RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591579.5

NEDD4L-232, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 144 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-232ENST00000591579 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.12■■□□□ 1.29
NEDD4L-232ENST00000591579 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
NEDD4L-232ENST00000591579 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.1■■□□□ 1.29
NEDD4L-232ENST00000591579 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.07■■□□□ 1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 MAPKBP1O60336 1514 aa23.06■■□□□ 1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.04■■□□□ 1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.03■■□□□ 1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 KIF27Q86VH2 1401 aa23.03■■□□□ 1.28
NEDD4L-232ENST00000591579 IGF1RP08069 1367 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD4L-232ENST00000591579 DIP2BQ9P265 1576 aa23.01■■□□□ 1.27
NEDD4L-232ENST00000591579 CUL7Q14999 1698 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD4L-232ENST00000591579 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 PTPRGP23470 1445 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 KDM6BO15054 1643 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD4L-232ENST00000591579 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.88■■□□□ 1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD4L-232ENST00000591579 ABCC2Q92887 1545 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-232ENST00000591579 TSPOAP1O95153 1857 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD4L-232ENST00000591579 IQGAP2Q13576 1575 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-232ENST00000591579 ASXL2Q76L83 1435 aa22.76■■□□□ 1.23
NEDD4L-232ENST00000591579 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.76■■□□□ 1.23
NEDD4L-232ENST00000591579 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD4L-232ENST00000591579 UACAQ9BZF9 1416 aa22.71■■□□□ 1.23
NEDD4L-232ENST00000591579 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.71■■□□□ 1.23
NEDD4L-232ENST00000591579 DISP1Q96F81 1524 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD4L-232ENST00000591579 GLI2P10070 1586 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD4L-232ENST00000591579 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD4L-232ENST00000591579 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NEDD4L-232ENST00000591579 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD4L-232ENST00000591579 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NEDD4L-232ENST00000591579 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD4L-232ENST00000591579 KIAA0556O60303 1618 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD4L-232ENST00000591579 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NEDD4L-232ENST00000591579 ADGRL1O94910 1474 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD4L-232ENST00000591579 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD4L-232ENST00000591579 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NEDD4L-232ENST00000591579 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD4L-232ENST00000591579 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.5■■□□□ 1.19
NEDD4L-232ENST00000591579 GOLGA3Q08378 1498 aa22.44■■□□□ 1.18
NEDD4L-232ENST00000591579 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.42■■□□□ 1.18
NEDD4L-232ENST00000591579 KCNH8Q96L42 1107 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD4L-232ENST00000591579 CD109Q6YHK3 1445 aa22.39■■□□□ 1.17
NEDD4L-232ENST00000591579 ABCA8O94911 1581 aa22.38■■□□□ 1.17
NEDD4L-232ENST00000591579 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NEDD4L-232ENST00000591579 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.35■■□□□ 1.17
NEDD4L-232ENST00000591579 PRXQ9BXM0 1461 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD4L-232ENST00000591579 ARID3CA6NKF2 412 aa22.33■■□□□ 1.17
NEDD4L-232ENST00000591579 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.33■■□□□ 1.16
NEDD4L-232ENST00000591579 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.32■■□□□ 1.16
NEDD4L-232ENST00000591579 P3H3Q8IVL6 736 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD4L-232ENST00000591579 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NEDD4L-232ENST00000591579 ATP10BO94823 1461 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD4L-232ENST00000591579 KIF21BO75037 1637 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD4L-232ENST00000591579 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD4L-232ENST00000591579 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NEDD4L-232ENST00000591579 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NEDD4L-232ENST00000591579 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD4L-232ENST00000591579 SAMD9Q5K651 1589 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD4L-232ENST00000591579 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD4L-232ENST00000591579 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NEDD4L-232ENST00000591579 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD4L-232ENST00000591579 RAPGEF3O95398 923 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD4L-232ENST00000591579 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD4L-232ENST00000591579 NEO1Q92859 1461 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD4L-232ENST00000591579 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NEDD4L-232ENST00000591579 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD4L-232ENST00000591579 PTPRMP28827 1452 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD4L-232ENST00000591579 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NEDD4L-232ENST00000591579 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22■■□□□ 1.11
NEDD4L-232ENST00000591579 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.98■■□□□ 1.11
NEDD4L-232ENST00000591579 EEA1Q15075 1411 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD4L-232ENST00000591579 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD4L-232ENST00000591579 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD4L-232ENST00000591579 MADDQ8WXG6 1647 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD4L-232ENST00000591579 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.92■■□□□ 1.1
NEDD4L-232ENST00000591579 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
NEDD4L-232ENST00000591579 FANCAO15360 1455 aa21.9■■□□□ 1.1
NEDD4L-232ENST00000591579 AKNAQ7Z591 1439 aa21.89■■□□□ 1.1
NEDD4L-232ENST00000591579 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
NEDD4L-232ENST00000591579 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD4L-232ENST00000591579 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
NEDD4L-232ENST00000591579 FBXO41Q8TF61 875 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD4L-232ENST00000591579 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD4L-232ENST00000591579 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.86■■□□□ 1.09
NEDD4L-232ENST00000591579 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.85■■□□□ 1.09
NEDD4L-232ENST00000591579 RICTORQ6R327 1708 aa21.84■■□□□ 1.09
NEDD4L-232ENST00000591579 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.84■■□□□ 1.09
NEDD4L-232ENST00000591579 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
NEDD4L-232ENST00000591579 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
NEDD4L-232ENST00000591579 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.79■■□□□ 1.08
NEDD4L-232ENST00000591579 MLECQ14165 292 aa21.76■■□□□ 1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 HSPA2P54652 639 aa21.75■■□□□ 1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.74■■□□□ 1.07
NEDD4L-232ENST00000591579 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.74■■□□□ 1.07
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