RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596378.1

SRRM1-222, Transcript of serine and arginine repetitive matrix 1, human

TSL 1 (best)

Gene SRRM1, Length 2,314 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM1-222	ENST00000596378	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.77	■■■■□ 3
SRRM1-222	ENST00000596378	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.76	■■■■□ 3
SRRM1-222	ENST00000596378	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.76	■■■□□ 2.99
SRRM1-222	ENST00000596378	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
SRRM1-222	ENST00000596378	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		33.75	■■■□□ 2.99
SRRM1-222	ENST00000596378	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		33.74	■■■□□ 2.99
SRRM1-222	ENST00000596378	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
SRRM1-222	ENST00000596378	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.72	■■■□□ 2.99
SRRM1-222	ENST00000596378	ITGAE	P38570	1179 aa		33.72	■■■□□ 2.99
SRRM1-222	ENST00000596378	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
SRRM1-222	ENST00000596378	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		33.68	■■■□□ 2.98
SRRM1-222	ENST00000596378	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.67	■■■□□ 2.98
SRRM1-222	ENST00000596378	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.66	■■■□□ 2.98
SRRM1-222	ENST00000596378	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		33.61	■■■□□ 2.97
SRRM1-222	ENST00000596378	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
SRRM1-222	ENST00000596378	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.56	■■■□□ 2.96
SRRM1-222	ENST00000596378	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.54	■■■□□ 2.96
SRRM1-222	ENST00000596378	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		33.53	■■■□□ 2.96
SRRM1-222	ENST00000596378	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	33.48	■■■□□ 2.95	1e-15	■■■■□ 23.2
SRRM1-222	ENST00000596378	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.94
SRRM1-222	ENST00000596378	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SRRM1-222	ENST00000596378	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SRRM1-222	ENST00000596378	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SRRM1-222	ENST00000596378	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SRRM1-222	ENST00000596378	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
SRRM1-222	ENST00000596378	PBRM1	Q86U86	1689 aa		33.4	■■■□□ 2.94
SRRM1-222	ENST00000596378	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SRRM1-222	ENST00000596378	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SRRM1-222	ENST00000596378	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SRRM1-222	ENST00000596378	NEUROD1	Q13562	356 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SRRM1-222	ENST00000596378	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
SRRM1-222	ENST00000596378	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SRRM1-222	ENST00000596378	GRIN2B	Q13224	1484 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SRRM1-222	ENST00000596378	ADAMTS12	P58397	1594 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SRRM1-222	ENST00000596378	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SRRM1-222	ENST00000596378	MIER1	Q8N108	512 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SRRM1-222	ENST00000596378	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
SRRM1-222	ENST00000596378	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SRRM1-222	ENST00000596378	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.15	■■■□□ 2.9
SRRM1-222	ENST00000596378	WDR62	O43379	1518 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SRRM1-222	ENST00000596378	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
SRRM1-222	ENST00000596378	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.11	■■■□□ 2.89
SRRM1-222	ENST00000596378	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
SRRM1-222	ENST00000596378	IFT140	Q96RY7	1462 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SRRM1-222	ENST00000596378	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SRRM1-222	ENST00000596378	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
SRRM1-222	ENST00000596378	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SRRM1-222	ENST00000596378	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
SRRM1-222	ENST00000596378	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SRRM1-222	ENST00000596378	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SRRM1-222	ENST00000596378	PTPRK	Q15262	1439 aa		33	■■■□□ 2.87
SRRM1-222	ENST00000596378	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33	■■■□□ 2.87
SRRM1-222	ENST00000596378	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SRRM1-222	ENST00000596378	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SRRM1-222	ENST00000596378	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SRRM1-222	ENST00000596378	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
SRRM1-222	ENST00000596378	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.95	■■■□□ 2.86
SRRM1-222	ENST00000596378	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SRRM1-222	ENST00000596378	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
SRRM1-222	ENST00000596378	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
SRRM1-222	ENST00000596378	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SRRM1-222	ENST00000596378	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SRRM1-222	ENST00000596378	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SRRM1-222	ENST00000596378	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SRRM1-222	ENST00000596378	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SRRM1-222	ENST00000596378	GRIN2A	Q12879	1464 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SRRM1-222	ENST00000596378	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SRRM1-222	ENST00000596378	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SRRM1-222	ENST00000596378	NAIP	Q13075	1403 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SRRM1-222	ENST00000596378	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
SRRM1-222	ENST00000596378	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SRRM1-222	ENST00000596378	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SRRM1-222	ENST00000596378	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SRRM1-222	ENST00000596378	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
SRRM1-222	ENST00000596378	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
SRRM1-222	ENST00000596378	CEP170	Q5SW79	1584 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SRRM1-222	ENST00000596378	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
SRRM1-222	ENST00000596378	FBLN2	P98095	1184 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SRRM1-222	ENST00000596378	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SRRM1-222	ENST00000596378	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SRRM1-222	ENST00000596378	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SRRM1-222	ENST00000596378	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
SRRM1-222	ENST00000596378	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SRRM1-222	ENST00000596378	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SRRM1-222	ENST00000596378	KDM6B	O15054	1643 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SRRM1-222	ENST00000596378	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SRRM1-222	ENST00000596378	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
SRRM1-222	ENST00000596378	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SRRM1-222	ENST00000596378	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
SRRM1-222	ENST00000596378	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SRRM1-222	ENST00000596378	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SRRM1-222	ENST00000596378	NUP160	Q12769	1436 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SRRM1-222	ENST00000596378	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
SRRM1-222	ENST00000596378	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.78
SRRM1-222	ENST00000596378	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
SRRM1-222	ENST00000596378	JPH4	Q96JJ6	628 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SRRM1-222	ENST00000596378	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
SRRM1-222	ENST00000596378	DAPK1	P53355	1430 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SRRM1-222	ENST00000596378	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
SRRM1-222	ENST00000596378	ABCC5	O15440	1437 aa		32.38	■■■□□ 2.77

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