
LTBP4-232ENST00000610893 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
LTBP4-232ENST00000610893 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.91■■■□□ 2.86
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LTBP4-232ENST00000610893 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.85■■■□□ 2.85
LTBP4-232ENST00000610893 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
LTBP4-232ENST00000610893 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.79■■■□□ 2.84
LTBP4-232ENST00000610893 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.79■■■□□ 2.84
LTBP4-232ENST00000610893 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.76■■■□□ 2.83
LTBP4-232ENST00000610893 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.75■■■□□ 2.83
LTBP4-232ENST00000610893 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.73■■■□□ 2.83
LTBP4-232ENST00000610893 ADGRL1O94910 1474 aa32.7■■■□□ 2.83
LTBP4-232ENST00000610893 NEO1Q92859 1461 aa32.65■■■□□ 2.82
LTBP4-232ENST00000610893 FMN1Q68DA7 1419 aa32.63■■■□□ 2.81
LTBP4-232ENST00000610893 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.6■■■□□ 2.81
LTBP4-232ENST00000610893 RAPGEF3O95398 923 aa32.56■■■□□ 2.8
LTBP4-232ENST00000610893 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
LTBP4-232ENST00000610893 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
LTBP4-232ENST00000610893 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
LTBP4-232ENST00000610893 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.48■■■□□ 2.79
LTBP4-232ENST00000610893 AKNAQ7Z591 1439 aa32.45■■■□□ 2.79
LTBP4-232ENST00000610893 HECW1Q76N89 1606 aa32.44■■■□□ 2.78
LTBP4-232ENST00000610893 FANCAO15360 1455 aa32.44■■■□□ 2.78
LTBP4-232ENST00000610893 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
LTBP4-232ENST00000610893 PLCH2O75038 1416 aa32.38■■■□□ 2.77
LTBP4-232ENST00000610893 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.37■■■□□ 2.77
LTBP4-232ENST00000610893 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.36■■■□□ 2.77
LTBP4-232ENST00000610893 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.34■■■□□ 2.77
LTBP4-232ENST00000610893 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.31■■■□□ 2.76
LTBP4-232ENST00000610893 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
LTBP4-232ENST00000610893 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
LTBP4-232ENST00000610893 CLIP1P30622 1438 aa32.27■■■□□ 2.76
LTBP4-232ENST00000610893 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.27■■■□□ 2.76
LTBP4-232ENST00000610893 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.25■■■□□ 2.75
LTBP4-232ENST00000610893 RICTORQ6R327 1708 aa32.24■■■□□ 2.75
LTBP4-232ENST00000610893 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.22■■■□□ 2.75
LTBP4-232ENST00000610893 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.2■■■□□ 2.75
LTBP4-232ENST00000610893 KIF14Q15058 1648 aa32.19■■■□□ 2.74
LTBP4-232ENST00000610893 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.19■■■□□ 2.74
LTBP4-232ENST00000610893 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.18■■■□□ 2.74
LTBP4-232ENST00000610893 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.17■■■□□ 2.74
LTBP4-232ENST00000610893 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.17■■■□□ 2.74
LTBP4-232ENST00000610893 PTPRMP28827 1452 aa32.14■■■□□ 2.74
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