RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597330.1

LETM1P2-201, Transcript of leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1 pseudogene 2, humanhuman

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Gene LETM1P2, Length 2,178 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1P2-201ENST00000597330 CUX2O14529 1486 aa26.6■■□□□ 1.85
LETM1P2-201ENST00000597330 KIF27Q86VH2 1401 aa26.59■■□□□ 1.85
LETM1P2-201ENST00000597330 BCANQ96GW7 911 aa26.58■■□□□ 1.85
LETM1P2-201ENST00000597330 FKBP8Q14318 412 aa26.56■■□□□ 1.84
LETM1P2-201ENST00000597330 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.55■■□□□ 1.84
LETM1P2-201ENST00000597330 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.53■■□□□ 1.84
LETM1P2-201ENST00000597330 APLP2Q06481 763 aa26.53■■□□□ 1.84
LETM1P2-201ENST00000597330 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
LETM1P2-201ENST00000597330 MSH5O43196 834 aa26.5■■□□□ 1.83
LETM1P2-201ENST00000597330 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
LETM1P2-201ENST00000597330 WDR97A6NE52 1622 aa26.48■■□□□ 1.83
LETM1P2-201ENST00000597330 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.47■■□□□ 1.83
LETM1P2-201ENST00000597330 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.43■■□□□ 1.82
LETM1P2-201ENST00000597330 IFT140Q96RY7 1462 aa26.43■■□□□ 1.82
LETM1P2-201ENST00000597330 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
LETM1P2-201ENST00000597330 NEFLP07196 543 aa26.41■■□□□ 1.82
LETM1P2-201ENST00000597330 IGF1RP08069 1367 aa26.39■■□□□ 1.82
LETM1P2-201ENST00000597330 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.39■■□□□ 1.82
LETM1P2-201ENST00000597330 KCNH8Q96L42 1107 aa26.36■■□□□ 1.81
LETM1P2-201ENST00000597330 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.36■■□□□ 1.81
LETM1P2-201ENST00000597330 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.34■■□□□ 1.81
LETM1P2-201ENST00000597330 PRXQ9BXM0 1461 aa26.32■■□□□ 1.8
LETM1P2-201ENST00000597330 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
LETM1P2-201ENST00000597330 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
LETM1P2-201ENST00000597330 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.26■■□□□ 1.79
LETM1P2-201ENST00000597330 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.24■■□□□ 1.79
LETM1P2-201ENST00000597330 PBRM1Q86U86 1689 aa26.21■■□□□ 1.79
LETM1P2-201ENST00000597330 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
LETM1P2-201ENST00000597330 ITGAEP38570 1179 aa26.2■■□□□ 1.78
LETM1P2-201ENST00000597330 CUL7Q14999 1698 aa26.19■■□□□ 1.78
LETM1P2-201ENST00000597330 GRIN2BQ13224 1484 aa26.18■■□□□ 1.78
LETM1P2-201ENST00000597330 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
LETM1P2-201ENST00000597330 ARAP1Q96P48 1450 aa26.12■■□□□ 1.77
LETM1P2-201ENST00000597330 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
LETM1P2-201ENST00000597330 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
LETM1P2-201ENST00000597330 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
LETM1P2-201ENST00000597330 CCER2I3L3R5 266 aa26.07■■□□□ 1.76
LETM1P2-201ENST00000597330 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.05■■□□□ 1.76
LETM1P2-201ENST00000597330 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.05■■□□□ 1.76
LETM1P2-201ENST00000597330 ADAMTS12P58397 1594 aa26.04■■□□□ 1.76
LETM1P2-201ENST00000597330 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
LETM1P2-201ENST00000597330 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26■■□□□ 1.75
LETM1P2-201ENST00000597330 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
LETM1P2-201ENST00000597330 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
LETM1P2-201ENST00000597330 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
LETM1P2-201ENST00000597330 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
LETM1P2-201ENST00000597330 MAPKBP1O60336 1514 aa25.94■■□□□ 1.74
LETM1P2-201ENST00000597330 TRIM52Q96A61 297 aa25.94■■□□□ 1.74
LETM1P2-201ENST00000597330 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.92■■□□□ 1.74
LETM1P2-201ENST00000597330 SYNJ2O15056 1496 aa25.89■■□□□ 1.73
LETM1P2-201ENST00000597330 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
LETM1P2-201ENST00000597330 FBLN2P98095 1184 aa25.87■■□□□ 1.73
LETM1P2-201ENST00000597330 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.87■■□□□ 1.73
LETM1P2-201ENST00000597330 GRIN2AQ12879 1464 aa25.85■■□□□ 1.73
LETM1P2-201ENST00000597330 ANP32CO43423 234 aa25.84■■□□□ 1.73
LETM1P2-201ENST00000597330 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.81■■□□□ 1.72
LETM1P2-201ENST00000597330 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
LETM1P2-201ENST00000597330 MAP3K1Q13233 1512 aa25.75■■□□□ 1.71
LETM1P2-201ENST00000597330 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.74■■□□□ 1.71
LETM1P2-201ENST00000597330 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.72■■□□□ 1.71
LETM1P2-201ENST00000597330 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
LETM1P2-201ENST00000597330 IQGAP2Q13576 1575 aa25.7■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 CEP170Q5SW79 1584 aa25.7■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 CHD1O14646 1710 aa25.69■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.69■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.68■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 NUP160Q12769 1436 aa25.67■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 TIAM1Q13009 1591 aa25.66■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.66■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 P3H3Q8IVL6 736 aa25.65■■□□□ 1.7
LETM1P2-201ENST00000597330 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
LETM1P2-201ENST00000597330 NBR1Q14596 966 aa25.63■■□□□ 1.69
LETM1P2-201ENST00000597330 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.63■■□□□ 1.69
LETM1P2-201ENST00000597330 SAMD9Q5K651 1589 aa25.58■■□□□ 1.69
LETM1P2-201ENST00000597330 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
LETM1P2-201ENST00000597330 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
LETM1P2-201ENST00000597330 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.56■■□□□ 1.68
LETM1P2-201ENST00000597330 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.56■■□□□ 1.68
LETM1P2-201ENST00000597330 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.56■■□□□ 1.68
LETM1P2-201ENST00000597330 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.56■■□□□ 1.68
LETM1P2-201ENST00000597330 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
LETM1P2-201ENST00000597330 JPH4Q96JJ6 628 aa25.5■■□□□ 1.67
LETM1P2-201ENST00000597330 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.5■■□□□ 1.67
LETM1P2-201ENST00000597330 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.48■■□□□ 1.67
LETM1P2-201ENST00000597330 IL27Q8NEV9 243 aa25.46■■□□□ 1.67
LETM1P2-201ENST00000597330 DISP1Q96F81 1524 aa25.46■■□□□ 1.67
LETM1P2-201ENST00000597330 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.44■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.44■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 KIAA0556O60303 1618 aa25.44■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 FMN1Q68DA7 1419 aa25.42■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.41■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.39■■□□□ 1.66
LETM1P2-201ENST00000597330 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
LETM1P2-201ENST00000597330 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.38■■□□□ 1.65
LETM1P2-201ENST00000597330 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.38■■□□□ 1.65
LETM1P2-201ENST00000597330 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
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