RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.01■■■□□ 2.72
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.91■■■□□ 2.7
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.72■■■□□ 2.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.72■■■□□ 2.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.72■■■□□ 2.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DISP1Q96F81 1524 aa31.69■■■□□ 2.66
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.52■■■□□ 2.64
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.52■■■□□ 2.64
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CEP162Q5TB80 1403 aa31.51■■■□□ 2.63
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.49■■■□□ 2.63
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.18■■■□□ 2.58
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARID3CA6NKF2 412 aa31.12■■■□□ 2.57
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.07■■■□□ 2.56
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.04■■■□□ 2.56
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HECW1Q76N89 1606 aa31.04■■■□□ 2.56
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.02■■■□□ 2.56
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ATP10BO94823 1461 aa31.02■■■□□ 2.56
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31■■■□□ 2.55
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.79■■■□□ 2.52
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCNH8Q96L42 1107 aa30.75■■■□□ 2.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TIAM1Q13009 1591 aa30.74■■■□□ 2.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.74■■■□□ 2.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 APLP2Q06481 763 aa30.71■■■□□ 2.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.69■■■□□ 2.5
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.64■■■□□ 2.5
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIF14Q15058 1648 aa30.6■■■□□ 2.49
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.49■■■□□ 2.47
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.38■■■□□ 2.45
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.36■■■□□ 2.45
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLCH2O75038 1416 aa30.35■■■□□ 2.45
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.33■■■□□ 2.45
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.26■■■□□ 2.43
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