RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599794.5

TIMM50-213, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TIMM50, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-213ENST00000599794 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
TIMM50-213ENST00000599794 CUL7Q14999 1698 aa34.79■■■■□ 3.16
TIMM50-213ENST00000599794 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
TIMM50-213ENST00000599794 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.71■■■■□ 3.15
TIMM50-213ENST00000599794 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.5■■■■□ 3.11
TIMM50-213ENST00000599794 IQGAP2Q13576 1575 aa34.39■■■■□ 3.1
TIMM50-213ENST00000599794 PRXQ9BXM0 1461 aa34.34■■■■□ 3.09
TIMM50-213ENST00000599794 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.33■■■■□ 3.09
TIMM50-213ENST00000599794 DISP1Q96F81 1524 aa34.32■■■■□ 3.08
TIMM50-213ENST00000599794 PTPRGP23470 1445 aa34.3■■■■□ 3.08
TIMM50-213ENST00000599794 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
TIMM50-213ENST00000599794 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.27■■■■□ 3.08
TIMM50-213ENST00000599794 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.26■■■■□ 3.07
TIMM50-213ENST00000599794 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.25■■■■□ 3.07
TIMM50-213ENST00000599794 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.21■■■■□ 3.07
TIMM50-213ENST00000599794 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.16■■■■□ 3.06
TIMM50-213ENST00000599794 MAPKBP1O60336 1514 aa34.13■■■■□ 3.05
TIMM50-213ENST00000599794 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.13■■■■□ 3.05
TIMM50-213ENST00000599794 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.11■■■■□ 3.05
TIMM50-213ENST00000599794 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.09■■■■□ 3.05
TIMM50-213ENST00000599794 KIAA0556O60303 1618 aa34.09■■■■□ 3.05
TIMM50-213ENST00000599794 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.07■■■■□ 3.05
TIMM50-213ENST00000599794 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.06■■■■□ 3.04
TIMM50-213ENST00000599794 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
TIMM50-213ENST00000599794 UACAQ9BZF9 1416 aa34.04■■■■□ 3.04
TIMM50-213ENST00000599794 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.03■■■■□ 3.04
TIMM50-213ENST00000599794 ABCC2Q92887 1545 aa34.03■■■■□ 3.04
TIMM50-213ENST00000599794 EEA1Q15075 1411 aa34■■■■□ 3.03
TIMM50-213ENST00000599794 DIP2BQ9P265 1576 aa33.98■■■■□ 3.03
TIMM50-213ENST00000599794 GOLGA3Q08378 1498 aa33.91■■■■□ 3.02
TIMM50-213ENST00000599794 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.9■■■■□ 3.02
TIMM50-213ENST00000599794 ASXL2Q76L83 1435 aa33.9■■■■□ 3.02
TIMM50-213ENST00000599794 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.89■■■■□ 3.02
TIMM50-213ENST00000599794 P3H3Q8IVL6 736 aa33.87■■■■□ 3.01
TIMM50-213ENST00000599794 ABCA8O94911 1581 aa33.81■■■■□ 3
TIMM50-213ENST00000599794 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
TIMM50-213ENST00000599794 SAMD9Q5K651 1589 aa33.74■■■□□ 2.99
TIMM50-213ENST00000599794 KIF21BO75037 1637 aa33.73■■■□□ 2.99
TIMM50-213ENST00000599794 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
TIMM50-213ENST00000599794 TSPOAP1O95153 1857 aa33.7■■■□□ 2.99
TIMM50-213ENST00000599794 GLI2P10070 1586 aa33.7■■■□□ 2.99
TIMM50-213ENST00000599794 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
TIMM50-213ENST00000599794 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.69■■■□□ 2.98
TIMM50-213ENST00000599794 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
TIMM50-213ENST00000599794 ARID3CA6NKF2 412 aa33.62■■■□□ 2.97
TIMM50-213ENST00000599794 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.6■■■□□ 2.97
TIMM50-213ENST00000599794 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.59■■■□□ 2.97
TIMM50-213ENST00000599794 ATP10BO94823 1461 aa33.58■■■□□ 2.97
TIMM50-213ENST00000599794 KCNH8Q96L42 1107 aa33.53■■■□□ 2.96
TIMM50-213ENST00000599794 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.53■■■□□ 2.96
