RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592446.1

CNP-211, Transcript of 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase, humanhuman

TSL 4

Gene CNP, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNP-211ENST00000592446 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
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CNP-211ENST00000592446 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.19■■■■■ 4.02
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CNP-211ENST00000592446 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.79■■■■□ 3.96
CNP-211ENST00000592446 PTPRGP23470 1445 aa39.78■■■■□ 3.96
CNP-211ENST00000592446 IQGAP2Q13576 1575 aa39.77■■■■□ 3.96
CNP-211ENST00000592446 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.77■■■■□ 3.96
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CNP-211ENST00000592446 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
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CNP-211ENST00000592446 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.61■■■■□ 3.93
CNP-211ENST00000592446 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.61■■■■□ 3.93
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CNP-211ENST00000592446 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.48■■■■□ 3.91
CNP-211ENST00000592446 UACAQ9BZF9 1416 aa39.46■■■■□ 3.91
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CNP-211ENST00000592446 ABCC2Q92887 1545 aa39.41■■■■□ 3.9
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CNP-211ENST00000592446 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.4■■■■□ 3.9
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CNP-211ENST00000592446 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
CNP-211ENST00000592446 GOLGA3Q08378 1498 aa39.35■■■■□ 3.89
CNP-211ENST00000592446 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.3■■■■□ 3.88
CNP-211ENST00000592446 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.27■■■■□ 3.88
CNP-211ENST00000592446 DIP2BQ9P265 1576 aa39.26■■■■□ 3.88
CNP-211ENST00000592446 ASXL2Q76L83 1435 aa39.25■■■■□ 3.87
CNP-211ENST00000592446 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.22■■■■□ 3.87
CNP-211ENST00000592446 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.22■■■■□ 3.87
CNP-211ENST00000592446 P3H3Q8IVL6 736 aa39.2■■■■□ 3.87
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CNP-211ENST00000592446 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
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CNP-211ENST00000592446 KIF21BO75037 1637 aa38.96■■■■□ 3.83
CNP-211ENST00000592446 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.94■■■■□ 3.82
CNP-211ENST00000592446 SAMD9Q5K651 1589 aa38.94■■■■□ 3.82
CNP-211ENST00000592446 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.92■■■■□ 3.82
CNP-211ENST00000592446 ARID3CA6NKF2 412 aa38.91■■■■□ 3.82
CNP-211ENST00000592446 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
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CNP-211ENST00000592446 ATP10BO94823 1461 aa38.84■■■■□ 3.81
CNP-211ENST00000592446 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.83■■■■□ 3.81
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CNP-211ENST00000592446 KDM6BO15054 1643 aa38.78■■■■□ 3.8
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CNP-211ENST00000592446 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
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CNP-211ENST00000592446 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.69■■■■□ 3.78
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CNP-211ENST00000592446 CD109Q6YHK3 1445 aa38.69■■■■□ 3.78
CNP-211ENST00000592446 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.67■■■■□ 3.78
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CNP-211ENST00000592446 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.64■■■■□ 3.78
CNP-211ENST00000592446 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.58■■■■□ 3.77
CNP-211ENST00000592446 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.52■■■■□ 3.76
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CNP-211ENST00000592446 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.47■■■■□ 3.75
CNP-211ENST00000592446 FMN1Q68DA7 1419 aa38.44■■■■□ 3.74
CNP-211ENST00000592446 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
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CNP-211ENST00000592446 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.31■■■■□ 3.72
CNP-211ENST00000592446 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
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CNP-211ENST00000592446 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.83■■■■□ 3.65
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CNP-211ENST00000592446 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.71■■■■□ 3.63
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