RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.47■■■■■ 5.03
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.7■■■■□ 3.79
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NACADO15069 1562 aa38.42■■■■□ 3.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.41■■■■□ 3.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.34■■■■□ 3.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.34■■■■□ 3.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.58■■■■□ 3.61
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SCRIBQ14160 1630 aa37.57■■■■□ 3.6
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.24■■■■□ 3.55
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.22■■■■□ 3.55
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.18■■■■□ 3.54
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.2■■■■□ 3.39
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.97■■■■□ 3.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SMARCA4P51532 1647 aa35.94■■■■□ 3.34
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.91■■■■□ 3.34
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.87■■■■□ 3.33
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.61■■■■□ 3.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SMARCA2P51531 1590 aa35.55■■■■□ 3.28
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.54■■■■□ 3.28
SMC5-AS1-201ENST00000594708 WIZO95785 1651 aa35.53■■■■□ 3.28
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NCAPD3P42695 1498 aa35.47■■■■□ 3.27
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HMGXB3Q12766 1538 aa35.33■■■■□ 3.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.74■■■■□ 3.15
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NESP48681 1621 aa34.54■■■■□ 3.12
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.49■■■■□ 3.11
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.44■■■■□ 3.1
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CFTRP13569 1480 aa34.4■■■■□ 3.1
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.19■■■■□ 3.06
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRDM2Q13029 1718 aa34.18■■■■□ 3.06
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ERCC6Q03468 1493 aa34.13■■■■□ 3.05
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.13■■■■□ 3.05
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.11■■■■□ 3.05
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.99■■■■□ 3.03
SMC5-AS1-201ENST00000594708 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.81■■■■□ 3
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 ABCC8Q09428 1581 aa33.69■■■□□ 2.98
SMC5-AS1-201ENST00000594708 WDR62O43379 1518 aa33.69■■■□□ 2.98
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TOPBP1Q92547 1522 aa33.63■■■□□ 2.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.61■■■□□ 2.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CUX1P39880 1505 aa33.6■■■□□ 2.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.58■■■□□ 2.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CUX2O14529 1486 aa33.5■■■□□ 2.95
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SYNJ1O43426 1573 aa33.5■■■□□ 2.95
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TOP2BQ02880 1626 aa33.44■■■□□ 2.94
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.43■■■□□ 2.94
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.39■■■□□ 2.94
SMC5-AS1-201ENST00000594708 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.27■■■□□ 2.92
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SOGA1O94964 1423 aa33.25■■■□□ 2.91
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IFT140Q96RY7 1462 aa33.24■■■□□ 2.91
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRIM41Q8WV44 630 aa33.21■■■□□ 2.91
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.21■■■□□ 2.91
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 WDR97A6NE52 1622 aa33.07■■■□□ 2.88
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.07■■■□□ 2.88
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33■■■□□ 2.87
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.89■■■□□ 2.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.88■■■□□ 2.85
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIF27Q86VH2 1401 aa32.82■■■□□ 2.84
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.79■■■□□ 2.84
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PBRM1Q86U86 1689 aa32.78■■■□□ 2.84
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GRIN2BQ13224 1484 aa32.77■■■□□ 2.84
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.69■■■□□ 2.82
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.66■■■□□ 2.82
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IGF1RP08069 1367 aa32.64■■■□□ 2.82
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.61■■■□□ 2.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADAMTS12P58397 1594 aa32.54■■■□□ 2.8
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EEA1Q15075 1411 aa32.52■■■□□ 2.8
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FBLN2P98095 1184 aa32.51■■■□□ 2.8
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 SYNJ2O15056 1496 aa32.49■■■□□ 2.79
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.48■■■□□ 2.79
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CUL7Q14999 1698 aa32.48■■■□□ 2.79
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHD1O14646 1710 aa32.48■■■□□ 2.79
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.46■■■□□ 2.79
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GRIN2AQ12879 1464 aa32.37■■■□□ 2.77
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRXQ9BXM0 1461 aa32.34■■■□□ 2.77
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.31■■■□□ 2.76
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OSCARQ8IYS5 282 aa32.28■■■□□ 2.76
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CEP170Q5SW79 1584 aa32.21■■■□□ 2.75
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NUP160Q12769 1436 aa32.19■■■□□ 2.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.19■■■□□ 2.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIF21BO75037 1637 aa32.18■■■□□ 2.74
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.09■■■□□ 2.73
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GOLGA3Q08378 1498 aa32.05■■■□□ 2.72
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