TIMM50-213ENST00000599794 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
TIMM50-213ENST00000599794 KDM6BO15054 1643 aa33.49■■■□□ 2.95
TIMM50-213ENST00000599794 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
TIMM50-213ENST00000599794 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.46■■■□□ 2.95
TIMM50-213ENST00000599794 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
TIMM50-213ENST00000599794 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.41■■■□□ 2.94
TIMM50-213ENST00000599794 CD109Q6YHK3 1445 aa33.36■■■□□ 2.93
TIMM50-213ENST00000599794 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.35■■■□□ 2.93
TIMM50-213ENST00000599794 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.32■■■□□ 2.92
TIMM50-213ENST00000599794 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.31■■■□□ 2.92
TIMM50-213ENST00000599794 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.29■■■□□ 2.92
TIMM50-213ENST00000599794 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
TIMM50-213ENST00000599794 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
TIMM50-213ENST00000599794 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
TIMM50-213ENST00000599794 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.2■■■□□ 2.9
TIMM50-213ENST00000599794 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.17■■■□□ 2.9
TIMM50-213ENST00000599794 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
TIMM50-213ENST00000599794 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.16■■■□□ 2.9
TIMM50-213ENST00000599794 FMN1Q68DA7 1419 aa33.13■■■□□ 2.89
TIMM50-213ENST00000599794 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
TIMM50-213ENST00000599794 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.04■■■□□ 2.88
TIMM50-213ENST00000599794 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.02■■■□□ 2.88
TIMM50-213ENST00000599794 HECW1Q76N89 1606 aa32.99■■■□□ 2.87
TIMM50-213ENST00000599794 RAPGEF3O95398 923 aa32.97■■■□□ 2.87
TIMM50-213ENST00000599794 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.97■■■□□ 2.87
TIMM50-213ENST00000599794 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.96■■■□□ 2.87
TIMM50-213ENST00000599794 NEO1Q92859 1461 aa32.95■■■□□ 2.87
TIMM50-213ENST00000599794 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.95■■■□□ 2.86
TIMM50-213ENST00000599794 CLIP1P30622 1438 aa32.94■■■□□ 2.86
TIMM50-213ENST00000599794 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.91■■■□□ 2.86
TIMM50-213ENST00000599794 ADGRL1O94910 1474 aa32.88■■■□□ 2.85
TIMM50-213ENST00000599794 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
TIMM50-213ENST00000599794 AKNAQ7Z591 1439 aa32.85■■■□□ 2.85
TIMM50-213ENST00000599794 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.85■■■□□ 2.85
TIMM50-213ENST00000599794 FANCAO15360 1455 aa32.84■■■□□ 2.85
TIMM50-213ENST00000599794 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
TIMM50-213ENST00000599794 KIF14Q15058 1648 aa32.83■■■□□ 2.85
TIMM50-213ENST00000599794 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
TIMM50-213ENST00000599794 PLCH2O75038 1416 aa32.82■■■□□ 2.84
TIMM50-213ENST00000599794 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.79■■■□□ 2.84
TIMM50-213ENST00000599794 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
TIMM50-213ENST00000599794 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.74■■■□□ 2.83
TIMM50-213ENST00000599794 RICTORQ6R327 1708 aa32.71■■■□□ 2.83
TIMM50-213ENST00000599794 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.71■■■□□ 2.83
TIMM50-213ENST00000599794 CEP162Q5TB80 1403 aa32.69■■■□□ 2.82
TIMM50-213ENST00000599794 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.67■■■□□ 2.82
TIMM50-213ENST00000599794 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.67■■■□□ 2.82
TIMM50-213ENST00000599794 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.66■■■□□ 2.82
TIMM50-213ENST00000599794 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.64■■■□□ 2.82
TIMM50-213ENST00000599794 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms